Protein–RNA interactions for Protein: P40080

VFA1, VPS4-associated protein 1, yeastyeast

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Length 203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1P40080 SNQ2YDR011W 4506 nt2.89□□□□□ -1.95
VFA1P40080 SPB1YCL054W 2526 nt2.88□□□□□ -1.95
VFA1P40080 NPR3YHL023C 3441 nt2.88□□□□□ -1.95
VFA1P40080 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt2.88□□□□□ -1.95
VFA1P40080 COX14YML129C 213 nt2.88□□□□□ -1.95
VFA1P40080 NDD1YOR372C 1665 nt2.88□□□□□ -1.95
VFA1P40080 NDT80YHR124W 1884 nt2.88□□□□□ -1.95
VFA1P40080 MOT1YPL082C 5604 nt2.88□□□□□ -1.95
VFA1P40080 DAS1YJL149W 1992 nt2.87□□□□□ -1.95
VFA1P40080 ADK1YDR226W 669 nt2.87□□□□□ -1.95
VFA1P40080 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt2.87□□□□□ -1.95
VFA1P40080 YIL054WYIL054W 318 nt2.87□□□□□ -1.95
VFA1P40080 YAR068WYAR068W 486 nt2.87□□□□□ -1.95
VFA1P40080 ERP4YOR016C 624 nt2.87□□□□□ -1.95
VFA1P40080 snR13snR13 124 nt2.87□□□□□ -1.95
VFA1P40080 SEC26YDR238C 2922 nt2.87□□□□□ -1.95
VFA1P40080 SRO77YBL106C 3033 nt2.87□□□□□ -1.95
VFA1P40080 PES4YFR023W 1836 nt2.86□□□□□ -1.95
VFA1P40080 YIL166CYIL166C 1629 nt2.86□□□□□ -1.95
VFA1P40080 SKP2YNL311C 2292 nt2.86□□□□□ -1.95
VFA1P40080 TRM2YKR056W 1920 nt2.86□□□□□ -1.95
VFA1P40080 JIP5YPR169W 1479 nt2.86□□□□□ -1.95
VFA1P40080 ECM5YMR176W 4236 nt2.86□□□□□ -1.95
VFA1P40080 RTR1YER139C 681 nt2.86□□□□□ -1.95
VFA1P40080 YGR025WYGR025W 303 nt2.86□□□□□ -1.95
VFA1P40080 RPC10YHR143W-A 213 nt2.86□□□□□ -1.95
VFA1P40080 YIL058WYIL058W 285 nt2.86□□□□□ -1.95
VFA1P40080 RPS21BYJL136C 264 nt2.86□□□□□ -1.95
VFA1P40080 RPS7BYNL096C 573 nt2.86□□□□□ -1.95
VFA1P40080 SQS1YNL224C 2304 nt2.86□□□□□ -1.95
VFA1P40080 YHR078WYHR078W 1659 nt2.85□□□□□ -1.95
VFA1P40080 YKL111CYKL111C 336 nt2.85□□□□□ -1.95
VFA1P40080 ESF2YNR054C 951 nt2.85□□□□□ -1.95
VFA1P40080 ZEO1YOL109W 342 nt2.85□□□□□ -1.95
VFA1P40080 BCH1YMR237W 2175 nt2.85□□□□□ -1.95
VFA1P40080 GIN4YDR507C 3429 nt2.85□□□□□ -1.95
VFA1P40080 RGR1YLR071C 3249 nt2.84□□□□□ -1.95
VFA1P40080 AI2Q0055 2565 nt2.84□□□□□ -1.95
VFA1P40080 LEU3YLR451W 2661 nt2.84□□□□□ -1.95
VFA1P40080 NOP19YGR251W 591 nt2.84□□□□□ -1.95
VFA1P40080 TIM8YJR135W-A 264 nt2.84□□□□□ -1.95
VFA1P40080 BSC3YLR465C 309 nt2.84□□□□□ -1.95
VFA1P40080 YPL276WYPL276W 438 nt2.84□□□□□ -1.95
VFA1P40080 YPR039WYPR039W 336 nt2.84□□□□□ -1.95
VFA1P40080 NIC96YFR002W 2520 nt2.83□□□□□ -1.96
VFA1P40080 ATP17YDR377W 306 nt2.83□□□□□ -1.96
VFA1P40080 SDH7YDR511W 402 nt2.83□□□□□ -1.96
VFA1P40080 YER188C-AYER188C-A 300 nt2.83□□□□□ -1.96
VFA1P40080 COA4YLR218C 453 nt2.83□□□□□ -1.96
VFA1P40080 GPX2YBR244W 489 nt2.83□□□□□ -1.96
VFA1P40080 ECM25YJL201W 1800 nt2.83□□□□□ -1.96
VFA1P40080 SSY1YDR160W 2559 nt2.82□□□□□ -1.96
VFA1P40080 PUF4YGL014W 2667 nt2.82□□□□□ -1.96
VFA1P40080 MBB1YJL199C 327 nt2.82□□□□□ -1.96
VFA1P40080 GPI14YJR013W 1212 nt2.82□□□□□ -1.96
VFA1P40080 UBC7YMR022W 498 nt2.82□□□□□ -1.96
VFA1P40080 YNL058CYNL058C 951 nt2.82□□□□□ -1.96
VFA1P40080 YPL185WYPL185W 396 nt2.82□□□□□ -1.96
VFA1P40080 PSY2YNL201C 2577 nt2.81□□□□□ -1.96
VFA1P40080 PDR1YGL013C 3207 nt2.81□□□□□ -1.96
VFA1P40080 HYR1YIR037W 492 nt2.81□□□□□ -1.96
VFA1P40080 RPS28BYLR264W 204 nt2.81□□□□□ -1.96
VFA1P40080 ICY1YMR195W 384 nt2.81□□□□□ -1.96
VFA1P40080 RPL20AYMR242C 519 nt2.81□□□□□ -1.96
VFA1P40080 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt2.81□□□□□ -1.96
VFA1P40080 NET1YJL076W 3570 nt2.81□□□□□ -1.96
VFA1P40080 RPO41YFL036W 4056 nt2.81□□□□□ -1.96
VFA1P40080 KAP104YBR017C 2757 nt2.8□□□□□ -1.96
VFA1P40080 SSE1YPL106C 2082 nt2.8□□□□□ -1.96
VFA1P40080 TCP1YDR212W 1680 nt2.8□□□□□ -1.96
VFA1P40080 YER068C-AYER068C-A 432 nt2.8□□□□□ -1.96
VFA1P40080 YER189WYER189W 369 nt2.8□□□□□ -1.96
VFA1P40080 VOA1YGR106C 798 nt2.8□□□□□ -1.96
VFA1P40080 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt2.8□□□□□ -1.96
VFA1P40080 RPS24BYIL069C 408 nt2.8□□□□□ -1.96
VFA1P40080 PET191YJR034W 327 nt2.8□□□□□ -1.96
VFA1P40080 SEC22YLR268W 645 nt2.8□□□□□ -1.96
VFA1P40080 YLR287CYLR287C 1068 nt2.8□□□□□ -1.96
VFA1P40080 YLR434CYLR434C 384 nt2.8□□□□□ -1.96
VFA1P40080 AIM32YML050W 936 nt2.8□□□□□ -1.96
VFA1P40080 PSO2YMR137C 1986 nt2.8□□□□□ -1.96
VFA1P40080 MAK21YDR060W 3078 nt2.79□□□□□ -1.96
VFA1P40080 RMT2YDR465C 1239 nt2.79□□□□□ -1.96
VFA1P40080 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt2.79□□□□□ -1.96
VFA1P40080 HIT1YJR055W 495 nt2.79□□□□□ -1.96
VFA1P40080 MRPL50YNR022C 420 nt2.79□□□□□ -1.96
VFA1P40080 YOR105WYOR105W 327 nt2.79□□□□□ -1.96
VFA1P40080 VPS64YDR200C 1815 nt2.79□□□□□ -1.96
VFA1P40080 BRO1YPL084W 2535 nt2.79□□□□□ -1.96
VFA1P40080 MKT1YNL085W 2493 nt2.79□□□□□ -1.96
VFA1P40080 SOK1YDR006C 2706 nt2.78□□□□□ -1.96
VFA1P40080 SPC72YAL047C 1869 nt2.78□□□□□ -1.96
VFA1P40080 GPI8YDR331W 1236 nt2.78□□□□□ -1.96
VFA1P40080 ATP15YPL271W 189 nt2.78□□□□□ -1.96
VFA1P40080 SRB8YCR081W 4284 nt2.78□□□□□ -1.96
VFA1P40080 YPK1YKL126W 2043 nt2.77□□□□□ -1.97
VFA1P40080 NCE101YJL205C 162 nt2.77□□□□□ -1.97
VFA1P40080 TRM7YBR061C 933 nt2.77□□□□□ -1.97
VFA1P40080 YLR458WYLR458W 381 nt2.76□□□□□ -1.97
VFA1P40080 RGM1YMR182C 636 nt2.76□□□□□ -1.97
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