Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE09

Ttc39c, Tetratricopeptide repeat protein 39C, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39cQ8VE09 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ttc39cQ8VE09 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ttc39cQ8VE09 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ttc39cQ8VE09 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ttc39cQ8VE09 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ttc39cQ8VE09 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ttc39cQ8VE09 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ttc39cQ8VE09 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ttc39cQ8VE09 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ttc39cQ8VE09 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ttc39cQ8VE09 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ttc39cQ8VE09 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ttc39cQ8VE09 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ttc39cQ8VE09 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ttc39cQ8VE09 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ttc39cQ8VE09 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ttc39cQ8VE09 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ttc39cQ8VE09 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ttc39cQ8VE09 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ttc39cQ8VE09 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ttc39cQ8VE09 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Ttc39cQ8VE09 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Ttc39cQ8VE09 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ttc39cQ8VE09 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ttc39cQ8VE09 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ttc39cQ8VE09 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ttc39cQ8VE09 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ttc39cQ8VE09 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ttc39cQ8VE09 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ttc39cQ8VE09 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ttc39cQ8VE09 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ttc39cQ8VE09 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ttc39cQ8VE09 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ttc39cQ8VE09 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ttc39cQ8VE09 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ttc39cQ8VE09 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ttc39cQ8VE09 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ttc39cQ8VE09 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ttc39cQ8VE09 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ttc39cQ8VE09 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ttc39cQ8VE09 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ttc39cQ8VE09 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ttc39cQ8VE09 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ttc39cQ8VE09 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ttc39cQ8VE09 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ttc39cQ8VE09 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ttc39cQ8VE09 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ttc39cQ8VE09 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ttc39cQ8VE09 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ttc39cQ8VE09 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ttc39cQ8VE09 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ttc39cQ8VE09 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ttc39cQ8VE09 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ttc39cQ8VE09 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ttc39cQ8VE09 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ttc39cQ8VE09 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ttc39cQ8VE09 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ttc39cQ8VE09 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ttc39cQ8VE09 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ttc39cQ8VE09 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ttc39cQ8VE09 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ttc39cQ8VE09 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ttc39cQ8VE09 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ttc39cQ8VE09 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ttc39cQ8VE09 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ttc39cQ8VE09 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ttc39cQ8VE09 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ttc39cQ8VE09 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ttc39cQ8VE09 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ttc39cQ8VE09 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ttc39cQ8VE09 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ttc39cQ8VE09 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ttc39cQ8VE09 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ttc39cQ8VE09 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttc39cQ8VE09 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttc39cQ8VE09 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ttc39cQ8VE09 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ttc39cQ8VE09 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ttc39cQ8VE09 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ttc39cQ8VE09 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ttc39cQ8VE09 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ttc39cQ8VE09 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ttc39cQ8VE09 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ttc39cQ8VE09 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ttc39cQ8VE09 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ttc39cQ8VE09 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ttc39cQ8VE09 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ttc39cQ8VE09 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ttc39cQ8VE09 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ttc39cQ8VE09 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ttc39cQ8VE09 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ttc39cQ8VE09 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ttc39cQ8VE09 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ttc39cQ8VE09 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ttc39cQ8VE09 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ttc39cQ8VE09 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ttc39cQ8VE09 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ttc39cQ8VE09 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ttc39cQ8VE09 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ttc39cQ8VE09 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
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