Protein–RNA interactions for Protein: Q12342

LDB17, Protein LDB17, yeastyeast

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LDB17Q12342 YER158W-AYER158W-A 216 nt2.64□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 YFH7YFR007W 1062 nt2.64□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 RPL27AYHR010W 411 nt2.64□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 YIL046W-AYIL046W-A 165 nt2.64□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 YKL115CYKL115C 393 nt2.64□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 ADI1YMR009W 540 nt2.64□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 MRPL33YMR286W 261 nt2.64□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 MIC27YNL100W 705 nt2.64□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 SRL4YPL033C 846 nt2.64□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 BNR1YIL159W 4128 nt2.64□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 IKI3YLR384C 4050 nt2.64□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 YDR061WYDR061W 1620 nt2.64□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 YNL193WYNL193W 1677 nt2.63□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.63□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 MUB1YMR100W 1863 nt2.63□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 UBC13YDR092W 462 nt2.63□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 ATC1YDR184C 885 nt2.63□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 DIG2YDR480W 972 nt2.63□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 VAB2YEL005C 849 nt2.63□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 STE2YFL026W 1296 nt2.63□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 RSR1YGR152C 819 nt2.63□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 GOS1YHL031C 672 nt2.63□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 EST3YIL009C-A 546 nt2.63□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 GPX1YKL026C 504 nt2.63□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 RPC25YKL144C 639 nt2.63□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 GCY1YOR120W 939 nt2.63□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 SPR2YOR214C 711 nt2.63□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 LCL1YPL056C 306 nt2.63□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 PIG2YIL045W 1617 nt2.63□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 PDS5YMR076C 3834 nt2.63□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 FKS3YMR306W 5358 nt2.62□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 MST27YGL051W 705 nt2.62□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 SYS1YJL004C 612 nt2.62□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 YLR050CYLR050C 486 nt2.62□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 PDR17YNL264C 1053 nt2.62□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 SME1YOR159C 285 nt2.62□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 YBR287WYBR287W 1284 nt2.62□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 FIR1YER032W 2631 nt2.62□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 ESA1YOR244W 1338 nt2.62□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 BCK1YJL095W 4437 nt2.62□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 YPL216WYPL216W 3309 nt2.62□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 ISW1YBR245C 3390 nt2.61□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 SRO77YBL106C 3033 nt2.61□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 BIT61YJL058C 1632 nt2.61□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 YBT1YLL048C 4986 nt2.61□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 ICR1ICR1 3199 nt2.61□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 HLR1YDR528W 1272 nt2.61□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 DSE2YHR143W 978 nt2.61□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 RNR2YJL026W 1200 nt2.61□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 RPL6BYLR448W 531 nt2.61□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 KAR4YCL055W 1008 nt2.61□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 YBL005W-AYBL005W-A 1323 nt2.61□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 ARP5YNL059C 2268 nt2.61□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 HOP1YIL072W 1818 nt2.61□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 HAA1YPR008W 2085 nt2.61□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 KEL2YGR238C 2649 nt2.6□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 DBF20YPR111W 1695 nt2.6□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 SIN3YOL004W 4611 nt2.6□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 VAC8YEL013W 1737 nt2.6□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 YDL032WYDL032W 312 nt2.6□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 snR83snR83 306 nt2.6□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 NRG1YDR043C 696 nt2.6□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 YJL114WYJL114W 681 nt2.6□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 SFT1YKL006C-A 294 nt2.6□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 CAP1YKL007W 807 nt2.6□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 YPT52YKR014C 705 nt2.6□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 SRL3YKR091W 741 nt2.6□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 FAR3YMR052W 615 nt2.6□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 RPL23AYBL087C 414 nt2.6□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 snR35snR35 204 nt2.6□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 YDR170W-AYDR170W-A 1323 nt2.6□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 YMR046CYMR046C 1323 nt2.6□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 YNL284C-AYNL284C-A 1323 nt2.6□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 TOP2YNL088W 4287 nt2.6□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 SYO1YDL063C 1863 nt2.6□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 AEP1YMR064W 1557 nt2.59□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 YPD1YDL235C 504 nt2.59□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 RMD6YEL072W 696 nt2.59□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 MIG2YGL209W 1149 nt2.59□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 ERV1YGR029W 570 nt2.59□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 YJL032WYJL032W 315 nt2.59□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 YOL107WYOL107W 1029 nt2.59□□□□□ -1.99
LDB17Q12342 NMA111YNL123W 2994 nt2.59□□□□□ -2
LDB17Q12342 RPO41YFL036W 4056 nt2.59□□□□□ -2
LDB17Q12342 MDM36YPR083W 1740 nt2.59□□□□□ -2
LDB17Q12342 GCV2YMR189W 3105 nt2.59□□□□□ -2
LDB17Q12342 TFB1YDR311W 1929 nt2.58□□□□□ -2
LDB17Q12342 YCR099CYCR099C 468 nt2.58□□□□□ -2
LDB17Q12342 YEA4YEL004W 1029 nt2.58□□□□□ -2
LDB17Q12342 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.58□□□□□ -2
LDB17Q12342 VPS38YLR360W 1320 nt2.58□□□□□ -2
LDB17Q12342 RLI1YDR091C 1827 nt2.58□□□□□ -2
LDB17Q12342 YDR239CYDR239C 2364 nt2.58□□□□□ -2
LDB17Q12342 YBP2YGL060W 1926 nt2.58□□□□□ -2
LDB17Q12342 RSE1YML049C 4086 nt2.58□□□□□ -2
LDB17Q12342 SUL1YBR294W 2580 nt2.57□□□□□ -2
LDB17Q12342 NGG1YDR176W 2109 nt2.57□□□□□ -2
LDB17Q12342 SEC26YDR238C 2922 nt2.57□□□□□ -2
LDB17Q12342 ESL2YKR096W 3588 nt2.57□□□□□ -2
LDB17Q12342 RTT10YPL183C 3042 nt2.57□□□□□ -2
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 26.2 ms