Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cnga3Q9JJZ8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cnga3Q9JJZ8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cnga3Q9JJZ8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cnga3Q9JJZ8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cnga3Q9JJZ8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cnga3Q9JJZ8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cnga3Q9JJZ8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cnga3Q9JJZ8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cnga3Q9JJZ8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cnga3Q9JJZ8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Cnga3Q9JJZ8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cnga3Q9JJZ8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Cnga3Q9JJZ8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cnga3Q9JJZ8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Cnga3Q9JJZ8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cnga3Q9JJZ8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cnga3Q9JJZ8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cnga3Q9JJZ8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cnga3Q9JJZ8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Cnga3Q9JJZ8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cnga3Q9JJZ8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Cnga3Q9JJZ8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cnga3Q9JJZ8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cnga3Q9JJZ8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cnga3Q9JJZ8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cnga3Q9JJZ8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cnga3Q9JJZ8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Cnga3Q9JJZ8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cnga3Q9JJZ8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cnga3Q9JJZ8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cnga3Q9JJZ8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cnga3Q9JJZ8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cnga3Q9JJZ8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cnga3Q9JJZ8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cnga3Q9JJZ8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cnga3Q9JJZ8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cnga3Q9JJZ8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cnga3Q9JJZ8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cnga3Q9JJZ8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cnga3Q9JJZ8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cnga3Q9JJZ8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cnga3Q9JJZ8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cnga3Q9JJZ8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cnga3Q9JJZ8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cnga3Q9JJZ8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cnga3Q9JJZ8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cnga3Q9JJZ8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cnga3Q9JJZ8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cnga3Q9JJZ8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cnga3Q9JJZ8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Cnga3Q9JJZ8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cnga3Q9JJZ8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cnga3Q9JJZ8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cnga3Q9JJZ8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cnga3Q9JJZ8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cnga3Q9JJZ8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cnga3Q9JJZ8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cnga3Q9JJZ8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cnga3Q9JJZ8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Cnga3Q9JJZ8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cnga3Q9JJZ8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cnga3Q9JJZ8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Cnga3Q9JJZ8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cnga3Q9JJZ8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cnga3Q9JJZ8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cnga3Q9JJZ8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cnga3Q9JJZ8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cnga3Q9JJZ8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cnga3Q9JJZ8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cnga3Q9JJZ8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cnga3Q9JJZ8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cnga3Q9JJZ8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cnga3Q9JJZ8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cnga3Q9JJZ8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cnga3Q9JJZ8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Cnga3Q9JJZ8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cnga3Q9JJZ8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cnga3Q9JJZ8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cnga3Q9JJZ8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cnga3Q9JJZ8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cnga3Q9JJZ8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cnga3Q9JJZ8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cnga3Q9JJZ8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cnga3Q9JJZ8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cnga3Q9JJZ8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cnga3Q9JJZ8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cnga3Q9JJZ8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cnga3Q9JJZ8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Cnga3Q9JJZ8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cnga3Q9JJZ8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cnga3Q9JJZ8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cnga3Q9JJZ8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cnga3Q9JJZ8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cnga3Q9JJZ8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cnga3Q9JJZ8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cnga3Q9JJZ8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cnga3Q9JJZ8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Cnga3Q9JJZ8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cnga3Q9JJZ8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
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