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Protein–RNA interactions for Protein: Q12241
VAM3, Syntaxin VAM3, yeast
Predictions only
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283 aa
.
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
VAM3
Q12241
YPR089W
YPR089W
2667 nt
2.37
□□□□□ -2.03
VAM3
Q12241
PRP6
YBR055C
2700 nt
2.37
□□□□□ -2.03
VAM3
Q12241
BCK1
YJL095W
4437 nt
2.37
□□□□□ -2.03
VAM3
Q12241
AHC2
YCR082W
387 nt
2.36
□□□□□ -2.03
VAM3
Q12241
GPI14
YJR013W
1212 nt
2.36
□□□□□ -2.03
VAM3
Q12241
YJR023C
YJR023C
402 nt
2.36
□□□□□ -2.03
VAM3
Q12241
EAF6
YJR082C
342 nt
2.36
□□□□□ -2.03
VAM3
Q12241
NDD1
YOR372C
1665 nt
2.36
□□□□□ -2.03
VAM3
Q12241
YPL216W
YPL216W
3309 nt
2.36
□□□□□ -2.03
VAM3
Q12241
IRA2
YOL081W
9240 nt
2.36
□□□□□ -2.03
VAM3
Q12241
HOS4
YIL112W
3252 nt
2.36
□□□□□ -2.03
VAM3
Q12241
KSP1
YHR082C
3090 nt
2.36
□□□□□ -2.03
VAM3
Q12241
INP51
YIL002C
2841 nt
2.35
□□□□□ -2.03
VAM3
Q12241
YIL058W
YIL058W
285 nt
2.35
□□□□□ -2.03
VAM3
Q12241
IST3
YIR005W
447 nt
2.35
□□□□□ -2.03
VAM3
Q12241
YOL013W-B
YOL013W-B
291 nt
2.35
□□□□□ -2.03
VAM3
Q12241
TOA1
YOR194C
861 nt
2.35
□□□□□ -2.03
VAM3
Q12241
ASG1
YIL130W
2895 nt
2.35
□□□□□ -2.03
VAM3
Q12241
SIR3
YLR442C
2937 nt
2.35
□□□□□ -2.03
VAM3
Q12241
SNU56
YDR240C
1479 nt
2.34
□□□□□ -2.03
VAM3
Q12241
RTR2
YDR066C
591 nt
2.34
□□□□□ -2.03
VAM3
Q12241
IRC4
YDR540C
540 nt
2.34
□□□□□ -2.03
VAM3
Q12241
MTC7
YEL033W
420 nt
2.34
□□□□□ -2.03
VAM3
Q12241
YER119C-A
YER119C-A
372 nt
2.34
□□□□□ -2.03
VAM3
Q12241
YGL165C
YGL165C
579 nt
2.34
□□□□□ -2.03
VAM3
Q12241
TIM10
YHR005C-A
282 nt
2.34
□□□□□ -2.03
VAM3
Q12241
PEP8
YJL053W
1140 nt
2.34
□□□□□ -2.03
VAM3
Q12241
YKL033W-A
YKL033W-A
711 nt
2.34
□□□□□ -2.03
VAM3
Q12241
YKL044W
YKL044W
321 nt
2.34
□□□□□ -2.03
VAM3
Q12241
RPS29A
YLR388W
171 nt
2.34
□□□□□ -2.03
VAM3
Q12241
YPL039W
YPL039W
951 nt
2.34
□□□□□ -2.03
VAM3
Q12241
SVS1
YPL163C
783 nt
2.34
□□□□□ -2.03
VAM3
Q12241
YBR085C-A
YBR085C-A
258 nt
2.34
□□□□□ -2.03
VAM3
Q12241
FAR11
YNL127W
2862 nt
2.34
□□□□□ -2.04
VAM3
Q12241
PHR1
YOR386W
1698 nt
2.34
□□□□□ -2.04
VAM3
Q12241
SRO77
YBL106C
3033 nt
2.34
□□□□□ -2.04
VAM3
Q12241
PES4
YFR023W
1836 nt
2.33
□□□□□ -2.04
VAM3
Q12241
DPB11
YJL090C
2295 nt
2.33
□□□□□ -2.04
VAM3
Q12241
ERP6
YGL002W
651 nt
2.33
□□□□□ -2.04
VAM3
Q12241
YGR121W-A
YGR121W-A
216 nt
2.33
□□□□□ -2.04
VAM3
Q12241
TPM2
YIL138C
486 nt
2.33
□□□□□ -2.04
VAM3
Q12241
HYR1
YIR037W
492 nt
2.33
□□□□□ -2.04
VAM3
Q12241
SYS1
YJL004C
612 nt
2.33
□□□□□ -2.04
VAM3
Q12241
SPC1
YJR010C-A
285 nt
2.33
□□□□□ -2.04
VAM3
Q12241
CMS1
YLR003C
876 nt
2.33
□□□□□ -2.04
VAM3
Q12241
ATP3
YBR039W
936 nt
2.33
□□□□□ -2.04
VAM3
Q12241
YNL018C
YNL018C
1839 nt
2.33
□□□□□ -2.04
VAM3
Q12241
SWA2
YDR320C
2007 nt
2.32
□□□□□ -2.04
VAM3
Q12241
ORC1
YML065W
2745 nt
2.32
□□□□□ -2.04
VAM3
Q12241
EDS1
YBR033W
2760 nt
2.32
□□□□□ -2.04
VAM3
Q12241
ACB1
YGR037C
264 nt
2.32
□□□□□ -2.04
VAM3
Q12241
KTI11
YBL071W-A
249 nt
2.32
□□□□□ -2.04
VAM3
Q12241
YPL068C
YPL068C
882 nt
2.32
□□□□□ -2.04
VAM3
Q12241
YBR209W
YBR209W
318 nt
2.32
□□□□□ -2.04
VAM3
Q12241
MSB2
YGR014W
3921 nt
2.32
□□□□□ -2.04
VAM3
Q12241
MRD1
YPR112C
2664 nt
2.32
□□□□□ -2.04
VAM3
Q12241
INP53
YOR109W
3324 nt
2.32
□□□□□ -2.04
VAM3
Q12241
HSC82
YMR186W
2118 nt
2.32
□□□□□ -2.04
VAM3
Q12241
TCB2
YNL087W
3537 nt
2.31
□□□□□ -2.04
VAM3
Q12241
KRE33
YNL132W
3171 nt
2.31
□□□□□ -2.04
VAM3
Q12241
tC(GCA)B
tC(GCA)B
72 nt
2.31
□□□□□ -2.04
VAM3
Q12241
tC(GCA)G
tC(GCA)G
72 nt
2.31
□□□□□ -2.04
VAM3
Q12241
tC(GCA)P1
tC(GCA)P1
72 nt
2.31
□□□□□ -2.04
VAM3
Q12241
tC(GCA)P2
tC(GCA)P2
72 nt
2.31
□□□□□ -2.04
VAM3
Q12241
YGR290W
YGR290W
444 nt
2.31
□□□□□ -2.04
VAM3
Q12241
JIP3
YLR331C
378 nt
2.31
□□□□□ -2.04
VAM3
Q12241
IGO1
YNL157W
507 nt
2.31
□□□□□ -2.04
VAM3
Q12241
YOL019W-A
YOL019W-A
153 nt
2.31
□□□□□ -2.04
VAM3
Q12241
RPO41
YFL036W
4056 nt
2.31
□□□□□ -2.04
VAM3
Q12241
VPS16
YPL045W
2397 nt
2.3
□□□□□ -2.04
VAM3
Q12241
UTP13
YLR222C
2454 nt
2.3
□□□□□ -2.04
VAM3
Q12241
SNU114
YKL173W
3027 nt
2.3
□□□□□ -2.04
VAM3
Q12241
RPL9A
YGL147C
576 nt
2.3
□□□□□ -2.04
VAM3
Q12241
RNR4
YGR180C
1038 nt
2.3
□□□□□ -2.04
VAM3
Q12241
YIL030W-A
YIL030W-A
339 nt
2.3
□□□□□ -2.04
VAM3
Q12241
RAM2
YKL019W
951 nt
2.3
□□□□□ -2.04
VAM3
Q12241
COA4
YLR218C
453 nt
2.3
□□□□□ -2.04
VAM3
Q12241
YMR194C-A
YMR194C-A
225 nt
2.3
□□□□□ -2.04
VAM3
Q12241
RPB11
YOL005C
363 nt
2.3
□□□□□ -2.04
VAM3
Q12241
AYT1
YLL063C
1425 nt
2.3
□□□□□ -2.04
VAM3
Q12241
DBP10
YDL031W
2988 nt
2.3
□□□□□ -2.04
VAM3
Q12241
CBF2
YGR140W
2871 nt
2.29
□□□□□ -2.04
VAM3
Q12241
MDM32
YOR147W
1869 nt
2.29
□□□□□ -2.04
VAM3
Q12241
YDR220C
YDR220C
294 nt
2.29
□□□□□ -2.04
VAM3
Q12241
SDC1
YDR469W
528 nt
2.29
□□□□□ -2.04
VAM3
Q12241
RPL37A
YLR185W
267 nt
2.29
□□□□□ -2.04
VAM3
Q12241
YML037C
YML037C
1023 nt
2.29
□□□□□ -2.04
VAM3
Q12241
COX14
YML129C
213 nt
2.29
□□□□□ -2.04
VAM3
Q12241
CAT5
YOR125C
702 nt
2.29
□□□□□ -2.04
VAM3
Q12241
MGR1
YCL044C
1254 nt
2.29
□□□□□ -2.04
VAM3
Q12241
SEC26
YDR238C
2922 nt
2.29
□□□□□ -2.04
VAM3
Q12241
KEL2
YGR238C
2649 nt
2.29
□□□□□ -2.04
VAM3
Q12241
ROY1
YMR258C
1662 nt
2.28
□□□□□ -2.04
VAM3
Q12241
AAD16
YFL057C
459 nt
2.28
□□□□□ -2.04
VAM3
Q12241
TWF1
YGR080W
999 nt
2.28
□□□□□ -2.04
VAM3
Q12241
YLR202C
YLR202C
327 nt
2.28
□□□□□ -2.04
VAM3
Q12241
YLR458W
YLR458W
381 nt
2.28
□□□□□ -2.04
VAM3
Q12241
URA10
YMR271C
684 nt
2.28
□□□□□ -2.04
VAM3
Q12241
YEL043W
YEL043W
2871 nt
2.28
□□□□□ -2.05
VAM3
Q12241
BRO1
YPL084W
2535 nt
2.27
□□□□□ -2.05
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