Protein–RNA interactions for Protein: Q12193

TY1B-BR, Transposon Ty1-BR Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 1,756 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-BRQ12193 YOR019WYOR019W 2193 nt1.39□□□□□ -2.19
TY1B-BRQ12193 GYL1YMR192W 2163 nt1.38□□□□□ -2.19
TY1B-BRQ12193 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt1.38□□□□□ -2.19
TY1B-BRQ12193 RDN58-1RDN58-1 158 nt1.38□□□□□ -2.19
TY1B-BRQ12193 RDN58-2RDN58-2 158 nt1.38□□□□□ -2.19
TY1B-BRQ12193 COS1YNL336W 1146 nt1.38□□□□□ -2.19
TY1B-BRQ12193 YOL035CYOL035C 303 nt1.38□□□□□ -2.19
TY1B-BRQ12193 SYO1YDL063C 1863 nt1.37□□□□□ -2.19
TY1B-BRQ12193 CDC10YCR002C 969 nt1.37□□□□□ -2.19
TY1B-BRQ12193 WIP1YDR374W-A 270 nt1.37□□□□□ -2.19
TY1B-BRQ12193 YGR050CYGR050C 357 nt1.37□□□□□ -2.19
TY1B-BRQ12193 AAH1YNL141W 1044 nt1.37□□□□□ -2.19
TY1B-BRQ12193 NST1YNL091W 3723 nt1.37□□□□□ -2.19
TY1B-BRQ12193 CDC37YDR168W 1521 nt1.37□□□□□ -2.19
TY1B-BRQ12193 BAT1YHR208W 1182 nt1.36□□□□□ -2.19
TY1B-BRQ12193 YBR013CYBR013C 390 nt1.36□□□□□ -2.19
TY1B-BRQ12193 AIM11YER093C-A 414 nt1.36□□□□□ -2.19
TY1B-BRQ12193 YAL034C-BYAL034C-B 354 nt1.36□□□□□ -2.19
TY1B-BRQ12193 URA10YMR271C 684 nt1.36□□□□□ -2.19
TY1B-BRQ12193 YOL159CYOL159C 516 nt1.36□□□□□ -2.19
TY1B-BRQ12193 ERP4YOR016C 624 nt1.36□□□□□ -2.19
TY1B-BRQ12193 HCS1YKL017C 2052 nt1.36□□□□□ -2.19
TY1B-BRQ12193 TRL1YJL087C 2484 nt1.35□□□□□ -2.19
TY1B-BRQ12193 COG1YGL223C 1254 nt1.35□□□□□ -2.19
TY1B-BRQ12193 SNO1YMR095C 675 nt1.35□□□□□ -2.19
TY1B-BRQ12193 PMD1YER132C 5262 nt1.35□□□□□ -2.19
TY1B-BRQ12193 SKO1YNL167C 1944 nt1.35□□□□□ -2.19
TY1B-BRQ12193 BRE5YNR051C 1548 nt1.35□□□□□ -2.19
TY1B-BRQ12193 SPB4YFL002C 1821 nt1.34□□□□□ -2.19
TY1B-BRQ12193 BRO1YPL084W 2535 nt1.34□□□□□ -2.19
TY1B-BRQ12193 BUL2YML111W 2763 nt1.34□□□□□ -2.19
TY1B-BRQ12193 AIM18YHR198C 966 nt1.34□□□□□ -2.2
TY1B-BRQ12193 YPL073CYPL073C 486 nt1.34□□□□□ -2.2
TY1B-BRQ12193 AIM4YBR194W 372 nt1.34□□□□□ -2.2
TY1B-BRQ12193 RKM4YDR257C 1485 nt1.33□□□□□ -2.2
TY1B-BRQ12193 PAU3YCR104W 375 nt1.33□□□□□ -2.2
TY1B-BRQ12193 YLR050CYLR050C 486 nt1.33□□□□□ -2.2
TY1B-BRQ12193 YLR108CYLR108C 1458 nt1.32□□□□□ -2.2
TY1B-BRQ12193 NCE101YJL205C 162 nt1.32□□□□□ -2.2
TY1B-BRQ12193 EBP2YKL172W 1284 nt1.31□□□□□ -2.2
TY1B-BRQ12193 RPF2YKR081C 1035 nt1.31□□□□□ -2.2
TY1B-BRQ12193 YML009C-AYML009C-A 327 nt1.31□□□□□ -2.2
TY1B-BRQ12193 URA5YML106W 681 nt1.31□□□□□ -2.2
TY1B-BRQ12193 PEP12YOR036W 867 nt1.31□□□□□ -2.2
TY1B-BRQ12193 YCL076WYCL076W 744 nt1.31□□□□□ -2.2
TY1B-BRQ12193 UBC7YMR022W 498 nt1.31□□□□□ -2.2
TY1B-BRQ12193 SFG1YOR315W 1041 nt1.31□□□□□ -2.2
TY1B-BRQ12193 YDR340WYDR340W 303 nt1.3□□□□□ -2.2
TY1B-BRQ12193 HNT3YOR258W 654 nt1.3□□□□□ -2.2
TY1B-BRQ12193 ARF1YDL192W 546 nt1.29□□□□□ -2.2
TY1B-BRQ12193 YGR283CYGR283C 1026 nt1.29□□□□□ -2.2
TY1B-BRQ12193 YSY6YBR162W-A 198 nt1.29□□□□□ -2.2
TY1B-BRQ12193 RVS161YCR009C 798 nt1.29□□□□□ -2.2
TY1B-BRQ12193 YER087C-AYER087C-A 552 nt1.28□□□□□ -2.2
TY1B-BRQ12193 RPL34BYIL052C 366 nt1.28□□□□□ -2.2
TY1B-BRQ12193 SLY41YOR307C 1362 nt1.27□□□□□ -2.21
TY1B-BRQ12193 YDR170W-AYDR170W-A 1323 nt1.27□□□□□ -2.21
TY1B-BRQ12193 YGL262WYGL262W 528 nt1.27□□□□□ -2.21
TY1B-BRQ12193 YIL059CYIL059C 366 nt1.27□□□□□ -2.21
TY1B-BRQ12193 YKL069WYKL069W 543 nt1.27□□□□□ -2.21
TY1B-BRQ12193 THO2YNL139C 4794 nt1.27□□□□□ -2.21
TY1B-BRQ12193 NOP19YGR251W 591 nt1.26□□□□□ -2.21
TY1B-BRQ12193 YNL143CYNL143C 393 nt1.26□□□□□ -2.21
TY1B-BRQ12193 PNT1YOR266W 1272 nt1.26□□□□□ -2.21
TY1B-BRQ12193 DBF20YPR111W 1695 nt1.26□□□□□ -2.21
TY1B-BRQ12193 RSM22YKL155C 1887 nt1.26□□□□□ -2.21
TY1B-BRQ12193 YER066C-AYER066C-A 501 nt1.26□□□□□ -2.21
TY1B-BRQ12193 SEC4YFL005W 648 nt1.26□□□□□ -2.21
TY1B-BRQ12193 TIM21YGR033C 720 nt1.26□□□□□ -2.21
TY1B-BRQ12193 YCR007CYCR007C 720 nt1.25□□□□□ -2.21
TY1B-BRQ12193 DPP1YDR284C 870 nt1.25□□□□□ -2.21
TY1B-BRQ12193 RPS17BYDR447C 411 nt1.25□□□□□ -2.21
TY1B-BRQ12193 YJL202CYJL202C 348 nt1.25□□□□□ -2.21
TY1B-BRQ12193 LSM2YBL026W 288 nt1.25□□□□□ -2.21
TY1B-BRQ12193 ERD2YBL040C 660 nt1.25□□□□□ -2.21
TY1B-BRQ12193 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt1.25□□□□□ -2.21
TY1B-BRQ12193 YOR218CYOR218C 420 nt1.25□□□□□ -2.21
TY1B-BRQ12193 ASG1YIL130W 2895 nt1.25□□□□□ -2.21
TY1B-BRQ12193 YBR138CYBR138C 1575 nt1.24□□□□□ -2.21
TY1B-BRQ12193 YDR521WYDR521W 336 nt1.24□□□□□ -2.21
TY1B-BRQ12193 PET130YJL023C 1044 nt1.24□□□□□ -2.21
TY1B-BRQ12193 YOR082CYOR082C 342 nt1.24□□□□□ -2.21
TY1B-BRQ12193 YBR292CYBR292C 372 nt1.24□□□□□ -2.21
TY1B-BRQ12193 TBS1YBR150C 3285 nt1.24□□□□□ -2.21
TY1B-BRQ12193 FIG2YCR089W 4830 nt1.24□□□□□ -2.21
TY1B-BRQ12193 YGL165CYGL165C 579 nt1.24□□□□□ -2.21
TY1B-BRQ12193 SEC21YNL287W 2808 nt1.24□□□□□ -2.21
TY1B-BRQ12193 CBF2YGR140W 2871 nt1.23□□□□□ -2.21
TY1B-BRQ12193 PIN4YBL051C 2007 nt1.23□□□□□ -2.21
TY1B-BRQ12193 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt1.23□□□□□ -2.21
TY1B-BRQ12193 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt1.23□□□□□ -2.21
TY1B-BRQ12193 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt1.23□□□□□ -2.21
TY1B-BRQ12193 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt1.23□□□□□ -2.21
TY1B-BRQ12193 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt1.23□□□□□ -2.21
TY1B-BRQ12193 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt1.23□□□□□ -2.21
TY1B-BRQ12193 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt1.23□□□□□ -2.21
TY1B-BRQ12193 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt1.23□□□□□ -2.21
TY1B-BRQ12193 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt1.23□□□□□ -2.21
TY1B-BRQ12193 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt1.23□□□□□ -2.21
TY1B-BRQ12193 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt1.23□□□□□ -2.21
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