Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TAF1CQ15572 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
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