Protein–RNA interactions for Protein: Q5XJY5

Arcn1, Coatomer subunit delta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arcn1Q5XJY5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
Arcn1Q5XJY5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Arcn1Q5XJY5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Arcn1Q5XJY5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Arcn1Q5XJY5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Arcn1Q5XJY5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Arcn1Q5XJY5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
Arcn1Q5XJY5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
Arcn1Q5XJY5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Arcn1Q5XJY5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
Arcn1Q5XJY5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
Arcn1Q5XJY5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Arcn1Q5XJY5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
Arcn1Q5XJY5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Arcn1Q5XJY5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Arcn1Q5XJY5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Arcn1Q5XJY5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Arcn1Q5XJY5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Arcn1Q5XJY5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Arcn1Q5XJY5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Arcn1Q5XJY5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Arcn1Q5XJY5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Arcn1Q5XJY5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Arcn1Q5XJY5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Arcn1Q5XJY5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Arcn1Q5XJY5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Arcn1Q5XJY5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
Arcn1Q5XJY5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
Arcn1Q5XJY5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Arcn1Q5XJY5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Arcn1Q5XJY5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Arcn1Q5XJY5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Arcn1Q5XJY5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Arcn1Q5XJY5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Arcn1Q5XJY5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Arcn1Q5XJY5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Arcn1Q5XJY5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Arcn1Q5XJY5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Arcn1Q5XJY5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Arcn1Q5XJY5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Arcn1Q5XJY5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Arcn1Q5XJY5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Arcn1Q5XJY5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Arcn1Q5XJY5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Arcn1Q5XJY5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Arcn1Q5XJY5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Arcn1Q5XJY5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Arcn1Q5XJY5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Arcn1Q5XJY5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Arcn1Q5XJY5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Arcn1Q5XJY5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Arcn1Q5XJY5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Arcn1Q5XJY5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Arcn1Q5XJY5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Arcn1Q5XJY5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Arcn1Q5XJY5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Arcn1Q5XJY5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Arcn1Q5XJY5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Arcn1Q5XJY5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Arcn1Q5XJY5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Arcn1Q5XJY5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Arcn1Q5XJY5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Arcn1Q5XJY5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Arcn1Q5XJY5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Arcn1Q5XJY5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Arcn1Q5XJY5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Arcn1Q5XJY5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Arcn1Q5XJY5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Arcn1Q5XJY5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Arcn1Q5XJY5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Arcn1Q5XJY5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Arcn1Q5XJY5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Arcn1Q5XJY5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Arcn1Q5XJY5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Arcn1Q5XJY5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Arcn1Q5XJY5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Arcn1Q5XJY5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Arcn1Q5XJY5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Arcn1Q5XJY5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Arcn1Q5XJY5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Arcn1Q5XJY5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Arcn1Q5XJY5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Arcn1Q5XJY5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Arcn1Q5XJY5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Arcn1Q5XJY5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Arcn1Q5XJY5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Arcn1Q5XJY5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Arcn1Q5XJY5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Arcn1Q5XJY5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Arcn1Q5XJY5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Arcn1Q5XJY5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Arcn1Q5XJY5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Arcn1Q5XJY5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Arcn1Q5XJY5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Arcn1Q5XJY5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Arcn1Q5XJY5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Arcn1Q5XJY5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Arcn1Q5XJY5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Arcn1Q5XJY5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Arcn1Q5XJY5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
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