Protein–RNA interactions for Protein: O96020

CCNE2, G1/S-specific cyclin-E2, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE2O96020 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCNE2O96020 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCNE2O96020 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCNE2O96020 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCNE2O96020 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNE2O96020 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNE2O96020 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNE2O96020 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNE2O96020 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNE2O96020 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNE2O96020 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNE2O96020 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNE2O96020 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNE2O96020 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNE2O96020 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNE2O96020 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNE2O96020 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNE2O96020 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNE2O96020 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNE2O96020 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNE2O96020 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNE2O96020 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNE2O96020 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNE2O96020 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNE2O96020 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNE2O96020 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNE2O96020 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNE2O96020 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNE2O96020 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNE2O96020 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNE2O96020 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNE2O96020 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNE2O96020 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNE2O96020 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNE2O96020 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNE2O96020 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNE2O96020 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNE2O96020 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNE2O96020 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNE2O96020 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNE2O96020 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNE2O96020 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNE2O96020 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNE2O96020 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNE2O96020 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNE2O96020 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNE2O96020 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNE2O96020 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNE2O96020 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNE2O96020 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNE2O96020 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNE2O96020 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNE2O96020 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNE2O96020 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNE2O96020 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNE2O96020 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNE2O96020 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNE2O96020 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNE2O96020 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNE2O96020 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNE2O96020 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNE2O96020 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNE2O96020 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNE2O96020 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNE2O96020 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNE2O96020 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNE2O96020 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNE2O96020 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNE2O96020 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNE2O96020 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNE2O96020 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNE2O96020 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNE2O96020 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNE2O96020 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNE2O96020 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNE2O96020 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNE2O96020 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNE2O96020 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNE2O96020 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNE2O96020 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNE2O96020 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNE2O96020 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNE2O96020 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNE2O96020 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNE2O96020 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNE2O96020 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNE2O96020 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNE2O96020 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNE2O96020 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNE2O96020 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNE2O96020 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNE2O96020 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNE2O96020 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNE2O96020 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNE2O96020 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNE2O96020 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNE2O96020 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNE2O96020 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNE2O96020 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNE2O96020 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms