Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAD6

Pfn3, Profilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn3Q9DAD6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pfn3Q9DAD6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pfn3Q9DAD6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pfn3Q9DAD6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pfn3Q9DAD6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pfn3Q9DAD6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pfn3Q9DAD6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pfn3Q9DAD6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Pfn3Q9DAD6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pfn3Q9DAD6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pfn3Q9DAD6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Pfn3Q9DAD6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Pfn3Q9DAD6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pfn3Q9DAD6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pfn3Q9DAD6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pfn3Q9DAD6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pfn3Q9DAD6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pfn3Q9DAD6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pfn3Q9DAD6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pfn3Q9DAD6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pfn3Q9DAD6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Pfn3Q9DAD6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pfn3Q9DAD6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pfn3Q9DAD6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Pfn3Q9DAD6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pfn3Q9DAD6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pfn3Q9DAD6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pfn3Q9DAD6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pfn3Q9DAD6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pfn3Q9DAD6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pfn3Q9DAD6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pfn3Q9DAD6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pfn3Q9DAD6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pfn3Q9DAD6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pfn3Q9DAD6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pfn3Q9DAD6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pfn3Q9DAD6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pfn3Q9DAD6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pfn3Q9DAD6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pfn3Q9DAD6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pfn3Q9DAD6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pfn3Q9DAD6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pfn3Q9DAD6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pfn3Q9DAD6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pfn3Q9DAD6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Pfn3Q9DAD6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pfn3Q9DAD6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pfn3Q9DAD6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pfn3Q9DAD6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pfn3Q9DAD6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Pfn3Q9DAD6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pfn3Q9DAD6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pfn3Q9DAD6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pfn3Q9DAD6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pfn3Q9DAD6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pfn3Q9DAD6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pfn3Q9DAD6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pfn3Q9DAD6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pfn3Q9DAD6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Pfn3Q9DAD6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pfn3Q9DAD6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pfn3Q9DAD6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pfn3Q9DAD6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pfn3Q9DAD6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pfn3Q9DAD6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pfn3Q9DAD6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pfn3Q9DAD6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pfn3Q9DAD6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pfn3Q9DAD6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Pfn3Q9DAD6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Pfn3Q9DAD6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pfn3Q9DAD6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pfn3Q9DAD6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pfn3Q9DAD6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pfn3Q9DAD6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pfn3Q9DAD6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Pfn3Q9DAD6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pfn3Q9DAD6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pfn3Q9DAD6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pfn3Q9DAD6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pfn3Q9DAD6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pfn3Q9DAD6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pfn3Q9DAD6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pfn3Q9DAD6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pfn3Q9DAD6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Pfn3Q9DAD6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pfn3Q9DAD6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pfn3Q9DAD6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pfn3Q9DAD6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pfn3Q9DAD6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pfn3Q9DAD6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pfn3Q9DAD6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pfn3Q9DAD6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pfn3Q9DAD6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pfn3Q9DAD6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pfn3Q9DAD6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pfn3Q9DAD6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pfn3Q9DAD6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pfn3Q9DAD6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pfn3Q9DAD6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms