Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
BHLHA9Q7RTU4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms