Protein–RNA interactions for Protein: Q99P47

Cntnap4, Contactin-associated protein-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap4Q99P47 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cntnap4Q99P47 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cntnap4Q99P47 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cntnap4Q99P47 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cntnap4Q99P47 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cntnap4Q99P47 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cntnap4Q99P47 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cntnap4Q99P47 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
Cntnap4Q99P47 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Cntnap4Q99P47 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cntnap4Q99P47 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cntnap4Q99P47 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cntnap4Q99P47 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cntnap4Q99P47 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cntnap4Q99P47 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cntnap4Q99P47 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cntnap4Q99P47 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cntnap4Q99P47 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cntnap4Q99P47 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cntnap4Q99P47 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cntnap4Q99P47 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cntnap4Q99P47 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cntnap4Q99P47 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cntnap4Q99P47 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cntnap4Q99P47 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cntnap4Q99P47 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cntnap4Q99P47 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cntnap4Q99P47 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cntnap4Q99P47 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cntnap4Q99P47 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cntnap4Q99P47 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cntnap4Q99P47 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cntnap4Q99P47 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cntnap4Q99P47 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cntnap4Q99P47 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cntnap4Q99P47 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cntnap4Q99P47 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cntnap4Q99P47 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cntnap4Q99P47 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cntnap4Q99P47 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cntnap4Q99P47 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Cntnap4Q99P47 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cntnap4Q99P47 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cntnap4Q99P47 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cntnap4Q99P47 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cntnap4Q99P47 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cntnap4Q99P47 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cntnap4Q99P47 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cntnap4Q99P47 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cntnap4Q99P47 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cntnap4Q99P47 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cntnap4Q99P47 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Cntnap4Q99P47 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cntnap4Q99P47 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cntnap4Q99P47 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cntnap4Q99P47 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cntnap4Q99P47 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cntnap4Q99P47 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cntnap4Q99P47 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cntnap4Q99P47 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cntnap4Q99P47 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cntnap4Q99P47 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cntnap4Q99P47 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cntnap4Q99P47 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cntnap4Q99P47 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cntnap4Q99P47 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Cntnap4Q99P47 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cntnap4Q99P47 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Cntnap4Q99P47 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cntnap4Q99P47 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cntnap4Q99P47 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cntnap4Q99P47 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cntnap4Q99P47 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cntnap4Q99P47 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Cntnap4Q99P47 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cntnap4Q99P47 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cntnap4Q99P47 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cntnap4Q99P47 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cntnap4Q99P47 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cntnap4Q99P47 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cntnap4Q99P47 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cntnap4Q99P47 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cntnap4Q99P47 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cntnap4Q99P47 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Cntnap4Q99P47 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Cntnap4Q99P47 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Cntnap4Q99P47 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cntnap4Q99P47 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cntnap4Q99P47 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cntnap4Q99P47 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cntnap4Q99P47 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cntnap4Q99P47 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cntnap4Q99P47 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cntnap4Q99P47 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cntnap4Q99P47 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cntnap4Q99P47 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cntnap4Q99P47 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cntnap4Q99P47 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cntnap4Q99P47 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cntnap4Q99P47 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms