Protein–RNA interactions for Protein: Q3C1V9

Putative uncharacterized protein ENSP00000334305, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3C1V9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q3C1V9 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q3C1V9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q3C1V9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q3C1V9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q3C1V9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q3C1V9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q3C1V9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q3C1V9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q3C1V9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q3C1V9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q3C1V9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q3C1V9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q3C1V9 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q3C1V9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q3C1V9 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q3C1V9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Q3C1V9 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Q3C1V9 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Q3C1V9 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q3C1V9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q3C1V9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q3C1V9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q3C1V9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q3C1V9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q3C1V9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q3C1V9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q3C1V9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q3C1V9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q3C1V9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q3C1V9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q3C1V9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q3C1V9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q3C1V9 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Q3C1V9 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q3C1V9 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q3C1V9 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q3C1V9 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q3C1V9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q3C1V9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q3C1V9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q3C1V9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q3C1V9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q3C1V9 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q3C1V9 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q3C1V9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q3C1V9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q3C1V9 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q3C1V9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q3C1V9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q3C1V9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q3C1V9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q3C1V9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Q3C1V9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Q3C1V9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Q3C1V9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Q3C1V9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Q3C1V9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Q3C1V9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Q3C1V9 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q3C1V9 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q3C1V9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q3C1V9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q3C1V9 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q3C1V9 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Q3C1V9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q3C1V9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q3C1V9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q3C1V9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q3C1V9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q3C1V9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q3C1V9 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q3C1V9 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q3C1V9 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q3C1V9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q3C1V9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q3C1V9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q3C1V9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q3C1V9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q3C1V9 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q3C1V9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q3C1V9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q3C1V9 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q3C1V9 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q3C1V9 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q3C1V9 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q3C1V9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q3C1V9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q3C1V9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q3C1V9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q3C1V9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q3C1V9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q3C1V9 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q3C1V9 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q3C1V9 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q3C1V9 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q3C1V9 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q3C1V9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q3C1V9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q3C1V9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.8 ms