Protein–RNA interactions for Protein: P0C7V0

LINC00271, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00271, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00271P0C7V0 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00271P0C7V0 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00271P0C7V0 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.9 ms