Protein–RNA interactions for Protein: Q99PF4

Cdh23, Cadherin-23, mousemouse

Predictions only

Length 3,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh23Q99PF4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cdh23Q99PF4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cdh23Q99PF4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdh23Q99PF4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdh23Q99PF4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdh23Q99PF4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cdh23Q99PF4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cdh23Q99PF4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cdh23Q99PF4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cdh23Q99PF4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cdh23Q99PF4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cdh23Q99PF4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cdh23Q99PF4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cdh23Q99PF4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cdh23Q99PF4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cdh23Q99PF4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cdh23Q99PF4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cdh23Q99PF4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cdh23Q99PF4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cdh23Q99PF4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cdh23Q99PF4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cdh23Q99PF4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cdh23Q99PF4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Cdh23Q99PF4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Cdh23Q99PF4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cdh23Q99PF4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cdh23Q99PF4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cdh23Q99PF4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cdh23Q99PF4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cdh23Q99PF4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cdh23Q99PF4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cdh23Q99PF4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cdh23Q99PF4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cdh23Q99PF4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cdh23Q99PF4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cdh23Q99PF4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cdh23Q99PF4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cdh23Q99PF4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cdh23Q99PF4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cdh23Q99PF4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cdh23Q99PF4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cdh23Q99PF4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cdh23Q99PF4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cdh23Q99PF4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cdh23Q99PF4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cdh23Q99PF4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Cdh23Q99PF4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cdh23Q99PF4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cdh23Q99PF4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cdh23Q99PF4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cdh23Q99PF4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cdh23Q99PF4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cdh23Q99PF4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdh23Q99PF4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cdh23Q99PF4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cdh23Q99PF4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cdh23Q99PF4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cdh23Q99PF4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cdh23Q99PF4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cdh23Q99PF4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cdh23Q99PF4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cdh23Q99PF4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cdh23Q99PF4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdh23Q99PF4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdh23Q99PF4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdh23Q99PF4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdh23Q99PF4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdh23Q99PF4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cdh23Q99PF4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cdh23Q99PF4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cdh23Q99PF4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdh23Q99PF4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdh23Q99PF4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdh23Q99PF4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdh23Q99PF4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cdh23Q99PF4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cdh23Q99PF4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cdh23Q99PF4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cdh23Q99PF4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdh23Q99PF4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdh23Q99PF4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdh23Q99PF4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdh23Q99PF4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdh23Q99PF4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdh23Q99PF4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdh23Q99PF4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdh23Q99PF4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cdh23Q99PF4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cdh23Q99PF4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdh23Q99PF4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cdh23Q99PF4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cdh23Q99PF4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cdh23Q99PF4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cdh23Q99PF4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdh23Q99PF4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdh23Q99PF4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdh23Q99PF4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cdh23Q99PF4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cdh23Q99PF4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cdh23Q99PF4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms