Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Csmd1Q923L3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Csmd1Q923L3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Csmd1Q923L3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Csmd1Q923L3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Csmd1Q923L3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Csmd1Q923L3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Csmd1Q923L3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Csmd1Q923L3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Csmd1Q923L3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Csmd1Q923L3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Csmd1Q923L3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Csmd1Q923L3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Csmd1Q923L3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Csmd1Q923L3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Csmd1Q923L3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Csmd1Q923L3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Csmd1Q923L3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Csmd1Q923L3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Csmd1Q923L3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csmd1Q923L3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csmd1Q923L3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csmd1Q923L3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csmd1Q923L3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csmd1Q923L3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csmd1Q923L3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Csmd1Q923L3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Csmd1Q923L3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csmd1Q923L3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csmd1Q923L3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Csmd1Q923L3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Csmd1Q923L3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Csmd1Q923L3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csmd1Q923L3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csmd1Q923L3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csmd1Q923L3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csmd1Q923L3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csmd1Q923L3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csmd1Q923L3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csmd1Q923L3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csmd1Q923L3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csmd1Q923L3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csmd1Q923L3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Csmd1Q923L3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Csmd1Q923L3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Csmd1Q923L3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Csmd1Q923L3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Csmd1Q923L3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Csmd1Q923L3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Csmd1Q923L3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Csmd1Q923L3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Csmd1Q923L3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Csmd1Q923L3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Csmd1Q923L3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Csmd1Q923L3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Csmd1Q923L3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Csmd1Q923L3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Csmd1Q923L3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Csmd1Q923L3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Csmd1Q923L3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Csmd1Q923L3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Csmd1Q923L3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Csmd1Q923L3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Csmd1Q923L3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Csmd1Q923L3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Csmd1Q923L3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Csmd1Q923L3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Csmd1Q923L3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Csmd1Q923L3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Csmd1Q923L3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Csmd1Q923L3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Csmd1Q923L3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Csmd1Q923L3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Csmd1Q923L3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Csmd1Q923L3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Csmd1Q923L3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Csmd1Q923L3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Csmd1Q923L3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Csmd1Q923L3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Csmd1Q923L3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Csmd1Q923L3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Csmd1Q923L3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Csmd1Q923L3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Csmd1Q923L3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Csmd1Q923L3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Csmd1Q923L3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csmd1Q923L3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csmd1Q923L3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csmd1Q923L3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csmd1Q923L3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Csmd1Q923L3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Csmd1Q923L3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Csmd1Q923L3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Csmd1Q923L3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Csmd1Q923L3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Csmd1Q923L3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Csmd1Q923L3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Csmd1Q923L3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Csmd1Q923L3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Csmd1Q923L3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms