Protein–RNA interactions for Protein: Q07084

SSK1, Osmolarity two-component system protein SSK1, yeastyeast

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Length 712 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSK1Q07084 YER135CYER135C 393 nt2.58□□□□□ -2
SSK1Q07084 YMR31YFR049W 372 nt2.58□□□□□ -2
SSK1Q07084 YJR079WYJR079W 330 nt2.58□□□□□ -2
SSK1Q07084 RPL20AYMR242C 519 nt2.58□□□□□ -2
SSK1Q07084 PEP12YOR036W 867 nt2.58□□□□□ -2
SSK1Q07084 ISU1YPL135W 498 nt2.58□□□□□ -2
SSK1Q07084 STE23YLR389C 3084 nt2.58□□□□□ -2
SSK1Q07084 YBR012W-AYBR012W-A 1323 nt2.58□□□□□ -2
SSK1Q07084 YOR142W-AYOR142W-A 1323 nt2.58□□□□□ -2
SSK1Q07084 YPR158W-AYPR158W-A 1323 nt2.58□□□□□ -2
SSK1Q07084 SAP1YER047C 2694 nt2.58□□□□□ -2
SSK1Q07084 PDC2YDR081C 2778 nt2.58□□□□□ -2
SSK1Q07084 RPA190YOR341W 4995 nt2.58□□□□□ -2
SSK1Q07084 NET1YJL076W 3570 nt2.57□□□□□ -2
SSK1Q07084 TIM11YDR322C-A 291 nt2.57□□□□□ -2
SSK1Q07084 LAG1YHL003C 1236 nt2.57□□□□□ -2
SSK1Q07084 RPS22AYJL190C 393 nt2.57□□□□□ -2
SSK1Q07084 CMS1YLR003C 876 nt2.57□□□□□ -2
SSK1Q07084 TEN1YLR010C 483 nt2.57□□□□□ -2
SSK1Q07084 RMP1YLR145W 606 nt2.57□□□□□ -2
SSK1Q07084 YPL039WYPL039W 951 nt2.57□□□□□ -2
SSK1Q07084 YOL057WYOL057W 2136 nt2.57□□□□□ -2
SSK1Q07084 RTT10YPL183C 3042 nt2.57□□□□□ -2
SSK1Q07084 GPI17YDR434W 1605 nt2.57□□□□□ -2
SSK1Q07084 ILS1YBL076C 3219 nt2.56□□□□□ -2
SSK1Q07084 POL3YDL102W 3294 nt2.56□□□□□ -2
SSK1Q07084 ECM21YBL101C 3354 nt2.56□□□□□ -2
SSK1Q07084 DPB11YJL090C 2295 nt2.56□□□□□ -2
SSK1Q07084 YCR064CYCR064C 411 nt2.56□□□□□ -2
SSK1Q07084 YDR269CYDR269C 324 nt2.56□□□□□ -2
SSK1Q07084 TIF35YDR429C 825 nt2.56□□□□□ -2
SSK1Q07084 TSA2YDR453C 591 nt2.56□□□□□ -2
SSK1Q07084 YER107W-AYER107W-A 321 nt2.56□□□□□ -2
SSK1Q07084 CRG1YHR209W 876 nt2.56□□□□□ -2
SSK1Q07084 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt2.56□□□□□ -2
SSK1Q07084 NFU1YKL040C 771 nt2.56□□□□□ -2
SSK1Q07084 RPB11YOL005C 363 nt2.56□□□□□ -2
SSK1Q07084 NSL1YPL233W 651 nt2.56□□□□□ -2
SSK1Q07084 SIP3YNL257C 3690 nt2.56□□□□□ -2
SSK1Q07084 MMS1YPR164W 4224 nt2.56□□□□□ -2
SSK1Q07084 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt2.55□□□□□ -2
SSK1Q07084 YER087C-AYER087C-A 552 nt2.55□□□□□ -2
SSK1Q07084 RNH70YGR276C 1662 nt2.55□□□□□ -2
SSK1Q07084 YHR138CYHR138C 345 nt2.55□□□□□ -2
SSK1Q07084 PEP8YJL053W 1140 nt2.55□□□□□ -2
SSK1Q07084 YKR033CYKR033C 426 nt2.55□□□□□ -2
SSK1Q07084 YOL159CYOL159C 516 nt2.55□□□□□ -2
SSK1Q07084 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt2.55□□□□□ -2
SSK1Q07084 YPL197CYPL197C 414 nt2.55□□□□□ -2
SSK1Q07084 COG3YER157W 2406 nt2.54□□□□□ -2
SSK1Q07084 MET6YER091C 2304 nt2.54□□□□□ -2
SSK1Q07084 TLC1TLC1 1301 nt2.54□□□□□ -2
SSK1Q07084 YLR001CYLR001C 2589 nt2.54□□□□□ -2
SSK1Q07084 IRC4YDR540C 540 nt2.54□□□□□ -2
SSK1Q07084 NBL1YHR199C-A 222 nt2.54□□□□□ -2
SSK1Q07084 YIL054WYIL054W 318 nt2.54□□□□□ -2
SSK1Q07084 YIL174WYIL174W 228 nt2.54□□□□□ -2
SSK1Q07084 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt2.54□□□□□ -2
SSK1Q07084 CDC33YOL139C 642 nt2.54□□□□□ -2
SSK1Q07084 YOR248WYOR248W 303 nt2.54□□□□□ -2
SSK1Q07084 YPR203WYPR203W 309 nt2.54□□□□□ -2
SSK1Q07084 MDM32YOR147W 1869 nt2.54□□□□□ -2
SSK1Q07084 YNL034WYNL034W 1839 nt2.54□□□□□ -2
SSK1Q07084 TAF2YCR042C 4224 nt2.53□□□□□ -2
SSK1Q07084 NPR1YNL183C 2373 nt2.53□□□□□ -2
SSK1Q07084 GPI19YDR437W 423 nt2.53□□□□□ -2
SSK1Q07084 YJR023CYJR023C 402 nt2.53□□□□□ -2
SSK1Q07084 RPL8BYLL045C 771 nt2.53□□□□□ -2
SSK1Q07084 COA4YLR218C 453 nt2.53□□□□□ -2
SSK1Q07084 RPL33AYPL143W 324 nt2.53□□□□□ -2
SSK1Q07084 DSE4YNR067C 3354 nt2.53□□□□□ -2
SSK1Q07084 FUS1YCL027W 1539 nt2.52□□□□□ -2.01
SSK1Q07084 NPR3YHL023C 3441 nt2.52□□□□□ -2.01
SSK1Q07084 APC2YLR127C 2562 nt2.52□□□□□ -2.01
SSK1Q07084 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt2.52□□□□□ -2.01
SSK1Q07084 RRF1YHR038W 693 nt2.52□□□□□ -2.01
SSK1Q07084 YKL033W-AYKL033W-A 711 nt2.52□□□□□ -2.01
SSK1Q07084 SMA2YML066C 1110 nt2.52□□□□□ -2.01
SSK1Q07084 ROY1YMR258C 1662 nt2.52□□□□□ -2.01
SSK1Q07084 JSN1YJR091C 3276 nt2.51□□□□□ -2.01
SSK1Q07084 GEA1YJR031C 4227 nt2.51□□□□□ -2.01
SSK1Q07084 TCB2YNL087W 3537 nt2.51□□□□□ -2.01
SSK1Q07084 CBS1YDL069C 690 nt2.51□□□□□ -2.01
SSK1Q07084 RPS17BYDR447C 411 nt2.51□□□□□ -2.01
SSK1Q07084 GLC7YER133W 939 nt2.51□□□□□ -2.01
SSK1Q07084 RPL14BYHL001W 417 nt2.51□□□□□ -2.01
SSK1Q07084 TPM2YIL138C 486 nt2.51□□□□□ -2.01
SSK1Q07084 SIP18YMR175W 240 nt2.51□□□□□ -2.01
SSK1Q07084 URA10YMR271C 684 nt2.51□□□□□ -2.01
SSK1Q07084 DGK1YOR311C 873 nt2.51□□□□□ -2.01
SSK1Q07084 YBR032WYBR032W 303 nt2.51□□□□□ -2.01
SSK1Q07084 LCL1YPL056C 306 nt2.51□□□□□ -2.01
SSK1Q07084 RGR1YLR071C 3249 nt2.5□□□□□ -2.01
SSK1Q07084 RLF2YPR018W 1821 nt2.5□□□□□ -2.01
SSK1Q07084 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt2.5□□□□□ -2.01
SSK1Q07084 YGL165CYGL165C 579 nt2.5□□□□□ -2.01
SSK1Q07084 MBB1YJL199C 327 nt2.5□□□□□ -2.01
SSK1Q07084 PEX17YNL214W 600 nt2.5□□□□□ -2.01
SSK1Q07084 ESF2YNR054C 951 nt2.5□□□□□ -2.01
SSK1Q07084 SRO77YBL106C 3033 nt2.5□□□□□ -2.01
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