Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC40.98■■■■■ 4.15
Cnga3Q9JJZ8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Cnga3Q9JJZ8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Cnga3Q9JJZ8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Cnga3Q9JJZ8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Cnga3Q9JJZ8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
Cnga3Q9JJZ8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Cnga3Q9JJZ8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
Cnga3Q9JJZ8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
Cnga3Q9JJZ8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Cnga3Q9JJZ8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Cnga3Q9JJZ8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Cnga3Q9JJZ8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
Cnga3Q9JJZ8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
Cnga3Q9JJZ8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
Cnga3Q9JJZ8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Cnga3Q9JJZ8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Cnga3Q9JJZ8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Cnga3Q9JJZ8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Cnga3Q9JJZ8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Cnga3Q9JJZ8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Cnga3Q9JJZ8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Cnga3Q9JJZ8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Cnga3Q9JJZ8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Cnga3Q9JJZ8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Cnga3Q9JJZ8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
Cnga3Q9JJZ8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Cnga3Q9JJZ8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Cnga3Q9JJZ8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
Cnga3Q9JJZ8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Cnga3Q9JJZ8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Cnga3Q9JJZ8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Cnga3Q9JJZ8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Cnga3Q9JJZ8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Cnga3Q9JJZ8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Cnga3Q9JJZ8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Cnga3Q9JJZ8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Cnga3Q9JJZ8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Cnga3Q9JJZ8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Cnga3Q9JJZ8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Cnga3Q9JJZ8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Cnga3Q9JJZ8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Cnga3Q9JJZ8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
Cnga3Q9JJZ8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Cnga3Q9JJZ8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Cnga3Q9JJZ8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Cnga3Q9JJZ8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Cnga3Q9JJZ8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Cnga3Q9JJZ8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Cnga3Q9JJZ8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Cnga3Q9JJZ8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Cnga3Q9JJZ8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Cnga3Q9JJZ8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Cnga3Q9JJZ8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Cnga3Q9JJZ8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
Cnga3Q9JJZ8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Cnga3Q9JJZ8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
Cnga3Q9JJZ8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Cnga3Q9JJZ8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Cnga3Q9JJZ8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Cnga3Q9JJZ8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Cnga3Q9JJZ8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Cnga3Q9JJZ8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Cnga3Q9JJZ8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Cnga3Q9JJZ8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Cnga3Q9JJZ8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Cnga3Q9JJZ8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Cnga3Q9JJZ8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Cnga3Q9JJZ8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Cnga3Q9JJZ8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Cnga3Q9JJZ8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Cnga3Q9JJZ8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
Cnga3Q9JJZ8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Cnga3Q9JJZ8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Cnga3Q9JJZ8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Cnga3Q9JJZ8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
Cnga3Q9JJZ8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Cnga3Q9JJZ8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Cnga3Q9JJZ8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Cnga3Q9JJZ8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Cnga3Q9JJZ8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Cnga3Q9JJZ8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Cnga3Q9JJZ8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
Cnga3Q9JJZ8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Cnga3Q9JJZ8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Cnga3Q9JJZ8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Cnga3Q9JJZ8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Cnga3Q9JJZ8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
Cnga3Q9JJZ8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Cnga3Q9JJZ8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Cnga3Q9JJZ8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Cnga3Q9JJZ8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Cnga3Q9JJZ8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Cnga3Q9JJZ8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Cnga3Q9JJZ8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Cnga3Q9JJZ8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Cnga3Q9JJZ8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Cnga3Q9JJZ8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Cnga3Q9JJZ8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Cnga3Q9JJZ8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 263.6 ms