Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2B3

Rgr, RPE-retinal G protein-coupled receptor, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RgrQ9Z2B3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RgrQ9Z2B3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RgrQ9Z2B3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RgrQ9Z2B3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RgrQ9Z2B3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RgrQ9Z2B3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RgrQ9Z2B3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RgrQ9Z2B3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RgrQ9Z2B3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RgrQ9Z2B3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RgrQ9Z2B3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RgrQ9Z2B3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RgrQ9Z2B3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RgrQ9Z2B3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RgrQ9Z2B3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RgrQ9Z2B3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RgrQ9Z2B3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RgrQ9Z2B3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RgrQ9Z2B3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RgrQ9Z2B3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RgrQ9Z2B3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RgrQ9Z2B3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RgrQ9Z2B3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RgrQ9Z2B3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RgrQ9Z2B3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RgrQ9Z2B3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RgrQ9Z2B3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RgrQ9Z2B3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RgrQ9Z2B3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RgrQ9Z2B3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RgrQ9Z2B3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RgrQ9Z2B3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RgrQ9Z2B3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RgrQ9Z2B3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RgrQ9Z2B3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RgrQ9Z2B3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RgrQ9Z2B3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RgrQ9Z2B3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RgrQ9Z2B3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RgrQ9Z2B3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RgrQ9Z2B3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RgrQ9Z2B3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RgrQ9Z2B3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RgrQ9Z2B3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RgrQ9Z2B3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RgrQ9Z2B3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RgrQ9Z2B3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RgrQ9Z2B3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RgrQ9Z2B3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RgrQ9Z2B3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RgrQ9Z2B3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RgrQ9Z2B3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RgrQ9Z2B3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RgrQ9Z2B3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RgrQ9Z2B3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RgrQ9Z2B3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RgrQ9Z2B3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RgrQ9Z2B3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RgrQ9Z2B3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RgrQ9Z2B3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RgrQ9Z2B3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RgrQ9Z2B3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RgrQ9Z2B3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RgrQ9Z2B3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RgrQ9Z2B3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RgrQ9Z2B3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RgrQ9Z2B3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RgrQ9Z2B3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RgrQ9Z2B3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RgrQ9Z2B3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RgrQ9Z2B3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RgrQ9Z2B3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RgrQ9Z2B3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RgrQ9Z2B3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RgrQ9Z2B3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RgrQ9Z2B3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RgrQ9Z2B3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RgrQ9Z2B3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RgrQ9Z2B3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RgrQ9Z2B3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RgrQ9Z2B3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RgrQ9Z2B3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RgrQ9Z2B3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RgrQ9Z2B3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RgrQ9Z2B3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RgrQ9Z2B3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RgrQ9Z2B3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RgrQ9Z2B3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RgrQ9Z2B3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RgrQ9Z2B3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RgrQ9Z2B3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RgrQ9Z2B3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RgrQ9Z2B3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RgrQ9Z2B3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RgrQ9Z2B3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RgrQ9Z2B3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RgrQ9Z2B3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RgrQ9Z2B3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RgrQ9Z2B3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RgrQ9Z2B3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 946.1 ms