Protein–RNA interactions for Protein: P38324

SLX1, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, yeastyeast

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SLX1P38324 YNL144W-AYNL144W-A 84 nt2.97□□□□□ -1.93
SLX1P38324 YNL162W-AYNL162W-A 219 nt2.97□□□□□ -1.93
SLX1P38324 CSI2YOL007C 1026 nt2.97□□□□□ -1.93
SLX1P38324 YOR225WYOR225W 330 nt2.97□□□□□ -1.93
SLX1P38324 SUR1YPL057C 1149 nt2.97□□□□□ -1.93
SLX1P38324 RSA1YPL193W 1146 nt2.97□□□□□ -1.93
SLX1P38324 ALG14YBR070C 714 nt2.97□□□□□ -1.93
SLX1P38324 SHG1YBR258C 429 nt2.97□□□□□ -1.93
SLX1P38324 GRX1YCL035C 333 nt2.97□□□□□ -1.93
SLX1P38324 COM2YER130C 1332 nt2.96□□□□□ -1.93
SLX1P38324 SWC4YGR002C 1431 nt2.96□□□□□ -1.94
SLX1P38324 CRD1YDL142C 852 nt2.96□□□□□ -1.94
SLX1P38324 YDR366CYDR366C 399 nt2.96□□□□□ -1.94
SLX1P38324 SMT3YDR510W 306 nt2.96□□□□□ -1.94
SLX1P38324 PRE1YER012W 597 nt2.96□□□□□ -1.94
SLX1P38324 PRE4YFR050C 801 nt2.96□□□□□ -1.94
SLX1P38324 PEX21YGR239C 867 nt2.96□□□□□ -1.94
SLX1P38324 YIL082WYIL082W 873 nt2.96□□□□□ -1.94
SLX1P38324 BET4YJL031C 984 nt2.96□□□□□ -1.94
SLX1P38324 CPR7YJR032W 1182 nt2.96□□□□□ -1.94
SLX1P38324 CMC1YKL137W 336 nt2.96□□□□□ -1.94
SLX1P38324 YML094C-AYML094C-A 402 nt2.96□□□□□ -1.94
SLX1P38324 ATP11YNL315C 957 nt2.96□□□□□ -1.94
SLX1P38324 HUB1YNR032C-A 222 nt2.96□□□□□ -1.94
SLX1P38324 RRG8YPR116W 834 nt2.96□□□□□ -1.94
SLX1P38324 DSL1YNL258C 2265 nt2.96□□□□□ -1.94
SLX1P38324 SRB8YCR081W 4284 nt2.96□□□□□ -1.94
SLX1P38324 NFT1YKR103W 3657 nt2.95□□□□□ -1.94
SLX1P38324 STI1YOR027W 1770 nt2.95□□□□□ -1.94
SLX1P38324 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt2.95□□□□□ -1.94
SLX1P38324 ERP3YDL018C 678 nt2.95□□□□□ -1.94
SLX1P38324 SNU23YDL098C 585 nt2.95□□□□□ -1.94
SLX1P38324 AIM6YDL237W 1173 nt2.95□□□□□ -1.94
SLX1P38324 GRX3YDR098C 858 nt2.95□□□□□ -1.94
SLX1P38324 YGR114CYGR114C 390 nt2.95□□□□□ -1.94
SLX1P38324 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.95□□□□□ -1.94
SLX1P38324 SOL3YHR163W 750 nt2.95□□□□□ -1.94
SLX1P38324 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.95□□□□□ -1.94
SLX1P38324 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.95□□□□□ -1.94
SLX1P38324 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.95□□□□□ -1.94
SLX1P38324 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.95□□□□□ -1.94
SLX1P38324 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.95□□□□□ -1.94
SLX1P38324 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.95□□□□□ -1.94
SLX1P38324 YLR257WYLR257W 966 nt2.95□□□□□ -1.94
SLX1P38324 EAF7YNL136W 1278 nt2.95□□□□□ -1.94
SLX1P38324 TPT1YOL102C 693 nt2.95□□□□□ -1.94
SLX1P38324 YBR051WYBR051W 351 nt2.95□□□□□ -1.94
SLX1P38324 YBR096WYBR096W 693 nt2.95□□□□□ -1.94
SLX1P38324 BNA4YBL098W 1383 nt2.95□□□□□ -1.94
SLX1P38324 ADY4YLR227C 1482 nt2.95□□□□□ -1.94
SLX1P38324 JJJ1YNL227C 1773 nt2.95□□□□□ -1.94
SLX1P38324 RDS2YPL133C 1341 nt2.94□□□□□ -1.94
SLX1P38324 VPS41YDR080W 2979 nt2.94□□□□□ -1.94
SLX1P38324 SRP68YPL243W 1800 nt2.94□□□□□ -1.94
SLX1P38324 GIC2YDR309C 1152 nt2.94□□□□□ -1.94
SLX1P38324 GLC7YER133W 939 nt2.94□□□□□ -1.94
SLX1P38324 PEA2YER149C 1263 nt2.94□□□□□ -1.94
SLX1P38324 PRP21YJL203W 843 nt2.94□□□□□ -1.94
SLX1P38324 IRC19YLL033W 693 nt2.94□□□□□ -1.94
SLX1P38324 GPN3YLR243W 819 nt2.94□□□□□ -1.94
SLX1P38324 PRM6YML047C 1059 nt2.94□□□□□ -1.94
SLX1P38324 SAS2YMR127C 1017 nt2.94□□□□□ -1.94
SLX1P38324 YNL109WYNL109W 546 nt2.94□□□□□ -1.94
SLX1P38324 HNT3YOR258W 654 nt2.94□□□□□ -1.94
SLX1P38324 HUA2YOR284W 732 nt2.94□□□□□ -1.94
SLX1P38324 AFT2YPL202C 1251 nt2.94□□□□□ -1.94
SLX1P38324 ATP20YPR020W 348 nt2.94□□□□□ -1.94
SLX1P38324 ROX1YPR065W 1107 nt2.94□□□□□ -1.94
SLX1P38324 SPP381YBR152W 876 nt2.94□□□□□ -1.94
SLX1P38324 UBP14YBR058C 2346 nt2.94□□□□□ -1.94
SLX1P38324 BPT1YLL015W 4680 nt2.94□□□□□ -1.94
SLX1P38324 DUN1YDL101C 1542 nt2.93□□□□□ -1.94
SLX1P38324 MEF1YLR069C 2286 nt2.93□□□□□ -1.94
SLX1P38324 RPN3YER021W 1572 nt2.93□□□□□ -1.94
SLX1P38324 CTK1YKL139W 1587 nt2.93□□□□□ -1.94
SLX1P38324 CLG1YGL215W 1359 nt2.93□□□□□ -1.94
SLX1P38324 RAD55YDR076W 1221 nt2.93□□□□□ -1.94
SLX1P38324 AST2YER101C 1293 nt2.93□□□□□ -1.94
SLX1P38324 YAP3YHL009C 993 nt2.93□□□□□ -1.94
SLX1P38324 QCR10YHR001W-A 234 nt2.93□□□□□ -1.94
SLX1P38324 PPE1YHR075C 1203 nt2.93□□□□□ -1.94
SLX1P38324 LIN1YHR156C 1023 nt2.93□□□□□ -1.94
SLX1P38324 PCL7YIL050W 858 nt2.93□□□□□ -1.94
SLX1P38324 YJR011CYJR011C 786 nt2.93□□□□□ -1.94
SLX1P38324 YLL037WYLL037W 381 nt2.93□□□□□ -1.94
SLX1P38324 RPL33AYPL143W 324 nt2.93□□□□□ -1.94
SLX1P38324 YJR061WYJR061W 2808 nt2.93□□□□□ -1.94
SLX1P38324 MOT1YPL082C 5604 nt2.93□□□□□ -1.94
SLX1P38324 YNL011CYNL011C 1335 nt2.93□□□□□ -1.94
SLX1P38324 SKT5YBL061C 2091 nt2.92□□□□□ -1.94
SLX1P38324 DBP7YKR024C 2229 nt2.92□□□□□ -1.94
SLX1P38324 PDR3YBL005W 2931 nt2.92□□□□□ -1.94
SLX1P38324 HOT13YKL084W 351 nt2.92□□□□□ -1.94
SLX1P38324 YKL115CYKL115C 393 nt2.92□□□□□ -1.94
SLX1P38324 MRP49YKL167C 414 nt2.92□□□□□ -1.94
SLX1P38324 RSM19YNR037C 276 nt2.92□□□□□ -1.94
SLX1P38324 YNR062CYNR062C 984 nt2.92□□□□□ -1.94
SLX1P38324 MPD2YOL088C 834 nt2.92□□□□□ -1.94
SLX1P38324 YOR082CYOR082C 342 nt2.92□□□□□ -1.94
SLX1P38324 YBR063CYBR063C 1215 nt2.92□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 29.3 ms