Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gps1Q99LD4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gps1Q99LD4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gps1Q99LD4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gps1Q99LD4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gps1Q99LD4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Gps1Q99LD4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Gps1Q99LD4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gps1Q99LD4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gps1Q99LD4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gps1Q99LD4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gps1Q99LD4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gps1Q99LD4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gps1Q99LD4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gps1Q99LD4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gps1Q99LD4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gps1Q99LD4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gps1Q99LD4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gps1Q99LD4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Gps1Q99LD4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gps1Q99LD4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gps1Q99LD4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gps1Q99LD4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gps1Q99LD4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gps1Q99LD4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gps1Q99LD4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gps1Q99LD4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gps1Q99LD4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gps1Q99LD4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Gps1Q99LD4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gps1Q99LD4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gps1Q99LD4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gps1Q99LD4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gps1Q99LD4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gps1Q99LD4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gps1Q99LD4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gps1Q99LD4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gps1Q99LD4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gps1Q99LD4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gps1Q99LD4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Gps1Q99LD4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gps1Q99LD4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gps1Q99LD4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Gps1Q99LD4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Gps1Q99LD4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gps1Q99LD4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gps1Q99LD4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gps1Q99LD4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gps1Q99LD4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gps1Q99LD4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gps1Q99LD4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gps1Q99LD4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gps1Q99LD4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gps1Q99LD4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gps1Q99LD4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gps1Q99LD4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gps1Q99LD4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gps1Q99LD4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gps1Q99LD4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gps1Q99LD4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gps1Q99LD4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gps1Q99LD4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gps1Q99LD4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gps1Q99LD4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gps1Q99LD4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gps1Q99LD4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gps1Q99LD4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gps1Q99LD4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Gps1Q99LD4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gps1Q99LD4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gps1Q99LD4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Gps1Q99LD4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gps1Q99LD4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gps1Q99LD4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gps1Q99LD4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gps1Q99LD4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gps1Q99LD4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gps1Q99LD4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gps1Q99LD4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Gps1Q99LD4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gps1Q99LD4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gps1Q99LD4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gps1Q99LD4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gps1Q99LD4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gps1Q99LD4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gps1Q99LD4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gps1Q99LD4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gps1Q99LD4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Gps1Q99LD4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gps1Q99LD4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gps1Q99LD4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gps1Q99LD4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gps1Q99LD4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gps1Q99LD4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gps1Q99LD4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gps1Q99LD4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gps1Q99LD4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gps1Q99LD4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gps1Q99LD4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gps1Q99LD4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms