Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SIRT1Q96EB6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SIRT1Q96EB6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SIRT1Q96EB6 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SIRT1Q96EB6 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SIRT1Q96EB6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SIRT1Q96EB6 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SIRT1Q96EB6 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SIRT1Q96EB6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SIRT1Q96EB6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SIRT1Q96EB6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SIRT1Q96EB6 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SIRT1Q96EB6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SIRT1Q96EB6 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SIRT1Q96EB6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SIRT1Q96EB6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SIRT1Q96EB6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SIRT1Q96EB6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SIRT1Q96EB6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SIRT1Q96EB6 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SIRT1Q96EB6 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SIRT1Q96EB6 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SIRT1Q96EB6 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SIRT1Q96EB6 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SIRT1Q96EB6 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SIRT1Q96EB6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SIRT1Q96EB6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SIRT1Q96EB6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SIRT1Q96EB6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SIRT1Q96EB6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SIRT1Q96EB6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SIRT1Q96EB6 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SIRT1Q96EB6 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SIRT1Q96EB6 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SIRT1Q96EB6 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SIRT1Q96EB6 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SIRT1Q96EB6 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SIRT1Q96EB6 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SIRT1Q96EB6 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SIRT1Q96EB6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SIRT1Q96EB6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SIRT1Q96EB6 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SIRT1Q96EB6 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SIRT1Q96EB6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SIRT1Q96EB6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SIRT1Q96EB6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SIRT1Q96EB6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SIRT1Q96EB6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SIRT1Q96EB6 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SIRT1Q96EB6 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SIRT1Q96EB6 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SIRT1Q96EB6 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SIRT1Q96EB6 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SIRT1Q96EB6 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SIRT1Q96EB6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SIRT1Q96EB6 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SIRT1Q96EB6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SIRT1Q96EB6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SIRT1Q96EB6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SIRT1Q96EB6 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SIRT1Q96EB6 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SIRT1Q96EB6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SIRT1Q96EB6 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SIRT1Q96EB6 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SIRT1Q96EB6 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SIRT1Q96EB6 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SIRT1Q96EB6 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SIRT1Q96EB6 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SIRT1Q96EB6 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SIRT1Q96EB6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SIRT1Q96EB6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SIRT1Q96EB6 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SIRT1Q96EB6 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SIRT1Q96EB6 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SIRT1Q96EB6 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SIRT1Q96EB6 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SIRT1Q96EB6 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SIRT1Q96EB6 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SIRT1Q96EB6 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SIRT1Q96EB6 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SIRT1Q96EB6 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SIRT1Q96EB6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SIRT1Q96EB6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SIRT1Q96EB6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SIRT1Q96EB6 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SIRT1Q96EB6 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SIRT1Q96EB6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SIRT1Q96EB6 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SIRT1Q96EB6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SIRT1Q96EB6 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SIRT1Q96EB6 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SIRT1Q96EB6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SIRT1Q96EB6 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SIRT1Q96EB6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SIRT1Q96EB6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SIRT1Q96EB6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SIRT1Q96EB6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SIRT1Q96EB6 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SIRT1Q96EB6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SIRT1Q96EB6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms