Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0W9

Chrna6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna6Q9R0W9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chrna6Q9R0W9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chrna6Q9R0W9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chrna6Q9R0W9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chrna6Q9R0W9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chrna6Q9R0W9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chrna6Q9R0W9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chrna6Q9R0W9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chrna6Q9R0W9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chrna6Q9R0W9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chrna6Q9R0W9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chrna6Q9R0W9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Chrna6Q9R0W9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chrna6Q9R0W9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chrna6Q9R0W9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Chrna6Q9R0W9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Chrna6Q9R0W9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chrna6Q9R0W9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chrna6Q9R0W9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chrna6Q9R0W9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chrna6Q9R0W9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chrna6Q9R0W9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Chrna6Q9R0W9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chrna6Q9R0W9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chrna6Q9R0W9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Chrna6Q9R0W9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chrna6Q9R0W9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chrna6Q9R0W9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chrna6Q9R0W9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chrna6Q9R0W9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chrna6Q9R0W9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chrna6Q9R0W9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chrna6Q9R0W9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chrna6Q9R0W9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chrna6Q9R0W9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chrna6Q9R0W9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Chrna6Q9R0W9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Chrna6Q9R0W9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chrna6Q9R0W9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chrna6Q9R0W9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chrna6Q9R0W9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chrna6Q9R0W9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chrna6Q9R0W9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chrna6Q9R0W9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chrna6Q9R0W9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chrna6Q9R0W9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Chrna6Q9R0W9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chrna6Q9R0W9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chrna6Q9R0W9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chrna6Q9R0W9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chrna6Q9R0W9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chrna6Q9R0W9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chrna6Q9R0W9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chrna6Q9R0W9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chrna6Q9R0W9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chrna6Q9R0W9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chrna6Q9R0W9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chrna6Q9R0W9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chrna6Q9R0W9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chrna6Q9R0W9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chrna6Q9R0W9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chrna6Q9R0W9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chrna6Q9R0W9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chrna6Q9R0W9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chrna6Q9R0W9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chrna6Q9R0W9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Chrna6Q9R0W9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chrna6Q9R0W9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chrna6Q9R0W9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chrna6Q9R0W9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chrna6Q9R0W9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Chrna6Q9R0W9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Chrna6Q9R0W9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chrna6Q9R0W9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chrna6Q9R0W9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chrna6Q9R0W9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chrna6Q9R0W9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chrna6Q9R0W9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chrna6Q9R0W9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chrna6Q9R0W9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chrna6Q9R0W9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chrna6Q9R0W9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Chrna6Q9R0W9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chrna6Q9R0W9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chrna6Q9R0W9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chrna6Q9R0W9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chrna6Q9R0W9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chrna6Q9R0W9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chrna6Q9R0W9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chrna6Q9R0W9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chrna6Q9R0W9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Chrna6Q9R0W9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chrna6Q9R0W9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chrna6Q9R0W9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chrna6Q9R0W9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chrna6Q9R0W9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chrna6Q9R0W9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chrna6Q9R0W9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chrna6Q9R0W9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chrna6Q9R0W9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms