Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp6v0e1Q9CQD8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Atp6v0e1Q9CQD8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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