Protein–RNA interactions for Protein: P40509

SEC28, Coatomer subunit epsilon, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC28P40509 HPA3YEL066W 540 nt2.92□□□□□ -1.94
SEC28P40509 GTR2YGR163W 1026 nt2.92□□□□□ -1.94
SEC28P40509 GOS1YHL031C 672 nt2.92□□□□□ -1.94
SEC28P40509 YLR169WYLR169W 354 nt2.92□□□□□ -1.94
SEC28P40509 YLR339CYLR339C 552 nt2.92□□□□□ -1.94
SEC28P40509 ATP11YNL315C 957 nt2.92□□□□□ -1.94
SEC28P40509 TPK2YPL203W 1143 nt2.92□□□□□ -1.94
SEC28P40509 YPR203WYPR203W 309 nt2.92□□□□□ -1.94
SEC28P40509 SRC1YML034W 2505 nt2.91□□□□□ -1.94
SEC28P40509 JSN1YJR091C 3276 nt2.91□□□□□ -1.94
SEC28P40509 YLR278CYLR278C 4026 nt2.91□□□□□ -1.94
SEC28P40509 DSF2YBR007C 2211 nt2.91□□□□□ -1.94
SEC28P40509 BIT61YJL058C 1632 nt2.91□□□□□ -1.94
SEC28P40509 GCD6YDR211W 2139 nt2.91□□□□□ -1.94
SEC28P40509 YIR036W-AYIR036W-A 402 nt2.91□□□□□ -1.94
SEC28P40509 CMC1YKL137W 336 nt2.91□□□□□ -1.94
SEC28P40509 LIP2YLR239C 987 nt2.91□□□□□ -1.94
SEC28P40509 ILV5YLR355C 1188 nt2.91□□□□□ -1.94
SEC28P40509 DYN3YMR299C 939 nt2.91□□□□□ -1.94
SEC28P40509 DIM1YPL266W 957 nt2.91□□□□□ -1.94
SEC28P40509 RPC40YPR110C 1008 nt2.91□□□□□ -1.94
SEC28P40509 RRG8YPR116W 834 nt2.91□□□□□ -1.94
SEC28P40509 FAA2YER015W 2235 nt2.91□□□□□ -1.94
SEC28P40509 SPT14YPL175W 1359 nt2.9□□□□□ -1.94
SEC28P40509 OST5YGL226C-A 261 nt2.9□□□□□ -1.95
SEC28P40509 THP2YHR167W 786 nt2.9□□□□□ -1.95
SEC28P40509 YPL107WYPL107W 747 nt2.9□□□□□ -1.95
SEC28P40509 RPL33AYPL143W 324 nt2.9□□□□□ -1.95
SEC28P40509 MRPL40YPL173W 894 nt2.9□□□□□ -1.95
SEC28P40509 YME2YMR302C 2553 nt2.9□□□□□ -1.95
SEC28P40509 JJJ2YJL162C 1752 nt2.89□□□□□ -1.95
SEC28P40509 ILS1YBL076C 3219 nt2.89□□□□□ -1.95
SEC28P40509 NOP12YOL041C 1380 nt2.89□□□□□ -1.95
SEC28P40509 NMA111YNL123W 2994 nt2.89□□□□□ -1.95
SEC28P40509 SRD1YCR018C 666 nt2.89□□□□□ -1.95
SEC28P40509 CDC55YGL190C 1581 nt2.89□□□□□ -1.95
SEC28P40509 CWC22YGR278W 1734 nt2.89□□□□□ -1.95
SEC28P40509 RFA3YJL173C 369 nt2.89□□□□□ -1.95
SEC28P40509 YKR070WYKR070W 1059 nt2.89□□□□□ -1.95
SEC28P40509 SMA2YML066C 1110 nt2.89□□□□□ -1.95
SEC28P40509 AIM36YMR157C 768 nt2.89□□□□□ -1.95
SEC28P40509 YMR181CYMR181C 465 nt2.89□□□□□ -1.95
SEC28P40509 YBL062WYBL062W 381 nt2.89□□□□□ -1.95
SEC28P40509 NGL1YOL042W 1092 nt2.89□□□□□ -1.95
SEC28P40509 HSP10YOR020C 321 nt2.89□□□□□ -1.95
SEC28P40509 BTS1YPL069C 1008 nt2.89□□□□□ -1.95
SEC28P40509 RRD2YPL152W 1077 nt2.89□□□□□ -1.95
SEC28P40509 UBP14YBR058C 2346 nt2.89□□□□□ -1.95
SEC28P40509 YPR050CYPR050C 414 nt2.89□□□□□ -1.95
SEC28P40509 RFC5YBR087W 1065 nt2.89□□□□□ -1.95
SEC28P40509 YBR090CYBR090C 369 nt2.89□□□□□ -1.95
SEC28P40509 DBF20YPR111W 1695 nt2.88□□□□□ -1.95
SEC28P40509 GYP7YDL234C 2241 nt2.88□□□□□ -1.95
SEC28P40509 UTP14YML093W 2700 nt2.88□□□□□ -1.95
SEC28P40509 ROG1YGL144C 2058 nt2.88□□□□□ -1.95
SEC28P40509 ARK1YNL020C 1917 nt2.88□□□□□ -1.95
SEC28P40509 APC11YDL008W 498 nt2.88□□□□□ -1.95
SEC28P40509 MRH1YDR033W 963 nt2.88□□□□□ -1.95
SEC28P40509 FIN1YDR130C 876 nt2.88□□□□□ -1.95
SEC28P40509 VAB2YEL005C 849 nt2.88□□□□□ -1.95
SEC28P40509 YKL069WYKL069W 543 nt2.88□□□□□ -1.95
SEC28P40509 YKR033CYKR033C 426 nt2.88□□□□□ -1.95
SEC28P40509 RIM9YMR063W 720 nt2.88□□□□□ -1.95
SEC28P40509 RPL23AYBL087C 414 nt2.88□□□□□ -1.95
SEC28P40509 SRP1YNL189W 1629 nt2.88□□□□□ -1.95
SEC28P40509 ADY4YLR227C 1482 nt2.88□□□□□ -1.95
SEC28P40509 ARP5YNL059C 2268 nt2.88□□□□□ -1.95
SEC28P40509 ERT1YBR239C 1590 nt2.87□□□□□ -1.95
SEC28P40509 ATG13YPR185W 2217 nt2.87□□□□□ -1.95
SEC28P40509 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt2.87□□□□□ -1.95
SEC28P40509 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt2.87□□□□□ -1.95
SEC28P40509 SAE2YGL175C 1038 nt2.87□□□□□ -1.95
SEC28P40509 YGR017WYGR017W 894 nt2.87□□□□□ -1.95
SEC28P40509 MVB12YGR206W 306 nt2.87□□□□□ -1.95
SEC28P40509 SDO1YLR022C 753 nt2.87□□□□□ -1.95
SEC28P40509 YMR316C-AYMR316C-A 312 nt2.87□□□□□ -1.95
SEC28P40509 SLS1YLR139C 1932 nt2.87□□□□□ -1.95
SEC28P40509 CAF120YNL278W 3183 nt2.86□□□□□ -1.95
SEC28P40509 SSN2YDR443C 4263 nt2.86□□□□□ -1.95
SEC28P40509 SWC4YGR002C 1431 nt2.86□□□□□ -1.95
SEC28P40509 CYR1YJL005W 6081 nt2.86□□□□□ -1.95
SEC28P40509 POM152YMR129W 4014 nt2.86□□□□□ -1.95
SEC28P40509 ATC1YDR184C 885 nt2.86□□□□□ -1.95
SEC28P40509 TIM11YDR322C-A 291 nt2.86□□□□□ -1.95
SEC28P40509 CTK2YJL006C 972 nt2.86□□□□□ -1.95
SEC28P40509 ATG10YLL042C 504 nt2.86□□□□□ -1.95
SEC28P40509 YKE2YLR200W 345 nt2.86□□□□□ -1.95
SEC28P40509 YLR297WYLR297W 390 nt2.86□□□□□ -1.95
SEC28P40509 ERG11YHR007C 1593 nt2.86□□□□□ -1.95
SEC28P40509 SKT5YBL061C 2091 nt2.86□□□□□ -1.95
SEC28P40509 FUN30YAL019W 3396 nt2.86□□□□□ -1.95
SEC28P40509 NUR1YDL089W 1455 nt2.85□□□□□ -1.95
SEC28P40509 ERV1YGR029W 570 nt2.85□□□□□ -1.95
SEC28P40509 PEF1YGR058W 1008 nt2.85□□□□□ -1.95
SEC28P40509 CPR7YJR032W 1182 nt2.85□□□□□ -1.95
SEC28P40509 POL32YJR043C 1053 nt2.85□□□□□ -1.95
SEC28P40509 YKL115CYKL115C 393 nt2.85□□□□□ -1.95
SEC28P40509 RPL8BYLL045C 771 nt2.85□□□□□ -1.95
SEC28P40509 DUG2YBR281C 2637 nt2.85□□□□□ -1.95
SEC28P40509 CST9YLR394W 1449 nt2.85□□□□□ -1.95
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