Protein–RNA interactions for Protein: P53962

YNL035C, Uncharacterized WD repeat-containing protein YNL035C, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YNL035CP53962 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt5.3□□□□□ -1.56
YNL035CP53962 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt5.3□□□□□ -1.56
YNL035CP53962 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt5.3□□□□□ -1.56
YNL035CP53962 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt5.3□□□□□ -1.56
YNL035CP53962 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt5.3□□□□□ -1.56
YNL035CP53962 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt5.3□□□□□ -1.56
YNL035CP53962 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt5.3□□□□□ -1.56
YNL035CP53962 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt5.3□□□□□ -1.56
YNL035CP53962 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt5.3□□□□□ -1.56
YNL035CP53962 MIM2YLR099W-A 264 nt5.3□□□□□ -1.56
YNL035CP53962 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt5.3□□□□□ -1.56
YNL035CP53962 TYW1YPL207W 2433 nt5.3□□□□□ -1.56
YNL035CP53962 MSH1YHR120W 2880 nt5.3□□□□□ -1.56
YNL035CP53962 NUP116YMR047C 3342 nt5.29□□□□□ -1.56
YNL035CP53962 NAN1YPL126W 2691 nt5.29□□□□□ -1.56
YNL035CP53962 PRS5YOL061W 1491 nt5.29□□□□□ -1.56
YNL035CP53962 RPS24AYER074W 408 nt5.29□□□□□ -1.56
YNL035CP53962 MVB12YGR206W 306 nt5.29□□□□□ -1.56
YNL035CP53962 ROT2YBR229C 2865 nt5.29□□□□□ -1.56
YNL035CP53962 STE20YHL007C 2820 nt5.29□□□□□ -1.56
YNL035CP53962 SSP1YHR184W 1716 nt5.28□□□□□ -1.56
YNL035CP53962 SNT2YGL131C 4212 nt5.28□□□□□ -1.56
YNL035CP53962 PRP43YGL120C 2304 nt5.28□□□□□ -1.56
YNL035CP53962 PAU23YLR037C 375 nt5.28□□□□□ -1.56
YNL035CP53962 RPL16BYNL069C 597 nt5.28□□□□□ -1.56
YNL035CP53962 PFY1YOR122C 381 nt5.28□□□□□ -1.56
YNL035CP53962 YBR099CYBR099C 384 nt5.28□□□□□ -1.56
YNL035CP53962 RNA14YMR061W 2034 nt5.28□□□□□ -1.56
YNL035CP53962 VPS41YDR080W 2979 nt5.28□□□□□ -1.56
YNL035CP53962 FPK1YNR047W 2682 nt5.27□□□□□ -1.57
YNL035CP53962 CPS1YJL172W 1731 nt5.27□□□□□ -1.57
YNL035CP53962 YKL111CYKL111C 336 nt5.27□□□□□ -1.57
YNL035CP53962 SSQ1YLR369W 1974 nt5.26□□□□□ -1.57
YNL035CP53962 ARF1YDL192W 546 nt5.26□□□□□ -1.57
YNL035CP53962 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt5.26□□□□□ -1.57
YNL035CP53962 TIM13YGR181W 318 nt5.26□□□□□ -1.57
YNL035CP53962 LSM1YJL124C 519 nt5.26□□□□□ -1.57
YNL035CP53962 YKR033CYKR033C 426 nt5.26□□□□□ -1.57
YNL035CP53962 RPS22BYLR367W 393 nt5.26□□□□□ -1.57
YNL035CP53962 LAS21YJL062W 2493 nt5.26□□□□□ -1.57
YNL035CP53962 PCA1YBR295W 3651 nt5.26□□□□□ -1.57
YNL035CP53962 REV1YOR346W 2958 nt5.26□□□□□ -1.57
YNL035CP53962 SSH4YKL124W 1740 nt5.26□□□□□ -1.57
YNL035CP53962 FRE1YLR214W 2061 nt5.25□□□□□ -1.57
YNL035CP53962 THI21YPL258C 1656 nt5.25□□□□□ -1.57
YNL035CP53962 YDR250CYDR250C 276 nt5.25□□□□□ -1.57
YNL035CP53962 YDR442WYDR442W 393 nt5.25□□□□□ -1.57
