Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI70

Mkks, McKusick-Kaufman/Bardet-Biedl syndromes putative chaperonin, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MkksQ9JI70 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MkksQ9JI70 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MkksQ9JI70 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MkksQ9JI70 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MkksQ9JI70 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MkksQ9JI70 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MkksQ9JI70 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MkksQ9JI70 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MkksQ9JI70 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MkksQ9JI70 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MkksQ9JI70 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MkksQ9JI70 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MkksQ9JI70 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MkksQ9JI70 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MkksQ9JI70 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MkksQ9JI70 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MkksQ9JI70 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MkksQ9JI70 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MkksQ9JI70 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MkksQ9JI70 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MkksQ9JI70 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MkksQ9JI70 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MkksQ9JI70 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MkksQ9JI70 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MkksQ9JI70 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MkksQ9JI70 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MkksQ9JI70 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MkksQ9JI70 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MkksQ9JI70 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MkksQ9JI70 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MkksQ9JI70 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MkksQ9JI70 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MkksQ9JI70 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MkksQ9JI70 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MkksQ9JI70 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MkksQ9JI70 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MkksQ9JI70 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MkksQ9JI70 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MkksQ9JI70 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MkksQ9JI70 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MkksQ9JI70 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MkksQ9JI70 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MkksQ9JI70 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MkksQ9JI70 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
MkksQ9JI70 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MkksQ9JI70 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MkksQ9JI70 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MkksQ9JI70 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MkksQ9JI70 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MkksQ9JI70 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MkksQ9JI70 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MkksQ9JI70 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MkksQ9JI70 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MkksQ9JI70 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MkksQ9JI70 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MkksQ9JI70 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MkksQ9JI70 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MkksQ9JI70 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MkksQ9JI70 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MkksQ9JI70 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MkksQ9JI70 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MkksQ9JI70 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MkksQ9JI70 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MkksQ9JI70 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MkksQ9JI70 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MkksQ9JI70 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MkksQ9JI70 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MkksQ9JI70 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MkksQ9JI70 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MkksQ9JI70 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MkksQ9JI70 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MkksQ9JI70 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MkksQ9JI70 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
MkksQ9JI70 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MkksQ9JI70 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MkksQ9JI70 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MkksQ9JI70 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MkksQ9JI70 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
MkksQ9JI70 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MkksQ9JI70 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MkksQ9JI70 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MkksQ9JI70 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MkksQ9JI70 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MkksQ9JI70 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MkksQ9JI70 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MkksQ9JI70 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
MkksQ9JI70 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MkksQ9JI70 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MkksQ9JI70 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MkksQ9JI70 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MkksQ9JI70 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MkksQ9JI70 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MkksQ9JI70 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MkksQ9JI70 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MkksQ9JI70 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MkksQ9JI70 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MkksQ9JI70 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MkksQ9JI70 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MkksQ9JI70 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
MkksQ9JI70 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139.3 ms