Protein–RNA interactions for Protein: Q5XJY5

Arcn1, Coatomer subunit delta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Arcn1Q5XJY5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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Arcn1Q5XJY5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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Arcn1Q5XJY5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arcn1Q5XJY5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arcn1Q5XJY5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arcn1Q5XJY5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arcn1Q5XJY5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arcn1Q5XJY5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arcn1Q5XJY5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arcn1Q5XJY5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arcn1Q5XJY5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arcn1Q5XJY5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arcn1Q5XJY5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arcn1Q5XJY5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arcn1Q5XJY5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arcn1Q5XJY5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arcn1Q5XJY5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arcn1Q5XJY5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arcn1Q5XJY5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arcn1Q5XJY5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms