Protein–RNA interactions for Protein: Q2MV58

TCTN1, Tectonic-1, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCTN1Q2MV58 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCTN1Q2MV58 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCTN1Q2MV58 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCTN1Q2MV58 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCTN1Q2MV58 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCTN1Q2MV58 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TCTN1Q2MV58 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TCTN1Q2MV58 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCTN1Q2MV58 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TCTN1Q2MV58 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCTN1Q2MV58 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCTN1Q2MV58 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCTN1Q2MV58 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCTN1Q2MV58 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCTN1Q2MV58 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCTN1Q2MV58 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCTN1Q2MV58 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCTN1Q2MV58 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCTN1Q2MV58 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCTN1Q2MV58 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCTN1Q2MV58 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCTN1Q2MV58 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCTN1Q2MV58 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCTN1Q2MV58 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCTN1Q2MV58 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCTN1Q2MV58 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCTN1Q2MV58 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCTN1Q2MV58 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCTN1Q2MV58 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCTN1Q2MV58 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCTN1Q2MV58 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCTN1Q2MV58 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCTN1Q2MV58 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCTN1Q2MV58 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCTN1Q2MV58 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCTN1Q2MV58 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCTN1Q2MV58 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCTN1Q2MV58 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCTN1Q2MV58 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCTN1Q2MV58 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCTN1Q2MV58 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCTN1Q2MV58 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCTN1Q2MV58 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCTN1Q2MV58 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCTN1Q2MV58 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCTN1Q2MV58 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCTN1Q2MV58 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCTN1Q2MV58 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCTN1Q2MV58 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCTN1Q2MV58 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TCTN1Q2MV58 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TCTN1Q2MV58 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCTN1Q2MV58 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TCTN1Q2MV58 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCTN1Q2MV58 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCTN1Q2MV58 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCTN1Q2MV58 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TCTN1Q2MV58 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TCTN1Q2MV58 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TCTN1Q2MV58 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCTN1Q2MV58 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCTN1Q2MV58 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCTN1Q2MV58 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCTN1Q2MV58 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCTN1Q2MV58 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCTN1Q2MV58 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCTN1Q2MV58 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCTN1Q2MV58 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCTN1Q2MV58 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCTN1Q2MV58 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TCTN1Q2MV58 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCTN1Q2MV58 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCTN1Q2MV58 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCTN1Q2MV58 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCTN1Q2MV58 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCTN1Q2MV58 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCTN1Q2MV58 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCTN1Q2MV58 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCTN1Q2MV58 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCTN1Q2MV58 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCTN1Q2MV58 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms