Protein–RNA interactions for Protein: P48729

CSNK1A1, Casein kinase I isoform alpha, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1A1P48729 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK1A1P48729 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK1A1P48729 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK1A1P48729 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK1A1P48729 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK1A1P48729 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK1A1P48729 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK1A1P48729 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK1A1P48729 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK1A1P48729 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK1A1P48729 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK1A1P48729 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK1A1P48729 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK1A1P48729 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK1A1P48729 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK1A1P48729 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK1A1P48729 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK1A1P48729 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK1A1P48729 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK1A1P48729 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK1A1P48729 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK1A1P48729 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK1A1P48729 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK1A1P48729 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK1A1P48729 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CSNK1A1P48729 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CSNK1A1P48729 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CSNK1A1P48729 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CSNK1A1P48729 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CSNK1A1P48729 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CSNK1A1P48729 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CSNK1A1P48729 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CSNK1A1P48729 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK1A1P48729 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK1A1P48729 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK1A1P48729 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK1A1P48729 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK1A1P48729 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK1A1P48729 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK1A1P48729 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK1A1P48729 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK1A1P48729 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK1A1P48729 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK1A1P48729 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK1A1P48729 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK1A1P48729 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK1A1P48729 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK1A1P48729 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK1A1P48729 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK1A1P48729 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK1A1P48729 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK1A1P48729 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK1A1P48729 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK1A1P48729 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK1A1P48729 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK1A1P48729 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK1A1P48729 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK1A1P48729 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK1A1P48729 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK1A1P48729 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK1A1P48729 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK1A1P48729 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK1A1P48729 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK1A1P48729 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK1A1P48729 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK1A1P48729 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK1A1P48729 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK1A1P48729 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK1A1P48729 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK1A1P48729 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK1A1P48729 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK1A1P48729 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK1A1P48729 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK1A1P48729 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK1A1P48729 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK1A1P48729 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK1A1P48729 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK1A1P48729 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK1A1P48729 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK1A1P48729 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK1A1P48729 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK1A1P48729 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK1A1P48729 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK1A1P48729 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK1A1P48729 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK1A1P48729 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK1A1P48729 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK1A1P48729 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK1A1P48729 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK1A1P48729 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK1A1P48729 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK1A1P48729 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK1A1P48729 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK1A1P48729 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK1A1P48729 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK1A1P48729 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK1A1P48729 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK1A1P48729 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK1A1P48729 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK1A1P48729 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms