Protein–RNA interactions for Protein: Q12093

SLM3, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, yeastyeast

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SLM3Q12093 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt2.37□□□□□ -2.03
SLM3Q12093 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt2.37□□□□□ -2.03
SLM3Q12093 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt2.37□□□□□ -2.03
SLM3Q12093 YCL020WYCL020W 1317 nt2.37□□□□□ -2.03
SLM3Q12093 JSN1YJR091C 3276 nt2.36□□□□□ -2.03
SLM3Q12093 ALY1YKR021W 2748 nt2.36□□□□□ -2.03
SLM3Q12093 NUP192YJL039C 5052 nt2.36□□□□□ -2.03
SLM3Q12093 GPM2YDL021W 936 nt2.36□□□□□ -2.03
SLM3Q12093 YEA4YEL004W 1029 nt2.36□□□□□ -2.03
SLM3Q12093 YIL012WYIL012W 342 nt2.36□□□□□ -2.03
SLM3Q12093 YRO2YBR054W 1035 nt2.36□□□□□ -2.03
SLM3Q12093 DCP2YNL118C 2913 nt2.36□□□□□ -2.03
SLM3Q12093 SET2YJL168C 2202 nt2.36□□□□□ -2.03
SLM3Q12093 SHS1YDL225W 1656 nt2.35□□□□□ -2.03
SLM3Q12093 YOL057WYOL057W 2136 nt2.35□□□□□ -2.03
SLM3Q12093 TRM2YKR056W 1920 nt2.35□□□□□ -2.03
SLM3Q12093 KAR9YPL269W 1935 nt2.35□□□□□ -2.03
SLM3Q12093 YIP1YGR172C 747 nt2.35□□□□□ -2.03
SLM3Q12093 YHR050W-AYHR050W-A 171 nt2.35□□□□□ -2.03
SLM3Q12093 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.35□□□□□ -2.03
SLM3Q12093 CWC24YLR323C 780 nt2.35□□□□□ -2.03
SLM3Q12093 SEN54YPL083C 1404 nt2.34□□□□□ -2.03
SLM3Q12093 BRR2YER172C 6492 nt2.34□□□□□ -2.03
SLM3Q12093 SSP1YHR184W 1716 nt2.34□□□□□ -2.03
SLM3Q12093 TAF2YCR042C 4224 nt2.34□□□□□ -2.03
SLM3Q12093 PBP4YDL053C 558 nt2.34□□□□□ -2.03
SLM3Q12093 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt2.34□□□□□ -2.03
SLM3Q12093 ARL3YPL051W 597 nt2.34□□□□□ -2.03
SLM3Q12093 YPR203WYPR203W 309 nt2.34□□□□□ -2.03
SLM3Q12093 CBP6YBR120C 489 nt2.34□□□□□ -2.03
SLM3Q12093 LYS9YNR050C 1341 nt2.34□□□□□ -2.04
SLM3Q12093 NFT1YKR103W 3657 nt2.33□□□□□ -2.04
SLM3Q12093 APM3YBR288C 1452 nt2.33□□□□□ -2.04
SLM3Q12093 MES1YGR264C 2256 nt2.33□□□□□ -2.04
SLM3Q12093 YCT1YLL055W 1596 nt2.33□□□□□ -2.04
SLM3Q12093 YCR099CYCR099C 468 nt2.33□□□□□ -2.04
SLM3Q12093 YDL158CYDL158C 309 nt2.33□□□□□ -2.04
SLM3Q12093 HPA3YEL066W 540 nt2.33□□□□□ -2.04
SLM3Q12093 CPR7YJR032W 1182 nt2.33□□□□□ -2.04
SLM3Q12093 MRP49YKL167C 414 nt2.33□□□□□ -2.04
SLM3Q12093 REC102YLR329W 795 nt2.33□□□□□ -2.04
SLM3Q12093 IRC21YMR073C 606 nt2.33□□□□□ -2.04
SLM3Q12093 RPL20AYMR242C 519 nt2.33□□□□□ -2.04
SLM3Q12093 GIS1YDR096W 2685 nt2.33□□□□□ -2.04
SLM3Q12093 ADY4YLR227C 1482 nt2.33□□□□□ -2.04
SLM3Q12093 YCR090CYCR090C 549 nt2.32□□□□□ -2.04
SLM3Q12093 YIR036W-AYIR036W-A 402 nt2.32□□□□□ -2.04
SLM3Q12093 YET1YKL065C 621 nt2.32□□□□□ -2.04
SLM3Q12093 YBR051WYBR051W 351 nt2.32□□□□□ -2.04
SLM3Q12093 STD1YOR047C 1335 nt2.32□□□□□ -2.04
SLM3Q12093 FUS1YCL027W 1539 nt2.32□□□□□ -2.04
SLM3Q12093 DAD1YDR016C 285 nt2.31□□□□□ -2.04
SLM3Q12093 TIM11YDR322C-A 291 nt2.31□□□□□ -2.04
SLM3Q12093 YER091C-AYER091C-A 222 nt2.31□□□□□ -2.04
SLM3Q12093 YFR009W-AYFR009W-A 258 nt2.31□□□□□ -2.04
SLM3Q12093 YGR109W-AYGR109W-A 873 nt2.31□□□□□ -2.04
SLM3Q12093 YIL082WYIL082W 873 nt2.31□□□□□ -2.04
SLM3Q12093 YJL147CYJL147C 1149 nt2.31□□□□□ -2.04
SLM3Q12093 NYV1YLR093C 762 nt2.31□□□□□ -2.04
SLM3Q12093 YBL012CYBL012C 402 nt2.31□□□□□ -2.04
SLM3Q12093 YOL134CYOL134C 390 nt2.31□□□□□ -2.04
SLM3Q12093 snR191snR191 274 nt2.31□□□□□ -2.04
SLM3Q12093 BFR1YOR198C 1413 nt2.31□□□□□ -2.04
SLM3Q12093 SIP3YNL257C 3690 nt2.31□□□□□ -2.04
SLM3Q12093 SBE22YHR103W 2559 nt2.3□□□□□ -2.04
SLM3Q12093 ADK1YDR226W 669 nt2.3□□□□□ -2.04
SLM3Q12093 YHR210CYHR210C 1026 nt2.3□□□□□ -2.04
SLM3Q12093 COX8YLR395C 237 nt2.3□□□□□ -2.04
SLM3Q12093 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.3□□□□□ -2.04
SLM3Q12093 SFM1YOR021C 642 nt2.3□□□□□ -2.04
SLM3Q12093 YPR014CYPR014C 330 nt2.3□□□□□ -2.04
SLM3Q12093 PIS1YPR113W 663 nt2.3□□□□□ -2.04
SLM3Q12093 MMS1YPR164W 4224 nt2.3□□□□□ -2.04
SLM3Q12093 APC2YLR127C 2562 nt2.3□□□□□ -2.04
SLM3Q12093 YRR1YOR162C 2433 nt2.29□□□□□ -2.04
SLM3Q12093 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt2.29□□□□□ -2.04
SLM3Q12093 REF2YDR195W 1602 nt2.29□□□□□ -2.04
SLM3Q12093 POM152YMR129W 4014 nt2.29□□□□□ -2.04
SLM3Q12093 snR5snR5 204 nt2.29□□□□□ -2.04
SLM3Q12093 YIL068W-AYIL068W-A 384 nt2.29□□□□□ -2.04
SLM3Q12093 FKS1YLR342W 5631 nt2.29□□□□□ -2.04
SLM3Q12093 NPR1YNL183C 2373 nt2.29□□□□□ -2.04
SLM3Q12093 VHR1YIL056W 1923 nt2.29□□□□□ -2.04
SLM3Q12093 AMS1YGL156W 3252 nt2.28□□□□□ -2.04
SLM3Q12093 ESC2YDR363W 1371 nt2.28□□□□□ -2.04
SLM3Q12093 FLO11YIR019C 4104 nt2.28□□□□□ -2.04
SLM3Q12093 FIN1YDR130C 876 nt2.28□□□□□ -2.04
SLM3Q12093 RSM18YER050C 417 nt2.28□□□□□ -2.04
SLM3Q12093 TDA2YER071C 381 nt2.28□□□□□ -2.04
SLM3Q12093 MND1YGL183C 660 nt2.28□□□□□ -2.04
SLM3Q12093 YKL123WYKL123W 381 nt2.28□□□□□ -2.04
SLM3Q12093 NIC96YFR002W 2520 nt2.28□□□□□ -2.04
SLM3Q12093 SKT5YBL061C 2091 nt2.27□□□□□ -2.05
SLM3Q12093 YBT1YLL048C 4986 nt2.27□□□□□ -2.05
SLM3Q12093 YFL012W-AYFL012W-A 375 nt2.27□□□□□ -2.05
SLM3Q12093 SYM1YLR251W 594 nt2.27□□□□□ -2.05
SLM3Q12093 ESF2YNR054C 951 nt2.27□□□□□ -2.05
SLM3Q12093 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt2.27□□□□□ -2.05
SLM3Q12093 MUD1YBR119W 897 nt2.27□□□□□ -2.05
SLM3Q12093 IRA2YOL081W 9240 nt2.27□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.4 ms