Protein–RNA interactions for Protein: Q12417

PRP46, Pre-mRNA-splicing factor PRP46, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP46Q12417 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.15□□□□□ -2.07
PRP46Q12417 SNO2YNL334C 669 nt2.15□□□□□ -2.07
PRP46Q12417 KEL2YGR238C 2649 nt2.15□□□□□ -2.07
PRP46Q12417 PCK1YKR097W 1650 nt2.15□□□□□ -2.07
PRP46Q12417 MSB1YOR188W 3414 nt2.14□□□□□ -2.07
PRP46Q12417 MES1YGR264C 2256 nt2.14□□□□□ -2.07
PRP46Q12417 YCR064CYCR064C 411 nt2.14□□□□□ -2.07
PRP46Q12417 MND1YGL183C 660 nt2.14□□□□□ -2.07
PRP46Q12417 ACB1YGR037C 264 nt2.14□□□□□ -2.07
PRP46Q12417 COG2YGR120C 789 nt2.14□□□□□ -2.07
PRP46Q12417 YGR293CYGR293C 462 nt2.14□□□□□ -2.07
PRP46Q12417 AYR1YIL124W 894 nt2.14□□□□□ -2.07
PRP46Q12417 PAU14YIL176C 363 nt2.14□□□□□ -2.07
PRP46Q12417 PAU1YJL223C 363 nt2.14□□□□□ -2.07
PRP46Q12417 YET1YKL065C 621 nt2.14□□□□□ -2.07
PRP46Q12417 YBR062CYBR062C 543 nt2.14□□□□□ -2.07
PRP46Q12417 TAZ1YPR140W 1146 nt2.14□□□□□ -2.07
PRP46Q12417 STE11YLR362W 2154 nt2.14□□□□□ -2.07
PRP46Q12417 YEL043WYEL043W 2871 nt2.14□□□□□ -2.07
PRP46Q12417 DAL5YJR152W 1632 nt2.13□□□□□ -2.07
PRP46Q12417 YEF3YLR249W 3135 nt2.13□□□□□ -2.07
PRP46Q12417 YKR078WYKR078W 1758 nt2.13□□□□□ -2.07
PRP46Q12417 CBF2YGR140W 2871 nt2.13□□□□□ -2.07
PRP46Q12417 YPR089WYPR089W 2667 nt2.13□□□□□ -2.07
PRP46Q12417 UBC5YDR059C 447 nt2.13□□□□□ -2.07
PRP46Q12417 RPS17BYDR447C 411 nt2.13□□□□□ -2.07
PRP46Q12417 PEA2YER149C 1263 nt2.13□□□□□ -2.07
PRP46Q12417 AAD16YFL057C 459 nt2.13□□□□□ -2.07
PRP46Q12417 YGR226CYGR226C 210 nt2.13□□□□□ -2.07
PRP46Q12417 AIM18YHR198C 966 nt2.13□□□□□ -2.07
PRP46Q12417 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.13□□□□□ -2.07
PRP46Q12417 YBR051WYBR051W 351 nt2.13□□□□□ -2.07
PRP46Q12417 YPR145C-AYPR145C-A 237 nt2.13□□□□□ -2.07
PRP46Q12417 YCL007CYCL007C 393 nt2.13□□□□□ -2.07
PRP46Q12417 PRP6YBR055C 2700 nt2.13□□□□□ -2.07
PRP46Q12417 snR5snR5 204 nt2.12□□□□□ -2.07
PRP46Q12417 PBP4YDL053C 558 nt2.12□□□□□ -2.07
PRP46Q12417 YDL163WYDL163W 303 nt2.12□□□□□ -2.07
PRP46Q12417 YFL012W-AYFL012W-A 375 nt2.12□□□□□ -2.07
PRP46Q12417 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt2.12□□□□□ -2.07
PRP46Q12417 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt2.12□□□□□ -2.07
PRP46Q12417 RPS16AYMR143W 432 nt2.12□□□□□ -2.07
PRP46Q12417 YNR025CYNR025C 360 nt2.12□□□□□ -2.07
PRP46Q12417 APL5YPL195W 2799 nt2.12□□□□□ -2.07
PRP46Q12417 NUP170YBL079W 4509 nt2.12□□□□□ -2.07
PRP46Q12417 TIF35YDR429C 825 nt2.11□□□□□ -2.07
PRP46Q12417 YEL057CYEL057C 702 nt2.11□□□□□ -2.07
PRP46Q12417 YER079C-AYER079C-A 339 nt2.11□□□□□ -2.07
PRP46Q12417 UTP30YKR060W 825 nt2.11□□□□□ -2.07
PRP46Q12417 PAU8YAL068C 363 nt2.11□□□□□ -2.07
PRP46Q12417 YMR254CYMR254C 309 nt2.11□□□□□ -2.07
PRP46Q12417 PAU20YOL161C 363 nt2.11□□□□□ -2.07
PRP46Q12417 YPR147CYPR147C 915 nt2.11□□□□□ -2.07
PRP46Q12417 YBR209WYBR209W 318 nt2.11□□□□□ -2.07
PRP46Q12417 SNU114YKL173W 3027 nt2.1□□□□□ -2.07
PRP46Q12417 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt2.1□□□□□ -2.07
PRP46Q12417 KSP1YHR082C 3090 nt2.1□□□□□ -2.07
PRP46Q12417 SHS1YDL225W 1656 nt2.1□□□□□ -2.07
PRP46Q12417 FYV4YHR059W 393 nt2.1□□□□□ -2.07
PRP46Q12417 YNL235CYNL235C 432 nt2.1□□□□□ -2.07
PRP46Q12417 ATP3YBR039W 936 nt2.1□□□□□ -2.07
PRP46Q12417 UTP15YMR093W 1542 nt2.1□□□□□ -2.07
PRP46Q12417 VPS16YPL045W 2397 nt2.09□□□□□ -2.07
PRP46Q12417 GIS1YDR096W 2685 nt2.09□□□□□ -2.07
PRP46Q12417 YCR108CYCR108C 192 nt2.09□□□□□ -2.07
PRP46Q12417 VTC1YER072W 390 nt2.09□□□□□ -2.07
PRP46Q12417 GET1YGL020C 708 nt2.09□□□□□ -2.07
PRP46Q12417 COX8YLR395C 237 nt2.09□□□□□ -2.07
PRP46Q12417 RPS17AYML024W 411 nt2.09□□□□□ -2.07
PRP46Q12417 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt2.09□□□□□ -2.07
PRP46Q12417 YBR197CYBR197C 654 nt2.09□□□□□ -2.07
PRP46Q12417 YPR097WYPR097W 3222 nt2.09□□□□□ -2.08
PRP46Q12417 UBX3YDL091C 1368 nt2.09□□□□□ -2.08
PRP46Q12417 SCD5YOR329C 2619 nt2.08□□□□□ -2.08
PRP46Q12417 AFI1YOR129C 2682 nt2.08□□□□□ -2.08
PRP46Q12417 TDA2YER071C 381 nt2.08□□□□□ -2.08
PRP46Q12417 YJL119CYJL119C 324 nt2.08□□□□□ -2.08
PRP46Q12417 PRP21YJL203W 843 nt2.08□□□□□ -2.08
PRP46Q12417 VPS63YLR261C 327 nt2.08□□□□□ -2.08
PRP46Q12417 ERG29YMR134W 714 nt2.08□□□□□ -2.08
PRP46Q12417 YMR187CYMR187C 1296 nt2.08□□□□□ -2.08
PRP46Q12417 YOR283WYOR283W 693 nt2.08□□□□□ -2.08
PRP46Q12417 YPR170CYPR170C 336 nt2.08□□□□□ -2.08
PRP46Q12417 MUD1YBR119W 897 nt2.08□□□□□ -2.08
PRP46Q12417 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt2.08□□□□□ -2.08
PRP46Q12417 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt2.08□□□□□ -2.08
PRP46Q12417 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt2.08□□□□□ -2.08
PRP46Q12417 YCL020WYCL020W 1317 nt2.08□□□□□ -2.08
PRP46Q12417 YDR115WYDR115W 318 nt2.07□□□□□ -2.08
PRP46Q12417 RPS24AYER074W 408 nt2.07□□□□□ -2.08
PRP46Q12417 PRP38YGR075C 729 nt2.07□□□□□ -2.08
PRP46Q12417 ECM9YKR004C 1134 nt2.07□□□□□ -2.08
PRP46Q12417 VID24YBR105C 1089 nt2.07□□□□□ -2.08
PRP46Q12417 MLH1YMR167W 2310 nt2.07□□□□□ -2.08
PRP46Q12417 CTF13YMR094W 1437 nt2.07□□□□□ -2.08
PRP46Q12417 RAV1YJR033C 4074 nt2.07□□□□□ -2.08
PRP46Q12417 SLN1YIL147C 3663 nt2.06□□□□□ -2.08
PRP46Q12417 SVL3YPL032C 2478 nt2.06□□□□□ -2.08
PRP46Q12417 RPS26BYER131W 360 nt2.06□□□□□ -2.08
PRP46Q12417 Q0144Q0144 330 nt2.06□□□□□ -2.08
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