Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E3

Slc5a11, Sodium/myo-inositol cotransporter 2, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a11Q8K0E3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc5a11Q8K0E3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc5a11Q8K0E3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc5a11Q8K0E3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc5a11Q8K0E3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc5a11Q8K0E3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slc5a11Q8K0E3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc5a11Q8K0E3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc5a11Q8K0E3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc5a11Q8K0E3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc5a11Q8K0E3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc5a11Q8K0E3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc5a11Q8K0E3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc5a11Q8K0E3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc5a11Q8K0E3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc5a11Q8K0E3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc5a11Q8K0E3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc5a11Q8K0E3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc5a11Q8K0E3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc5a11Q8K0E3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc5a11Q8K0E3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc5a11Q8K0E3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc5a11Q8K0E3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc5a11Q8K0E3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc5a11Q8K0E3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc5a11Q8K0E3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc5a11Q8K0E3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc5a11Q8K0E3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc5a11Q8K0E3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc5a11Q8K0E3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc5a11Q8K0E3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc5a11Q8K0E3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc5a11Q8K0E3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc5a11Q8K0E3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc5a11Q8K0E3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc5a11Q8K0E3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc5a11Q8K0E3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc5a11Q8K0E3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc5a11Q8K0E3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc5a11Q8K0E3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc5a11Q8K0E3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc5a11Q8K0E3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc5a11Q8K0E3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc5a11Q8K0E3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc5a11Q8K0E3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc5a11Q8K0E3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc5a11Q8K0E3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc5a11Q8K0E3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc5a11Q8K0E3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc5a11Q8K0E3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc5a11Q8K0E3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc5a11Q8K0E3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc5a11Q8K0E3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc5a11Q8K0E3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc5a11Q8K0E3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc5a11Q8K0E3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc5a11Q8K0E3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc5a11Q8K0E3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc5a11Q8K0E3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc5a11Q8K0E3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc5a11Q8K0E3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slc5a11Q8K0E3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc5a11Q8K0E3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc5a11Q8K0E3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc5a11Q8K0E3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc5a11Q8K0E3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc5a11Q8K0E3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc5a11Q8K0E3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc5a11Q8K0E3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc5a11Q8K0E3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc5a11Q8K0E3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc5a11Q8K0E3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc5a11Q8K0E3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc5a11Q8K0E3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc5a11Q8K0E3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc5a11Q8K0E3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc5a11Q8K0E3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc5a11Q8K0E3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc5a11Q8K0E3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc5a11Q8K0E3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc5a11Q8K0E3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc5a11Q8K0E3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc5a11Q8K0E3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc5a11Q8K0E3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc5a11Q8K0E3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc5a11Q8K0E3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc5a11Q8K0E3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc5a11Q8K0E3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc5a11Q8K0E3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc5a11Q8K0E3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc5a11Q8K0E3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc5a11Q8K0E3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc5a11Q8K0E3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc5a11Q8K0E3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc5a11Q8K0E3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc5a11Q8K0E3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc5a11Q8K0E3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc5a11Q8K0E3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc5a11Q8K0E3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc5a11Q8K0E3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms