Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
VPREB3Q9UKI3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VPREB3Q9UKI3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.7 ms