Protein–RNA interactions for Protein: P39959

YER130C, Zinc finger protein YER130C, yeastyeast

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YER130CP39959 RPL23AYBL087C 414 nt2.82□□□□□ -1.96
YER130CP39959 NMA111YNL123W 2994 nt2.81□□□□□ -1.96
YER130CP39959 IRC2YDR112W 309 nt2.81□□□□□ -1.96
YER130CP39959 YDR114CYDR114C 303 nt2.81□□□□□ -1.96
YER130CP39959 YER084W-AYER084W-A 513 nt2.81□□□□□ -1.96
YER130CP39959 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.81□□□□□ -1.96
YER130CP39959 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.81□□□□□ -1.96
YER130CP39959 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.81□□□□□ -1.96
YER130CP39959 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.81□□□□□ -1.96
YER130CP39959 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.81□□□□□ -1.96
YER130CP39959 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.81□□□□□ -1.96
YER130CP39959 MCR1YKL150W 909 nt2.81□□□□□ -1.96
YER130CP39959 YLR334CYLR334C 381 nt2.81□□□□□ -1.96
YER130CP39959 YNL043CYNL043C 321 nt2.81□□□□□ -1.96
YER130CP39959 IGO1YNL157W 507 nt2.81□□□□□ -1.96
YER130CP39959 YNR021WYNR021W 1215 nt2.81□□□□□ -1.96
YER130CP39959 LCL1YPL056C 306 nt2.81□□□□□ -1.96
YER130CP39959 BI4Q0120 1917 nt2.81□□□□□ -1.96
YER130CP39959 BNR1YIL159W 4128 nt2.8□□□□□ -1.96
YER130CP39959 DUF1YOL087C 3351 nt2.8□□□□□ -1.96
YER130CP39959 YKL100CYKL100C 1764 nt2.8□□□□□ -1.96
YER130CP39959 DBF20YPR111W 1695 nt2.8□□□□□ -1.96
YER130CP39959 GIM4YEL003W 336 nt2.8□□□□□ -1.96
YER130CP39959 BI2Q0110 1272 nt2.8□□□□□ -1.96
YER130CP39959 ECL1YGR146C 636 nt2.8□□□□□ -1.96
YER130CP39959 YAP3YHL009C 993 nt2.8□□□□□ -1.96
YER130CP39959 YKL044WYKL044W 321 nt2.8□□□□□ -1.96
YER130CP39959 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt2.8□□□□□ -1.96
YER130CP39959 DDR48YMR173W 1293 nt2.8□□□□□ -1.96
YER130CP39959 RIO2YNL207W 1278 nt2.8□□□□□ -1.96
YER130CP39959 YPL261CYPL261C 309 nt2.8□□□□□ -1.96
YER130CP39959 YPR012WYPR012W 255 nt2.8□□□□□ -1.96
YER130CP39959 PTP3YER075C 2787 nt2.79□□□□□ -1.96
YER130CP39959 VHR2YER064C 1518 nt2.79□□□□□ -1.96
YER130CP39959 MAL33YBR297W 1407 nt2.79□□□□□ -1.96
YER130CP39959 RIX1YHR197W 2292 nt2.79□□□□□ -1.96
YER130CP39959 YDL009CYDL009C 324 nt2.79□□□□□ -1.96
YER130CP39959 RTR2YDR066C 591 nt2.79□□□□□ -1.96
YER130CP39959 RMT2YDR465C 1239 nt2.79□□□□□ -1.96
YER130CP39959 DFG10YIL049W 762 nt2.79□□□□□ -1.96
YER130CP39959 YIR036W-AYIR036W-A 402 nt2.79□□□□□ -1.96
YER130CP39959 CDC123YLR215C 1083 nt2.79□□□□□ -1.96
YER130CP39959 CTK3YML112W 891 nt2.79□□□□□ -1.96
YER130CP39959 SEN15YMR059W 387 nt2.79□□□□□ -1.96
YER130CP39959 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt2.79□□□□□ -1.96
YER130CP39959 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt2.79□□□□□ -1.96
YER130CP39959 YNL046WYNL046W 519 nt2.79□□□□□ -1.96
YER130CP39959 YOR050CYOR050C 348 nt2.79□□□□□ -1.96
YER130CP39959 OST2YOR103C 393 nt2.79□□□□□ -1.96
YER130CP39959 RRD2YPL152W 1077 nt2.79□□□□□ -1.96
YER130CP39959 ARR2YPR200C 393 nt2.79□□□□□ -1.96
YER130CP39959 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt2.78□□□□□ -1.96
YER130CP39959 DAD2YKR083C 402 nt2.78□□□□□ -1.96
YER130CP39959 YBR209WYBR209W 318 nt2.78□□□□□ -1.96
YER130CP39959 CYR1YJL005W 6081 nt2.78□□□□□ -1.96
YER130CP39959 RIF1YBR275C 5751 nt2.78□□□□□ -1.96
YER130CP39959 SSP1YHR184W 1716 nt2.77□□□□□ -1.97
YER130CP39959 YCR064CYCR064C 411 nt2.77□□□□□ -1.97
YER130CP39959 CBS1YDL069C 690 nt2.77□□□□□ -1.97
YER130CP39959 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt2.77□□□□□ -1.97
YER130CP39959 AGA2YGL032C 264 nt2.77□□□□□ -1.97
YER130CP39959 BAT1YHR208W 1182 nt2.77□□□□□ -1.97
YER130CP39959 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.77□□□□□ -1.97
YER130CP39959 HRI1YLR301W 735 nt2.77□□□□□ -1.97
YER130CP39959 RPS12YOR369C 432 nt2.77□□□□□ -1.97
YER130CP39959 ALY1YKR021W 2748 nt2.77□□□□□ -1.97
YER130CP39959 ARK1YNL020C 1917 nt2.77□□□□□ -1.97
YER130CP39959 NDT80YHR124W 1884 nt2.77□□□□□ -1.97
YER130CP39959 STE11YLR362W 2154 nt2.77□□□□□ -1.97
YER130CP39959 FRE2YKL220C 2136 nt2.77□□□□□ -1.97
YER130CP39959 ATP22YDR350C 2055 nt2.77□□□□□ -1.97
YER130CP39959 MES1YGR264C 2256 nt2.76□□□□□ -1.97
YER130CP39959 PDC2YDR081C 2778 nt2.76□□□□□ -1.97
YER130CP39959 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt2.76□□□□□ -1.97
YER130CP39959 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt2.76□□□□□ -1.97
YER130CP39959 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt2.76□□□□□ -1.97
YER130CP39959 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt2.76□□□□□ -1.97
YER130CP39959 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt2.76□□□□□ -1.97
YER130CP39959 YCL019WYCL019W 5313 nt2.76□□□□□ -1.97
YER130CP39959 YCR090CYCR090C 549 nt2.76□□□□□ -1.97
YER130CP39959 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt2.76□□□□□ -1.97
YER130CP39959 GPI14YJR013W 1212 nt2.76□□□□□ -1.97
YER130CP39959 NOP15YNL110C 663 nt2.76□□□□□ -1.97
YER130CP39959 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt2.76□□□□□ -1.97
YER130CP39959 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt2.76□□□□□ -1.97
YER130CP39959 RSN1YMR266W 2862 nt2.76□□□□□ -1.97
YER130CP39959 SSF2YDR312W 1362 nt2.75□□□□□ -1.97
YER130CP39959 NET1YJL076W 3570 nt2.75□□□□□ -1.97
YER130CP39959 PPN1YDR452W 2025 nt2.75□□□□□ -1.97
YER130CP39959 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.75□□□□□ -1.97
YER130CP39959 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt2.75□□□□□ -1.97
YER130CP39959 PUF6YDR496C 1971 nt2.74□□□□□ -1.97
YER130CP39959 AHC2YCR082W 387 nt2.74□□□□□ -1.97
YER130CP39959 YER091C-AYER091C-A 222 nt2.74□□□□□ -1.97
YER130CP39959 RTS3YGR161C 792 nt2.74□□□□□ -1.97
YER130CP39959 YGR242WYGR242W 309 nt2.74□□□□□ -1.97
YER130CP39959 OTU2YHL013C 924 nt2.74□□□□□ -1.97
YER130CP39959 BIG1YHR101C 1008 nt2.74□□□□□ -1.97
YER130CP39959 NFU1YKL040C 771 nt2.74□□□□□ -1.97
YER130CP39959 ARV1YLR242C 966 nt2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 7.5 ms