Protein–RNA interactions for Protein: P53437

RRN9, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN9, yeastyeast

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRN9P53437 NET1YJL076W 3570 nt2.68□□□□□ -1.98
RRN9P53437 CDC20YGL116W 1833 nt2.68□□□□□ -1.98
RRN9P53437 RGC1YPR115W 3252 nt2.67□□□□□ -1.98
RRN9P53437 SKT5YBL061C 2091 nt2.67□□□□□ -1.98
RRN9P53437 ANR2YKL047W 1551 nt2.67□□□□□ -1.98
RRN9P53437 YLR278CYLR278C 4026 nt2.67□□□□□ -1.98
RRN9P53437 RIM1YCR028C-A 408 nt2.67□□□□□ -1.98
RRN9P53437 HMO1YDR174W 741 nt2.67□□□□□ -1.98
RRN9P53437 EMI1YDR512C 564 nt2.67□□□□□ -1.98
RRN9P53437 RRT13YER066W 558 nt2.67□□□□□ -1.98
RRN9P53437 YER158W-AYER158W-A 216 nt2.67□□□□□ -1.98
RRN9P53437 YFL012WYFL012W 447 nt2.67□□□□□ -1.98
RRN9P53437 YGL159WYGL159W 1113 nt2.67□□□□□ -1.98
RRN9P53437 PPX1YHR201C 1194 nt2.67□□□□□ -1.98
RRN9P53437 ARC18YLR370C 537 nt2.67□□□□□ -1.98
RRN9P53437 RPL6AYML073C 531 nt2.67□□□□□ -1.98
RRN9P53437 YOR385WYOR385W 873 nt2.67□□□□□ -1.98
RRN9P53437 AFT2YPL202C 1251 nt2.67□□□□□ -1.98
RRN9P53437 SWD3YBR175W 948 nt2.67□□□□□ -1.98
RRN9P53437 MET6YER091C 2304 nt2.67□□□□□ -1.98
RRN9P53437 PSY2YNL201C 2577 nt2.66□□□□□ -1.98
RRN9P53437 DSE4YNR067C 3354 nt2.66□□□□□ -1.98
RRN9P53437 RAD18YCR066W 1464 nt2.66□□□□□ -1.98
RRN9P53437 STN1YDR082W 1485 nt2.66□□□□□ -1.98
RRN9P53437 NOP12YOL041C 1380 nt2.66□□□□□ -1.98
RRN9P53437 YGR067CYGR067C 2415 nt2.66□□□□□ -1.98
RRN9P53437 NSE4YDL105W 1209 nt2.66□□□□□ -1.98
RRN9P53437 RSM24YDR175C 960 nt2.66□□□□□ -1.98
RRN9P53437 YDR203WYDR203W 318 nt2.66□□□□□ -1.98
RRN9P53437 YFR054CYFR054C 579 nt2.66□□□□□ -1.98
RRN9P53437 VEL1YGL258W 621 nt2.66□□□□□ -1.98
RRN9P53437 THG1YGR024C 714 nt2.66□□□□□ -1.98
RRN9P53437 YGR160WYGR160W 612 nt2.66□□□□□ -1.98
RRN9P53437 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.66□□□□□ -1.98
RRN9P53437 YHR214C-DYHR214C-D 294 nt2.66□□□□□ -1.98
RRN9P53437 ATG27YJL178C 816 nt2.66□□□□□ -1.98
RRN9P53437 YAL031W-AYAL031W-A 309 nt2.66□□□□□ -1.98
RRN9P53437 YLL044WYLL044W 447 nt2.66□□□□□ -1.98
RRN9P53437 YAR069CYAR069C 294 nt2.66□□□□□ -1.98
RRN9P53437 ADI1YMR009W 540 nt2.66□□□□□ -1.98
RRN9P53437 GRE2YOL151W 1029 nt2.66□□□□□ -1.98
RRN9P53437 UTP14YML093W 2700 nt2.65□□□□□ -1.98
RRN9P53437 JJJ2YJL162C 1752 nt2.65□□□□□ -1.99
RRN9P53437 SRD1YCR018C 666 nt2.65□□□□□ -1.99
RRN9P53437 MRH1YDR033W 963 nt2.65□□□□□ -1.99
RRN9P53437 YDR248CYDR248C 582 nt2.65□□□□□ -1.99
RRN9P53437 HPA3YEL066W 540 nt2.65□□□□□ -1.99
RRN9P53437 PGD1YGL025C 1194 nt2.65□□□□□ -1.99
RRN9P53437 YGL109WYGL109W 324 nt2.65□□□□□ -1.99
RRN9P53437 YGR107WYGR107W 450 nt2.65□□□□□ -1.99
RRN9P53437 YJR020WYJR020W 333 nt2.65□□□□□ -1.99
RRN9P53437 SRL3YKR091W 741 nt2.65□□□□□ -1.99
RRN9P53437 YLR257WYLR257W 966 nt2.65□□□□□ -1.99
RRN9P53437 POP7YBR167C 423 nt2.65□□□□□ -1.99
RRN9P53437 SRB4YER022W 2064 nt2.65□□□□□ -1.99
RRN9P53437 SLK19YOR195W 2466 nt2.65□□□□□ -1.99
RRN9P53437 CDC55YGL190C 1581 nt2.65□□□□□ -1.99
RRN9P53437 YCK2YNL154C 1641 nt2.64□□□□□ -1.99
RRN9P53437 BRE5YNR051C 1548 nt2.64□□□□□ -1.99
RRN9P53437 YCR045W-AYCR045W-A 351 nt2.64□□□□□ -1.99
RRN9P53437 YCR099CYCR099C 468 nt2.64□□□□□ -1.99
RRN9P53437 PPH3YDR075W 927 nt2.64□□□□□ -1.99
RRN9P53437 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt2.64□□□□□ -1.99
RRN9P53437 YJL133C-AYJL133C-A 225 nt2.64□□□□□ -1.99
RRN9P53437 MRPL38YKL170W 417 nt2.64□□□□□ -1.99
RRN9P53437 NBP1YLR457C 960 nt2.64□□□□□ -1.99
RRN9P53437 PAI3YMR174C 207 nt2.64□□□□□ -1.99
RRN9P53437 YOR073W-AYOR073W-A 234 nt2.64□□□□□ -1.99
RRN9P53437 YOR277CYOR277C 309 nt2.64□□□□□ -1.99
RRN9P53437 YPL142CYPL142C 318 nt2.64□□□□□ -1.99
RRN9P53437 CAF120YNL278W 3183 nt2.64□□□□□ -1.99
RRN9P53437 RPA190YOR341W 4995 nt2.64□□□□□ -1.99
RRN9P53437 ARK1YNL020C 1917 nt2.64□□□□□ -1.99
RRN9P53437 URB2YJR041C 3525 nt2.63□□□□□ -1.99
RRN9P53437 AGE1YDR524C 1449 nt2.63□□□□□ -1.99
RRN9P53437 YDL158CYDL158C 309 nt2.63□□□□□ -1.99
RRN9P53437 AST2YER101C 1293 nt2.63□□□□□ -1.99
RRN9P53437 SAE2YGL175C 1038 nt2.63□□□□□ -1.99
RRN9P53437 TAD1YGL243W 1203 nt2.63□□□□□ -1.99
RRN9P53437 YHL044WYHL044W 708 nt2.63□□□□□ -1.99
RRN9P53437 RCN1YKL159C 636 nt2.63□□□□□ -1.99
RRN9P53437 RPL16BYNL069C 597 nt2.63□□□□□ -1.99
RRN9P53437 YPL119C-AYPL119C-A 264 nt2.63□□□□□ -1.99
RRN9P53437 ROG1YGL144C 2058 nt2.63□□□□□ -1.99
RRN9P53437 YKL100CYKL100C 1764 nt2.63□□□□□ -1.99
RRN9P53437 CYR1YJL005W 6081 nt2.63□□□□□ -1.99
RRN9P53437 TLC1TLC1 1301 nt2.63□□□□□ -1.99
RRN9P53437 SRB8YCR081W 4284 nt2.62□□□□□ -1.99
RRN9P53437 CWC22YGR278W 1734 nt2.62□□□□□ -1.99
RRN9P53437 MED1YPR070W 1701 nt2.62□□□□□ -1.99
RRN9P53437 YKL222CYKL222C 2118 nt2.62□□□□□ -1.99
RRN9P53437 BIT61YJL058C 1632 nt2.62□□□□□ -1.99
RRN9P53437 GPM2YDL021W 936 nt2.62□□□□□ -1.99
RRN9P53437 YDR090CYDR090C 933 nt2.62□□□□□ -1.99
RRN9P53437 YDR209CYDR209C 414 nt2.62□□□□□ -1.99
RRN9P53437 YDR262WYDR262W 819 nt2.62□□□□□ -1.99
RRN9P53437 KEI1YDR367W 666 nt2.62□□□□□ -1.99
RRN9P53437 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt2.62□□□□□ -1.99
RRN9P53437 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt2.62□□□□□ -1.99
RRN9P53437 YEA4YEL004W 1029 nt2.62□□□□□ -1.99
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