Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB76

Emc9, ER membrane protein complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emc9Q9DB76 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Emc9Q9DB76 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Emc9Q9DB76 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Emc9Q9DB76 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Emc9Q9DB76 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Emc9Q9DB76 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Emc9Q9DB76 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Emc9Q9DB76 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Emc9Q9DB76 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Emc9Q9DB76 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Emc9Q9DB76 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Emc9Q9DB76 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Emc9Q9DB76 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Emc9Q9DB76 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Emc9Q9DB76 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Emc9Q9DB76 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Emc9Q9DB76 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Emc9Q9DB76 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Emc9Q9DB76 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Emc9Q9DB76 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Emc9Q9DB76 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Emc9Q9DB76 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Emc9Q9DB76 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Emc9Q9DB76 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Emc9Q9DB76 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Emc9Q9DB76 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Emc9Q9DB76 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Emc9Q9DB76 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Emc9Q9DB76 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Emc9Q9DB76 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Emc9Q9DB76 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Emc9Q9DB76 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Emc9Q9DB76 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Emc9Q9DB76 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Emc9Q9DB76 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Emc9Q9DB76 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Emc9Q9DB76 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Emc9Q9DB76 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Emc9Q9DB76 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Emc9Q9DB76 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Emc9Q9DB76 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Emc9Q9DB76 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Emc9Q9DB76 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Emc9Q9DB76 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Emc9Q9DB76 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Emc9Q9DB76 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Emc9Q9DB76 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Emc9Q9DB76 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Emc9Q9DB76 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Emc9Q9DB76 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Emc9Q9DB76 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Emc9Q9DB76 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Emc9Q9DB76 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Emc9Q9DB76 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Emc9Q9DB76 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Emc9Q9DB76 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Emc9Q9DB76 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Emc9Q9DB76 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Emc9Q9DB76 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Emc9Q9DB76 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Emc9Q9DB76 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Emc9Q9DB76 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Emc9Q9DB76 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Emc9Q9DB76 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Emc9Q9DB76 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Emc9Q9DB76 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Emc9Q9DB76 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Emc9Q9DB76 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Emc9Q9DB76 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Emc9Q9DB76 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Emc9Q9DB76 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Emc9Q9DB76 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Emc9Q9DB76 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Emc9Q9DB76 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Emc9Q9DB76 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Emc9Q9DB76 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Emc9Q9DB76 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Emc9Q9DB76 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Emc9Q9DB76 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Emc9Q9DB76 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Emc9Q9DB76 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Emc9Q9DB76 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Emc9Q9DB76 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Emc9Q9DB76 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Emc9Q9DB76 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Emc9Q9DB76 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Emc9Q9DB76 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Emc9Q9DB76 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Emc9Q9DB76 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Emc9Q9DB76 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Emc9Q9DB76 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Emc9Q9DB76 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Emc9Q9DB76 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Emc9Q9DB76 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Emc9Q9DB76 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Emc9Q9DB76 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Emc9Q9DB76 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Emc9Q9DB76 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Emc9Q9DB76 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Emc9Q9DB76 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms