Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms