Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2I1

Fntb, Protein farnesyltransferase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FntbQ8K2I1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FntbQ8K2I1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FntbQ8K2I1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
FntbQ8K2I1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FntbQ8K2I1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FntbQ8K2I1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FntbQ8K2I1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
FntbQ8K2I1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FntbQ8K2I1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FntbQ8K2I1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
FntbQ8K2I1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FntbQ8K2I1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FntbQ8K2I1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FntbQ8K2I1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FntbQ8K2I1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FntbQ8K2I1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FntbQ8K2I1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FntbQ8K2I1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FntbQ8K2I1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FntbQ8K2I1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
FntbQ8K2I1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
FntbQ8K2I1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FntbQ8K2I1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FntbQ8K2I1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FntbQ8K2I1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FntbQ8K2I1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FntbQ8K2I1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
FntbQ8K2I1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FntbQ8K2I1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FntbQ8K2I1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
FntbQ8K2I1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FntbQ8K2I1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FntbQ8K2I1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FntbQ8K2I1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FntbQ8K2I1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FntbQ8K2I1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FntbQ8K2I1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FntbQ8K2I1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FntbQ8K2I1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FntbQ8K2I1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FntbQ8K2I1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FntbQ8K2I1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FntbQ8K2I1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FntbQ8K2I1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FntbQ8K2I1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FntbQ8K2I1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FntbQ8K2I1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FntbQ8K2I1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FntbQ8K2I1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FntbQ8K2I1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FntbQ8K2I1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FntbQ8K2I1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FntbQ8K2I1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FntbQ8K2I1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FntbQ8K2I1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FntbQ8K2I1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FntbQ8K2I1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FntbQ8K2I1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FntbQ8K2I1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FntbQ8K2I1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FntbQ8K2I1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FntbQ8K2I1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FntbQ8K2I1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FntbQ8K2I1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FntbQ8K2I1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FntbQ8K2I1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FntbQ8K2I1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FntbQ8K2I1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FntbQ8K2I1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FntbQ8K2I1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FntbQ8K2I1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FntbQ8K2I1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FntbQ8K2I1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FntbQ8K2I1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FntbQ8K2I1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FntbQ8K2I1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FntbQ8K2I1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FntbQ8K2I1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FntbQ8K2I1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FntbQ8K2I1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FntbQ8K2I1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FntbQ8K2I1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FntbQ8K2I1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FntbQ8K2I1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FntbQ8K2I1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FntbQ8K2I1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FntbQ8K2I1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FntbQ8K2I1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
FntbQ8K2I1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FntbQ8K2I1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FntbQ8K2I1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FntbQ8K2I1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FntbQ8K2I1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FntbQ8K2I1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FntbQ8K2I1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FntbQ8K2I1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FntbQ8K2I1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FntbQ8K2I1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FntbQ8K2I1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FntbQ8K2I1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.7 ms