YNL035CP53962 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt5.25□□□□□ -1.57
YNL035CP53962 RPL36AYMR194W 303 nt5.25□□□□□ -1.57
YNL035CP53962 SUI1YNL244C 327 nt5.25□□□□□ -1.57
YNL035CP53962 CSE2YNR010W 450 nt5.25□□□□□ -1.57
YNL035CP53962 SMP3YOR149C 1551 nt5.25□□□□□ -1.57
YNL035CP53962 KAR2YJL034W 2049 nt5.24□□□□□ -1.57
YNL035CP53962 YDR338CYDR338C 2088 nt5.24□□□□□ -1.57
YNL035CP53962 ULI1YFR026C 510 nt5.24□□□□□ -1.57
YNL035CP53962 RPL6AYML073C 531 nt5.24□□□□□ -1.57
YNL035CP53962 RPB11YOL005C 363 nt5.24□□□□□ -1.57
YNL035CP53962 snR35snR35 204 nt5.24□□□□□ -1.57
YNL035CP53962 YPL260WYPL260W 1656 nt5.24□□□□□ -1.57
YNL035CP53962 SRP72YPL210C 1923 nt5.23□□□□□ -1.57
YNL035CP53962 PTR3YFR029W 2037 nt5.23□□□□□ -1.57
YNL035CP53962 SAE3YHR079C-A 276 nt5.23□□□□□ -1.57
YNL035CP53962 LSM2YBL026W 288 nt5.23□□□□□ -1.57
YNL035CP53962 YLR001CYLR001C 2589 nt5.23□□□□□ -1.57
YNL035CP53962 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt5.22□□□□□ -1.57
YNL035CP53962 YJL022WYJL022W 309 nt5.22□□□□□ -1.57
YNL035CP53962 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt5.22□□□□□ -1.57
YNL035CP53962 HHT1YBR010W 411 nt5.22□□□□□ -1.57
YNL035CP53962 NHP6AYPR052C 282 nt5.22□□□□□ -1.57
YNL035CP53962 ATP22YDR350C 2055 nt5.22□□□□□ -1.57
YNL035CP53962 SKM1YOL113W 1968 nt5.22□□□□□ -1.57
YNL035CP53962 SEC5YDR166C 2916 nt5.21□□□□□ -1.57
YNL035CP53962 DNM1YLL001W 2274 nt5.21□□□□□ -1.58
YNL035CP53962 PMA1YGL008C 2757 nt5.21□□□□□ -1.58
YNL035CP53962 YEL073CYEL073C 324 nt5.21□□□□□ -1.58
YNL035CP53962 YHR212CYHR212C 336 nt5.21□□□□□ -1.58
YNL035CP53962 YAR060CYAR060C 336 nt5.21□□□□□ -1.58
YNL035CP53962 RPL32YBL092W 393 nt5.21□□□□□ -1.58
YNL035CP53962 SEC39YLR440C 2130 nt5.21□□□□□ -1.58
YNL035CP53962 APC1YNL172W 5247 nt5.2□□□□□ -1.58
YNL035CP53962 RPL37AYLR185W 267 nt5.2□□□□□ -1.58
YNL035CP53962 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt5.2□□□□□ -1.58
YNL035CP53962 YOR034C-AYOR034C-A 243 nt5.2□□□□□ -1.58
YNL035CP53962 KRI1YNL308C 1776 nt5.19□□□□□ -1.58
YNL035CP53962 YGR250CYGR250C 2346 nt5.19□□□□□ -1.58
YNL035CP53962 SGF11YPL047W 300 nt5.19□□□□□ -1.58
YNL035CP53962 PIG1YLR273C 1947 nt5.19□□□□□ -1.58
YNL035CP53962 POL12YBL035C 2118 nt5.18□□□□□ -1.58
YNL035CP53962 HDA3YPR179C 1968 nt5.18□□□□□ -1.58
YNL035CP53962 DNF2YDR093W 4839 nt5.18□□□□□ -1.58
YNL035CP53962 AIM9YER080W 1884 nt5.18□□□□□ -1.58
YNL035CP53962 RPS29BYDL061C 171 nt5.18□□□□□ -1.58
YNL035CP53962 VAM7YGL212W 951 nt5.18□□□□□ -1.58
YNL035CP53962 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt5.18□□□□□ -1.58
YNL035CP53962 NKP2YLR315W 462 nt5.18□□□□□ -1.58
YNL035CP53962 HAP1YLR256W 4509 nt5.18□□□□□ -1.58
YNL035CP53962 AIP1YMR092C 1848 nt5.18□□□□□ -1.58
YNL035CP53962 YDR230WYDR230W 348 nt5.17□□□□□ -1.58
YNL035CP53962 ELM1YKL048C 1923 nt5.17□□□□□ -1.58
YNL035CP53962 FKH2YNL068C 2589 nt5.16□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 31.8 ms