Protein–RNA interactions for Protein: P40509

SEC28, Coatomer subunit epsilon, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC28P40509 APC2YLR127C 2562 nt2.77□□□□□ -1.97
SEC28P40509 YDL157CYDL157C 357 nt2.77□□□□□ -1.97
SEC28P40509 SLU7YDR088C 1149 nt2.77□□□□□ -1.97
SEC28P40509 YFR057WYFR057W 456 nt2.77□□□□□ -1.97
SEC28P40509 RSM27YGR215W 333 nt2.77□□□□□ -1.97
SEC28P40509 YIL174WYIL174W 228 nt2.77□□□□□ -1.97
SEC28P40509 RPL17BYJL177W 555 nt2.77□□□□□ -1.97
SEC28P40509 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt2.77□□□□□ -1.97
SEC28P40509 ATG3YNR007C 933 nt2.77□□□□□ -1.97
SEC28P40509 GRE2YOL151W 1029 nt2.77□□□□□ -1.97
SEC28P40509 PEX27YOR193W 1131 nt2.77□□□□□ -1.97
SEC28P40509 KIN82YCR091W 2163 nt2.77□□□□□ -1.97
SEC28P40509 ICR1ICR1 3199 nt2.77□□□□□ -1.97
SEC28P40509 YGR067CYGR067C 2415 nt2.77□□□□□ -1.97
SEC28P40509 INP52YNL106C 3552 nt2.76□□□□□ -1.97
SEC28P40509 YCR045W-AYCR045W-A 351 nt2.76□□□□□ -1.97
SEC28P40509 NOP19YGR251W 591 nt2.76□□□□□ -1.97
SEC28P40509 RPL27AYHR010W 411 nt2.76□□□□□ -1.97
SEC28P40509 NEJ1YLR265C 1029 nt2.76□□□□□ -1.97
SEC28P40509 CWC24YLR323C 780 nt2.76□□□□□ -1.97
SEC28P40509 MRPL33YMR286W 261 nt2.76□□□□□ -1.97
SEC28P40509 CSI2YOL007C 1026 nt2.76□□□□□ -1.97
SEC28P40509 YOL107WYOL107W 1029 nt2.76□□□□□ -1.97
SEC28P40509 YOR097CYOR097C 528 nt2.76□□□□□ -1.97
SEC28P40509 RRP15YPR143W 753 nt2.76□□□□□ -1.97
SEC28P40509 YEL1YBL060W 2064 nt2.76□□□□□ -1.97
SEC28P40509 ORC1YML065W 2745 nt2.76□□□□□ -1.97
SEC28P40509 SAP1YER047C 2694 nt2.75□□□□□ -1.97
SEC28P40509 PFF1YBR074W 2931 nt2.75□□□□□ -1.97
SEC28P40509 SAG1YJR004C 1953 nt2.75□□□□□ -1.97
SEC28P40509 RPL11BYGR085C 525 nt2.75□□□□□ -1.97
SEC28P40509 YGR121W-AYGR121W-A 216 nt2.75□□□□□ -1.97
SEC28P40509 COQ10YOL008W 624 nt2.75□□□□□ -1.97
SEC28P40509 RPL11AYPR102C 525 nt2.75□□□□□ -1.97
SEC28P40509 MBA1YBR185C 837 nt2.75□□□□□ -1.97
SEC28P40509 YLR108CYLR108C 1458 nt2.75□□□□□ -1.97
SEC28P40509 SEC26YDR238C 2922 nt2.74□□□□□ -1.97
SEC28P40509 SRB8YCR081W 4284 nt2.74□□□□□ -1.97
SEC28P40509 RPO41YFL036W 4056 nt2.74□□□□□ -1.97
SEC28P40509 YER107W-AYER107W-A 321 nt2.74□□□□□ -1.97
SEC28P40509 YMR31YFR049W 372 nt2.74□□□□□ -1.97
SEC28P40509 PNC1YGL037C 651 nt2.74□□□□□ -1.97
SEC28P40509 YHR213WYHR213W 597 nt2.74□□□□□ -1.97
SEC28P40509 YHR214C-DYHR214C-D 294 nt2.74□□□□□ -1.97
SEC28P40509 YAL064WYAL064W 285 nt2.74□□□□□ -1.97
SEC28P40509 YAR062WYAR062W 597 nt2.74□□□□□ -1.97
SEC28P40509 YAR069CYAR069C 294 nt2.74□□□□□ -1.97
SEC28P40509 SPC2YML055W 537 nt2.74□□□□□ -1.97
SEC28P40509 MGE1YOR232W 687 nt2.74□□□□□ -1.97
SEC28P40509 HEM4YOR278W 828 nt2.74□□□□□ -1.97
SEC28P40509 SHG1YBR258C 429 nt2.74□□□□□ -1.97
SEC28P40509 GCD10YNL062C 1437 nt2.74□□□□□ -1.97
SEC28P40509 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.74□□□□□ -1.97
SEC28P40509 ESC1YMR219W 4977 nt2.73□□□□□ -1.97
SEC28P40509 CDC20YGL116W 1833 nt2.73□□□□□ -1.97
SEC28P40509 IKI3YLR384C 4050 nt2.73□□□□□ -1.97
SEC28P40509 RAV2YDR202C 1056 nt2.73□□□□□ -1.97
SEC28P40509 YGL230CYGL230C 444 nt2.73□□□□□ -1.97
SEC28P40509 RPL14BYHL001W 417 nt2.73□□□□□ -1.97
SEC28P40509 IKI1YHR187W 930 nt2.73□□□□□ -1.97
SEC28P40509 YAL037WYAL037W 804 nt2.73□□□□□ -1.97
SEC28P40509 TPK3YKL166C 1197 nt2.73□□□□□ -1.97
SEC28P40509 MRP49YKL167C 414 nt2.73□□□□□ -1.97
SEC28P40509 TDA8YAL064C-A 381 nt2.73□□□□□ -1.97
SEC28P40509 COX14YML129C 213 nt2.73□□□□□ -1.97
SEC28P40509 YOL134CYOL134C 390 nt2.73□□□□□ -1.97
SEC28P40509 HAT1YPL001W 1125 nt2.73□□□□□ -1.97
SEC28P40509 YRO2YBR054W 1035 nt2.73□□□□□ -1.97
SEC28P40509 SEC66YBR171W 621 nt2.73□□□□□ -1.97
SEC28P40509 AME1YBR211C 975 nt2.73□□□□□ -1.97
SEC28P40509 YDR239CYDR239C 2364 nt2.73□□□□□ -1.97
SEC28P40509 SPB1YCL054W 2526 nt2.73□□□□□ -1.97
SEC28P40509 YLR446WYLR446W 1302 nt2.72□□□□□ -1.97
SEC28P40509 MOT1YPL082C 5604 nt2.72□□□□□ -1.97
SEC28P40509 BTN2YGR142W 1233 nt2.72□□□□□ -1.97
SEC28P40509 FSH1YHR049W 732 nt2.72□□□□□ -1.97
SEC28P40509 RPS22AYJL190C 393 nt2.72□□□□□ -1.97
SEC28P40509 YKL033W-AYKL033W-A 711 nt2.72□□□□□ -1.97
SEC28P40509 YML037CYML037C 1023 nt2.72□□□□□ -1.97
SEC28P40509 GIM5YML094W 492 nt2.72□□□□□ -1.97
SEC28P40509 RRT16YNL105W 429 nt2.72□□□□□ -1.97
SEC28P40509 YPR014CYPR014C 330 nt2.72□□□□□ -1.97
SEC28P40509 RLI1YDR091C 1827 nt2.72□□□□□ -1.97
SEC28P40509 YHR078WYHR078W 1659 nt2.72□□□□□ -1.97
SEC28P40509 FUS1YCL027W 1539 nt2.72□□□□□ -1.97
SEC28P40509 HSE1YHL002W 1359 nt2.72□□□□□ -1.97
SEC28P40509 NFT1YKR103W 3657 nt2.72□□□□□ -1.97
SEC28P40509 AXL1YPR122W 3627 nt2.72□□□□□ -1.97
SEC28P40509 GIN4YDR507C 3429 nt2.71□□□□□ -1.98
SEC28P40509 NPR3YHL023C 3441 nt2.71□□□□□ -1.98
SEC28P40509 SNA4YDL123W 423 nt2.71□□□□□ -1.98
SEC28P40509 YDR262WYDR262W 819 nt2.71□□□□□ -1.98
SEC28P40509 ERG25YGR060W 930 nt2.71□□□□□ -1.98
SEC28P40509 FPR1YNL135C 345 nt2.71□□□□□ -1.98
SEC28P40509 DCP1YOL149W 696 nt2.71□□□□□ -1.98
SEC28P40509 YDR338CYDR338C 2088 nt2.71□□□□□ -1.98
SEC28P40509 ESC2YDR363W 1371 nt2.71□□□□□ -1.98
SEC28P40509 YBT1YLL048C 4986 nt2.7□□□□□ -1.98
SEC28P40509 ISW1YBR245C 3390 nt2.7□□□□□ -1.98
SEC28P40509 STI1YOR027W 1770 nt2.7□□□□□ -1.98
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