Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC33.65■■■□□ 2.98
GRIN2AQ12879 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
GRIN2AQ12879 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
GRIN2AQ12879 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
GRIN2AQ12879 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
GRIN2AQ12879 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
GRIN2AQ12879 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
GRIN2AQ12879 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
GRIN2AQ12879 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
GRIN2AQ12879 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
GRIN2AQ12879 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
GRIN2AQ12879 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
GRIN2AQ12879 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
GRIN2AQ12879 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
GRIN2AQ12879 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
GRIN2AQ12879 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
GRIN2AQ12879 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
GRIN2AQ12879 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
GRIN2AQ12879 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
GRIN2AQ12879 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
GRIN2AQ12879 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
GRIN2AQ12879 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
GRIN2AQ12879 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
GRIN2AQ12879 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
GRIN2AQ12879 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
GRIN2AQ12879 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
GRIN2AQ12879 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
GRIN2AQ12879 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
GRIN2AQ12879 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
GRIN2AQ12879 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
GRIN2AQ12879 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
GRIN2AQ12879 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
GRIN2AQ12879 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
GRIN2AQ12879 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
GRIN2AQ12879 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
GRIN2AQ12879 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
GRIN2AQ12879 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
GRIN2AQ12879 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
GRIN2AQ12879 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
GRIN2AQ12879 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
GRIN2AQ12879 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
GRIN2AQ12879 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC33.61■■■□□ 2.97
GRIN2AQ12879 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC33.61■■■□□ 2.97
GRIN2AQ12879 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
GRIN2AQ12879 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
GRIN2AQ12879 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
GRIN2AQ12879 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
GRIN2AQ12879 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
GRIN2AQ12879 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
GRIN2AQ12879 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
GRIN2AQ12879 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
GRIN2AQ12879 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
GRIN2AQ12879 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
GRIN2AQ12879 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
GRIN2AQ12879 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
GRIN2AQ12879 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
GRIN2AQ12879 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
GRIN2AQ12879 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
GRIN2AQ12879 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
GRIN2AQ12879 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
GRIN2AQ12879 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
GRIN2AQ12879 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
GRIN2AQ12879 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
GRIN2AQ12879 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
GRIN2AQ12879 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
GRIN2AQ12879 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
GRIN2AQ12879 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
GRIN2AQ12879 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
GRIN2AQ12879 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
GRIN2AQ12879 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
GRIN2AQ12879 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
GRIN2AQ12879 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
GRIN2AQ12879 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
GRIN2AQ12879 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
GRIN2AQ12879 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
GRIN2AQ12879 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
GRIN2AQ12879 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
GRIN2AQ12879 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.97
GRIN2AQ12879 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC33.57■■■□□ 2.97
GRIN2AQ12879 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
GRIN2AQ12879 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC33.57■■■□□ 2.97
GRIN2AQ12879 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
GRIN2AQ12879 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
GRIN2AQ12879 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
GRIN2AQ12879 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
GRIN2AQ12879 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
GRIN2AQ12879 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
GRIN2AQ12879 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
GRIN2AQ12879 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
GRIN2AQ12879 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
GRIN2AQ12879 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
GRIN2AQ12879 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
GRIN2AQ12879 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
GRIN2AQ12879 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
GRIN2AQ12879 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC33.56■■■□□ 2.96
GRIN2AQ12879 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
GRIN2AQ12879 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
GRIN2AQ12879 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
GRIN2AQ12879 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
GRIN2AQ12879 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms