Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF2E1P29083 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms