Protein–RNA interactions for Protein: Q12071

VPS54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, yeastyeast

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Length 889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS54Q12071 SUI2YJR007W 915 nt2.94□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 PRE8YML092C 753 nt2.94□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 ADI1YMR009W 540 nt2.94□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 YPL107WYPL107W 747 nt2.94□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 RPC40YPR110C 1008 nt2.94□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 BNA4YBL098W 1383 nt2.94□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 KRE2YDR483W 1329 nt2.93□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 FUS2YMR232W 2034 nt2.93□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 UBP14YBR058C 2346 nt2.93□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 ATP22YDR350C 2055 nt2.93□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 YKL100CYKL100C 1764 nt2.93□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 STE2YFL026W 1296 nt2.93□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 BTN2YGR142W 1233 nt2.93□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 QCR10YHR001W-A 234 nt2.93□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 YIR036W-AYIR036W-A 402 nt2.93□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 ARC18YLR370C 537 nt2.93□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 VMA6YLR447C 1038 nt2.93□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 GIM5YML094W 492 nt2.93□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 YNL203CYNL203C 612 nt2.93□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 RPS12YOR369C 432 nt2.93□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 RRP15YPR143W 753 nt2.93□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 HOP1YIL072W 1818 nt2.93□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 VHR2YER064C 1518 nt2.93□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 MSH4YFL003C 2637 nt2.92□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 NOP12YOL041C 1380 nt2.92□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 SLU7YDR088C 1149 nt2.92□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 HMO1YDR174W 741 nt2.92□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 YGR160WYGR160W 612 nt2.92□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 YKE2YLR200W 345 nt2.92□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 YML037CYML037C 1023 nt2.92□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 YNL043CYNL043C 321 nt2.92□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 YNL089CYNL089C 477 nt2.92□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 SME1YOR159C 285 nt2.92□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 YOR331CYOR331C 558 nt2.92□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 YOR385WYOR385W 873 nt2.92□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 GRX5YPL059W 453 nt2.92□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 RPL33AYPL143W 324 nt2.92□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 BRE5YNR051C 1548 nt2.92□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 NUR1YDL089W 1455 nt2.91□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 RAV2YDR202C 1056 nt2.91□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 YER046W-AYER046W-A 330 nt2.91□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 RRT13YER066W 558 nt2.91□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 YGL159WYGL159W 1113 nt2.91□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 YHL044WYHL044W 708 nt2.91□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 COX3Q0275 810 nt2.91□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 RPL20AYMR242C 519 nt2.91□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 MSN1YOL116W 1149 nt2.91□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 PBS2YJL128C 2007 nt2.91□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 YLR278CYLR278C 4026 nt2.91□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 AI2Q0055 2565 nt2.91□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 ERG11YHR007C 1593 nt2.91□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 ATG13YPR185W 2217 nt2.91□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 RAD18YCR066W 1464 nt2.9□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 MOT1YPL082C 5604 nt2.9□□□□□ -1.94
VPS54Q12071 NSE4YDL105W 1209 nt2.9□□□□□ -1.95
VPS54Q12071 YJR020WYJR020W 333 nt2.9□□□□□ -1.95
VPS54Q12071 UBC12YLR306W 567 nt2.9□□□□□ -1.95
VPS54Q12071 DYN3YMR299C 939 nt2.9□□□□□ -1.95
VPS54Q12071 SPR2YOR214C 711 nt2.9□□□□□ -1.95
VPS54Q12071 TOM1YDR457W 9807 nt2.9□□□□□ -1.95
VPS54Q12071 NDT80YHR124W 1884 nt2.9□□□□□ -1.95
VPS54Q12071 PSY2YNL201C 2577 nt2.9□□□□□ -1.95
VPS54Q12071 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt2.89□□□□□ -1.95
VPS54Q12071 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt2.89□□□□□ -1.95
VPS54Q12071 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt2.89□□□□□ -1.95
VPS54Q12071 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt2.89□□□□□ -1.95
VPS54Q12071 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt2.89□□□□□ -1.95
VPS54Q12071 YCL019WYCL019W 5313 nt2.89□□□□□ -1.95
VPS54Q12071 RMD6YEL072W 696 nt2.89□□□□□ -1.95
VPS54Q12071 MET6YER091C 2304 nt2.89□□□□□ -1.95
VPS54Q12071 MVB12YGR206W 306 nt2.89□□□□□ -1.95
VPS54Q12071 DAD2YKR083C 402 nt2.89□□□□□ -1.95
VPS54Q12071 YLR230WYLR230W 306 nt2.89□□□□□ -1.95
VPS54Q12071 SLK19YOR195W 2466 nt2.89□□□□□ -1.95
VPS54Q12071 RAX2YLR084C 3663 nt2.89□□□□□ -1.95
VPS54Q12071 CDC37YDR168W 1521 nt2.88□□□□□ -1.95
VPS54Q12071 SPO11YHL022C 1197 nt2.88□□□□□ -1.95
VPS54Q12071 TPK3YKL166C 1197 nt2.88□□□□□ -1.95
VPS54Q12071 YLR217WYLR217W 324 nt2.88□□□□□ -1.95
VPS54Q12071 INP1YMR204C 1263 nt2.88□□□□□ -1.95
VPS54Q12071 RPL16BYNL069C 597 nt2.88□□□□□ -1.95
VPS54Q12071 ATX1YNL259C 222 nt2.88□□□□□ -1.95
VPS54Q12071 ATG3YNR007C 933 nt2.88□□□□□ -1.95
VPS54Q12071 URK1YNR012W 1506 nt2.88□□□□□ -1.95
VPS54Q12071 TFC4YGR047C 3078 nt2.87□□□□□ -1.95
VPS54Q12071 DYN1YKR054C 12279 nt2.87□□□□□ -1.95
VPS54Q12071 ESL1YIL151C 3357 nt2.87□□□□□ -1.95
VPS54Q12071 YCR045W-AYCR045W-A 351 nt2.87□□□□□ -1.95
VPS54Q12071 snR83snR83 306 nt2.87□□□□□ -1.95
VPS54Q12071 TAD1YGL243W 1203 nt2.87□□□□□ -1.95
VPS54Q12071 YHR214C-DYHR214C-D 294 nt2.87□□□□□ -1.95
VPS54Q12071 MCR1YKL150W 909 nt2.87□□□□□ -1.95
VPS54Q12071 YAR069CYAR069C 294 nt2.87□□□□□ -1.95
VPS54Q12071 RPL23AYBL087C 414 nt2.87□□□□□ -1.95
VPS54Q12071 GRE2YOL151W 1029 nt2.87□□□□□ -1.95
VPS54Q12071 MRPL40YPL173W 894 nt2.87□□□□□ -1.95
VPS54Q12071 YNL193WYNL193W 1677 nt2.87□□□□□ -1.95
VPS54Q12071 GYP7YDL234C 2241 nt2.87□□□□□ -1.95
VPS54Q12071 SEN54YPL083C 1404 nt2.86□□□□□ -1.95
VPS54Q12071 RIM1YCR028C-A 408 nt2.86□□□□□ -1.95
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