Protein–RNA interactions for Protein: Q04437

YKU80, ATP-dependent DNA helicase II subunit 2, yeastyeast

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKU80Q04437 IRC2YDR112W 309 nt2.87□□□□□ -1.95
YKU80Q04437 AST2YER101C 1293 nt2.87□□□□□ -1.95
YKU80Q04437 RTS3YGR161C 792 nt2.87□□□□□ -1.95
YKU80Q04437 NOP19YGR251W 591 nt2.87□□□□□ -1.95
YKU80Q04437 YHL005CYHL005C 393 nt2.87□□□□□ -1.95
YKU80Q04437 YOR364WYOR364W 369 nt2.87□□□□□ -1.95
YKU80Q04437 YPR203WYPR203W 309 nt2.87□□□□□ -1.95
YKU80Q04437 DYN1YKR054C 12279 nt2.87□□□□□ -1.95
YKU80Q04437 SSF1YHR066W 1362 nt2.87□□□□□ -1.95
YKU80Q04437 YDL009CYDL009C 324 nt2.86□□□□□ -1.95
YKU80Q04437 SYS1YJL004C 612 nt2.86□□□□□ -1.95
YKU80Q04437 HEH2YDR458C 1992 nt2.85□□□□□ -1.95
YKU80Q04437 MSB2YGR014W 3921 nt2.85□□□□□ -1.95
YKU80Q04437 HNT1YDL125C 477 nt2.85□□□□□ -1.95
YKU80Q04437 YJR141WYJR141W 1044 nt2.85□□□□□ -1.95
YKU80Q04437 YNL046WYNL046W 519 nt2.85□□□□□ -1.95
YKU80Q04437 COQ10YOL008W 624 nt2.85□□□□□ -1.95
YKU80Q04437 YPL034WYPL034W 498 nt2.85□□□□□ -1.95
YKU80Q04437 MEI5YPL121C 669 nt2.85□□□□□ -1.95
YKU80Q04437 YOR343W-AYOR343W-A 1317 nt2.85□□□□□ -1.95
YKU80Q04437 CAF120YNL278W 3183 nt2.85□□□□□ -1.95
YKU80Q04437 YIL169CYIL169C 2988 nt2.85□□□□□ -1.95
YKU80Q04437 SIN3YOL004W 4611 nt2.84□□□□□ -1.95
YKU80Q04437 SKT5YBL061C 2091 nt2.84□□□□□ -1.95
YKU80Q04437 NPR3YHL023C 3441 nt2.84□□□□□ -1.95
YKU80Q04437 DNL4YOR005C 2835 nt2.84□□□□□ -1.95
YKU80Q04437 snR76snR76 109 nt2.84□□□□□ -1.95
YKU80Q04437 YDR090CYDR090C 933 nt2.84□□□□□ -1.95
YKU80Q04437 RPS17BYDR447C 411 nt2.84□□□□□ -1.95
YKU80Q04437 YGR293CYGR293C 462 nt2.84□□□□□ -1.95
YKU80Q04437 OTU2YHL013C 924 nt2.84□□□□□ -1.95
YKU80Q04437 ILM1YJR118C 612 nt2.84□□□□□ -1.95
YKU80Q04437 YLR252WYLR252W 306 nt2.84□□□□□ -1.95
YKU80Q04437 YBT1YLL048C 4986 nt2.84□□□□□ -1.95
YKU80Q04437 YPL216WYPL216W 3309 nt2.84□□□□□ -1.96
YKU80Q04437 RIF1YBR275C 5751 nt2.84□□□□□ -1.96
YKU80Q04437 BI4Q0120 1917 nt2.83□□□□□ -1.96
YKU80Q04437 BNR1YIL159W 4128 nt2.83□□□□□ -1.96
YKU80Q04437 CRD1YDL142C 852 nt2.83□□□□□ -1.96
YKU80Q04437 MET32YDR253C 576 nt2.83□□□□□ -1.96
YKU80Q04437 TIF35YDR429C 825 nt2.83□□□□□ -1.96
YKU80Q04437 SPO13YHR014W 876 nt2.83□□□□□ -1.96
YKU80Q04437 STE18YJR086W 333 nt2.83□□□□□ -1.96
YKU80Q04437 AFB1YLR040C 675 nt2.83□□□□□ -1.96
YKU80Q04437 HHT2YNL031C 411 nt2.83□□□□□ -1.96
YKU80Q04437 YOR073W-AYOR073W-A 234 nt2.83□□□□□ -1.96
YKU80Q04437 YPR096CYPR096C 303 nt2.83□□□□□ -1.96
YKU80Q04437 TRS20YBR254C 528 nt2.83□□□□□ -1.96
YKU80Q04437 MMS1YPR164W 4224 nt2.83□□□□□ -1.96
YKU80Q04437 PUF4YGL014W 2667 nt2.83□□□□□ -1.96
YKU80Q04437 SPR3YGR059W 1539 nt2.83□□□□□ -1.96
YKU80Q04437 SNF12YNR023W 1701 nt2.82□□□□□ -1.96
YKU80Q04437 KEL2YGR238C 2649 nt2.82□□□□□ -1.96
YKU80Q04437 YDR209CYDR209C 414 nt2.82□□□□□ -1.96
YKU80Q04437 YGL015CYGL015C 393 nt2.82□□□□□ -1.96
YKU80Q04437 YAL026C-AYAL026C-A 438 nt2.82□□□□□ -1.96
YKU80Q04437 YLR302CYLR302C 363 nt2.82□□□□□ -1.96
YKU80Q04437 RPL6AYML073C 531 nt2.82□□□□□ -1.96
YKU80Q04437 SWS2YNL081C 432 nt2.82□□□□□ -1.96
YKU80Q04437 CRS5YOR031W 210 nt2.82□□□□□ -1.96
YKU80Q04437 RCN2YOR220W 798 nt2.82□□□□□ -1.96
YKU80Q04437 GEA1YJR031C 4227 nt2.82□□□□□ -1.96
YKU80Q04437 RGC1YPR115W 3252 nt2.81□□□□□ -1.96
YKU80Q04437 PRM8YGL053W 714 nt2.81□□□□□ -1.96
YKU80Q04437 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt2.81□□□□□ -1.96
YKU80Q04437 CIC1YHR052W 1131 nt2.81□□□□□ -1.96
YKU80Q04437 YIL174WYIL174W 228 nt2.81□□□□□ -1.96
YKU80Q04437 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt2.81□□□□□ -1.96
YKU80Q04437 BER1YLR412W 825 nt2.81□□□□□ -1.96
YKU80Q04437 UBX4YMR067C 1251 nt2.81□□□□□ -1.96
YKU80Q04437 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt2.81□□□□□ -1.96
YKU80Q04437 FPR1YNL135C 345 nt2.81□□□□□ -1.96
YKU80Q04437 ISU1YPL135W 498 nt2.81□□□□□ -1.96
YKU80Q04437 SSF2YDR312W 1362 nt2.81□□□□□ -1.96
YKU80Q04437 ESC1YMR219W 4977 nt2.8□□□□□ -1.96
YKU80Q04437 GPI17YDR434W 1605 nt2.8□□□□□ -1.96
YKU80Q04437 YDL016CYDL016C 303 nt2.8□□□□□ -1.96
YKU80Q04437 GPI19YDR437W 423 nt2.8□□□□□ -1.96
YKU80Q04437 YER175W-AYER175W-A 165 nt2.8□□□□□ -1.96
YKU80Q04437 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt2.8□□□□□ -1.96
YKU80Q04437 GIC1YHR061C 945 nt2.8□□□□□ -1.96
YKU80Q04437 EAF6YJR082C 342 nt2.8□□□□□ -1.96
YKU80Q04437 YNL179CYNL179C 438 nt2.8□□□□□ -1.96
YKU80Q04437 NSL1YPL233W 651 nt2.8□□□□□ -1.96
YKU80Q04437 YBR085C-AYBR085C-A 258 nt2.8□□□□□ -1.96
YKU80Q04437 CYR1YJL005W 6081 nt2.8□□□□□ -1.96
YKU80Q04437 YIL166CYIL166C 1629 nt2.79□□□□□ -1.96
YKU80Q04437 YCR081C-AYCR081C-A 237 nt2.79□□□□□ -1.96
YKU80Q04437 ADK1YDR226W 669 nt2.79□□□□□ -1.96
YKU80Q04437 RAD6YGL058W 519 nt2.79□□□□□ -1.96
YKU80Q04437 YIR020CYIR020C 303 nt2.79□□□□□ -1.96
YKU80Q04437 PAU23YLR037C 375 nt2.79□□□□□ -1.96
YKU80Q04437 RPL19BYBL027W 570 nt2.79□□□□□ -1.96
YKU80Q04437 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt2.79□□□□□ -1.96
YKU80Q04437 TPS2YDR074W 2691 nt2.79□□□□□ -1.96
YKU80Q04437 ECM5YMR176W 4236 nt2.78□□□□□ -1.96
YKU80Q04437 PAM1YDR251W 2493 nt2.78□□□□□ -1.96
YKU80Q04437 GDI1YER136W 1356 nt2.78□□□□□ -1.96
YKU80Q04437 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt2.78□□□□□ -1.96
YKU80Q04437 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt2.78□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 31.1 ms