Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rasgef1bQ8JZL7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rasgef1bQ8JZL7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rasgef1bQ8JZL7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rasgef1bQ8JZL7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rasgef1bQ8JZL7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rasgef1bQ8JZL7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rasgef1bQ8JZL7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rasgef1bQ8JZL7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rasgef1bQ8JZL7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rasgef1bQ8JZL7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rasgef1bQ8JZL7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rasgef1bQ8JZL7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rasgef1bQ8JZL7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rasgef1bQ8JZL7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rasgef1bQ8JZL7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rasgef1bQ8JZL7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rasgef1bQ8JZL7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rasgef1bQ8JZL7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rasgef1bQ8JZL7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rasgef1bQ8JZL7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rasgef1bQ8JZL7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rasgef1bQ8JZL7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rasgef1bQ8JZL7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rasgef1bQ8JZL7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rasgef1bQ8JZL7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rasgef1bQ8JZL7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rasgef1bQ8JZL7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rasgef1bQ8JZL7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rasgef1bQ8JZL7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rasgef1bQ8JZL7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rasgef1bQ8JZL7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rasgef1bQ8JZL7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rasgef1bQ8JZL7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rasgef1bQ8JZL7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rasgef1bQ8JZL7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rasgef1bQ8JZL7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rasgef1bQ8JZL7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rasgef1bQ8JZL7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rasgef1bQ8JZL7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rasgef1bQ8JZL7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rasgef1bQ8JZL7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rasgef1bQ8JZL7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rasgef1bQ8JZL7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rasgef1bQ8JZL7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rasgef1bQ8JZL7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rasgef1bQ8JZL7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rasgef1bQ8JZL7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rasgef1bQ8JZL7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rasgef1bQ8JZL7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rasgef1bQ8JZL7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rasgef1bQ8JZL7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rasgef1bQ8JZL7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rasgef1bQ8JZL7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rasgef1bQ8JZL7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rasgef1bQ8JZL7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rasgef1bQ8JZL7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rasgef1bQ8JZL7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rasgef1bQ8JZL7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rasgef1bQ8JZL7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rasgef1bQ8JZL7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rasgef1bQ8JZL7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rasgef1bQ8JZL7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rasgef1bQ8JZL7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rasgef1bQ8JZL7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rasgef1bQ8JZL7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rasgef1bQ8JZL7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rasgef1bQ8JZL7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rasgef1bQ8JZL7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rasgef1bQ8JZL7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Rasgef1bQ8JZL7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rasgef1bQ8JZL7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rasgef1bQ8JZL7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rasgef1bQ8JZL7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rasgef1bQ8JZL7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rasgef1bQ8JZL7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rasgef1bQ8JZL7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rasgef1bQ8JZL7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rasgef1bQ8JZL7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rasgef1bQ8JZL7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rasgef1bQ8JZL7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rasgef1bQ8JZL7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Rasgef1bQ8JZL7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rasgef1bQ8JZL7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rasgef1bQ8JZL7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rasgef1bQ8JZL7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rasgef1bQ8JZL7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rasgef1bQ8JZL7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rasgef1bQ8JZL7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rasgef1bQ8JZL7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rasgef1bQ8JZL7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rasgef1bQ8JZL7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rasgef1bQ8JZL7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rasgef1bQ8JZL7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rasgef1bQ8JZL7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rasgef1bQ8JZL7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms