Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CDKN3Q16667 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDKN3Q16667 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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