Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2B9

Rps6ka4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka4Q9Z2B9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Rps6ka4Q9Z2B9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Rps6ka4Q9Z2B9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Rps6ka4Q9Z2B9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Rps6ka4Q9Z2B9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Rps6ka4Q9Z2B9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Rps6ka4Q9Z2B9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Rps6ka4Q9Z2B9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Rps6ka4Q9Z2B9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Rps6ka4Q9Z2B9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Rps6ka4Q9Z2B9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Rps6ka4Q9Z2B9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Rps6ka4Q9Z2B9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Rps6ka4Q9Z2B9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Rps6ka4Q9Z2B9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Rps6ka4Q9Z2B9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Rps6ka4Q9Z2B9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Rps6ka4Q9Z2B9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Rps6ka4Q9Z2B9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Rps6ka4Q9Z2B9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Rps6ka4Q9Z2B9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Rps6ka4Q9Z2B9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Rps6ka4Q9Z2B9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Rps6ka4Q9Z2B9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Rps6ka4Q9Z2B9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
Rps6ka4Q9Z2B9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Rps6ka4Q9Z2B9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Rps6ka4Q9Z2B9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Rps6ka4Q9Z2B9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Rps6ka4Q9Z2B9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
Rps6ka4Q9Z2B9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Rps6ka4Q9Z2B9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Rps6ka4Q9Z2B9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Rps6ka4Q9Z2B9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Rps6ka4Q9Z2B9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Rps6ka4Q9Z2B9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Rps6ka4Q9Z2B9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Rps6ka4Q9Z2B9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
Rps6ka4Q9Z2B9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Rps6ka4Q9Z2B9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Rps6ka4Q9Z2B9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Rps6ka4Q9Z2B9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Rps6ka4Q9Z2B9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Rps6ka4Q9Z2B9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Rps6ka4Q9Z2B9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Rps6ka4Q9Z2B9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Rps6ka4Q9Z2B9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Rps6ka4Q9Z2B9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Rps6ka4Q9Z2B9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Rps6ka4Q9Z2B9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Rps6ka4Q9Z2B9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Rps6ka4Q9Z2B9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Rps6ka4Q9Z2B9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Rps6ka4Q9Z2B9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Rps6ka4Q9Z2B9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Rps6ka4Q9Z2B9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Rps6ka4Q9Z2B9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Rps6ka4Q9Z2B9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Rps6ka4Q9Z2B9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Rps6ka4Q9Z2B9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
Rps6ka4Q9Z2B9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Rps6ka4Q9Z2B9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Rps6ka4Q9Z2B9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Rps6ka4Q9Z2B9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Rps6ka4Q9Z2B9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Rps6ka4Q9Z2B9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
Rps6ka4Q9Z2B9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Rps6ka4Q9Z2B9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Rps6ka4Q9Z2B9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Rps6ka4Q9Z2B9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Rps6ka4Q9Z2B9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Rps6ka4Q9Z2B9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Rps6ka4Q9Z2B9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Rps6ka4Q9Z2B9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Rps6ka4Q9Z2B9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Rps6ka4Q9Z2B9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Rps6ka4Q9Z2B9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Rps6ka4Q9Z2B9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Rps6ka4Q9Z2B9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Rps6ka4Q9Z2B9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Rps6ka4Q9Z2B9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Rps6ka4Q9Z2B9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Rps6ka4Q9Z2B9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Rps6ka4Q9Z2B9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.8 ms