Protein–RNA interactions for Protein: Q12417

PRP46, Pre-mRNA-splicing factor PRP46, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP46Q12417 YKL131WYKL131W 522 nt2.52□□□□□ -2.01
PRP46Q12417 END3YNL084C 1050 nt2.52□□□□□ -2.01
PRP46Q12417 TOR1YJR066W 7413 nt2.52□□□□□ -2.01
PRP46Q12417 TFB1YDR311W 1929 nt2.52□□□□□ -2.01
PRP46Q12417 SSN2YDR443C 4263 nt2.51□□□□□ -2.01
PRP46Q12417 VHR1YIL056W 1923 nt2.51□□□□□ -2.01
PRP46Q12417 CBS2YDR197W 1170 nt2.51□□□□□ -2.01
PRP46Q12417 VEL1YGL258W 621 nt2.51□□□□□ -2.01
PRP46Q12417 YLR307C-AYLR307C-A 264 nt2.51□□□□□ -2.01
PRP46Q12417 HSP10YOR020C 321 nt2.51□□□□□ -2.01
PRP46Q12417 YPL276WYPL276W 438 nt2.51□□□□□ -2.01
PRP46Q12417 RRG8YPR116W 834 nt2.51□□□□□ -2.01
PRP46Q12417 RAX2YLR084C 3663 nt2.51□□□□□ -2.01
PRP46Q12417 NOP56YLR197W 1515 nt2.51□□□□□ -2.01
PRP46Q12417 DUG2YBR281C 2637 nt2.51□□□□□ -2.01
PRP46Q12417 CBP2YHL038C 1893 nt2.5□□□□□ -2.01
PRP46Q12417 CEP3YMR168C 1827 nt2.5□□□□□ -2.01
PRP46Q12417 NRG1YDR043C 696 nt2.5□□□□□ -2.01
PRP46Q12417 SRB7YDR308C 423 nt2.5□□□□□ -2.01
PRP46Q12417 SEC4YFL005W 648 nt2.5□□□□□ -2.01
PRP46Q12417 OST5YGL226C-A 261 nt2.5□□□□□ -2.01
PRP46Q12417 COX6YHR051W 447 nt2.5□□□□□ -2.01
PRP46Q12417 SVP26YHR181W 687 nt2.5□□□□□ -2.01
PRP46Q12417 YJL047C-AYJL047C-A 135 nt2.5□□□□□ -2.01
PRP46Q12417 MER1YNL210W 813 nt2.5□□□□□ -2.01
PRP46Q12417 RPB8YOR224C 441 nt2.5□□□□□ -2.01
PRP46Q12417 YPR203WYPR203W 309 nt2.5□□□□□ -2.01
PRP46Q12417 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.5□□□□□ -2.01
PRP46Q12417 GEA1YJR031C 4227 nt2.5□□□□□ -2.01
PRP46Q12417 BIT61YJL058C 1632 nt2.5□□□□□ -2.01
PRP46Q12417 GYP7YDL234C 2241 nt2.49□□□□□ -2.01
PRP46Q12417 TRM82YDR165W 1335 nt2.49□□□□□ -2.01
PRP46Q12417 COG7YGL005C 840 nt2.49□□□□□ -2.01
PRP46Q12417 YGL230CYGL230C 444 nt2.49□□□□□ -2.01
PRP46Q12417 YIL141WYIL141W 390 nt2.49□□□□□ -2.01
PRP46Q12417 LIP2YLR239C 987 nt2.49□□□□□ -2.01
PRP46Q12417 SEC14YMR079W 915 nt2.49□□□□□ -2.01
PRP46Q12417 AIM36YMR157C 768 nt2.49□□□□□ -2.01
PRP46Q12417 SLM4YBR077C 489 nt2.49□□□□□ -2.01
PRP46Q12417 YGL176CYGL176C 1665 nt2.49□□□□□ -2.01
PRP46Q12417 VPS64YDR200C 1815 nt2.49□□□□□ -2.01
PRP46Q12417 RSM24YDR175C 960 nt2.48□□□□□ -2.01
PRP46Q12417 RRT13YER066W 558 nt2.48□□□□□ -2.01
PRP46Q12417 YGR121W-AYGR121W-A 216 nt2.48□□□□□ -2.01
PRP46Q12417 COX3Q0275 810 nt2.48□□□□□ -2.01
PRP46Q12417 YJL114WYJL114W 681 nt2.48□□□□□ -2.01
PRP46Q12417 JIP3YLR331C 378 nt2.48□□□□□ -2.01
PRP46Q12417 YOL106WYOL106W 354 nt2.48□□□□□ -2.01
PRP46Q12417 YOR366WYOR366W 354 nt2.48□□□□□ -2.01
PRP46Q12417 YPL142CYPL142C 318 nt2.48□□□□□ -2.01
PRP46Q12417 FIR1YER032W 2631 nt2.48□□□□□ -2.01
PRP46Q12417 CDC55YGL190C 1581 nt2.48□□□□□ -2.01
PRP46Q12417 JSN1YJR091C 3276 nt2.48□□□□□ -2.01
PRP46Q12417 DBF20YPR111W 1695 nt2.47□□□□□ -2.01
PRP46Q12417 SLP1YOR154W 1764 nt2.47□□□□□ -2.01
PRP46Q12417 APC11YDL008W 498 nt2.47□□□□□ -2.01
PRP46Q12417 snR70snR70 164 nt2.47□□□□□ -2.01
PRP46Q12417 TIM11YDR322C-A 291 nt2.47□□□□□ -2.01
PRP46Q12417 ERV1YGR029W 570 nt2.47□□□□□ -2.01
PRP46Q12417 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.47□□□□□ -2.01
PRP46Q12417 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.47□□□□□ -2.01
PRP46Q12417 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.47□□□□□ -2.01
PRP46Q12417 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.47□□□□□ -2.01
PRP46Q12417 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.47□□□□□ -2.01
PRP46Q12417 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.47□□□□□ -2.01
PRP46Q12417 HUA2YOR284W 732 nt2.47□□□□□ -2.01
PRP46Q12417 SRC1YML034W 2505 nt2.47□□□□□ -2.01
PRP46Q12417 YHR078WYHR078W 1659 nt2.47□□□□□ -2.01
PRP46Q12417 NMA111YNL123W 2994 nt2.46□□□□□ -2.01
PRP46Q12417 DBP7YKR024C 2229 nt2.46□□□□□ -2.01
PRP46Q12417 ARK1YNL020C 1917 nt2.46□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 ADY4YLR227C 1482 nt2.46□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 UBP14YBR058C 2346 nt2.46□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 CAF120YNL278W 3183 nt2.46□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 YIL046W-AYIL046W-A 165 nt2.46□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 YIR036W-AYIR036W-A 402 nt2.46□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 RPL17BYJL177W 555 nt2.46□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 YKR033CYKR033C 426 nt2.46□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 YMR181CYMR181C 465 nt2.46□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 MRPL33YMR286W 261 nt2.46□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 CUP9YPL177C 921 nt2.46□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 YLR278CYLR278C 4026 nt2.46□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 SKT5YBL061C 2091 nt2.46□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 UTP5YDR398W 1932 nt2.46□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 INP52YNL106C 3552 nt2.46□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 BNA4YBL098W 1383 nt2.46□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 AEP1YMR064W 1557 nt2.45□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 Q0255Q0255 1419 nt2.45□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 HTB1YDR224C 396 nt2.45□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 YDR250CYDR250C 276 nt2.45□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 GUK1YDR454C 564 nt2.45□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 MAM1YER106W 909 nt2.45□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 YHL044WYHL044W 708 nt2.45□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 NGL1YOL042W 1092 nt2.45□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 IPP1YBR011C 864 nt2.45□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 MED8YBR193C 672 nt2.45□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 JJJ2YJL162C 1752 nt2.45□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 GCV2YMR189W 3105 nt2.45□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 YPL150WYPL150W 2706 nt2.45□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 SAG1YJR004C 1953 nt2.45□□□□□ -2.02
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