Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trip10Q8CJ53 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trip10Q8CJ53 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trip10Q8CJ53 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trip10Q8CJ53 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Trip10Q8CJ53 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trip10Q8CJ53 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trip10Q8CJ53 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trip10Q8CJ53 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trip10Q8CJ53 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trip10Q8CJ53 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trip10Q8CJ53 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trip10Q8CJ53 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trip10Q8CJ53 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trip10Q8CJ53 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trip10Q8CJ53 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trip10Q8CJ53 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trip10Q8CJ53 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trip10Q8CJ53 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trip10Q8CJ53 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trip10Q8CJ53 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trip10Q8CJ53 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Trip10Q8CJ53 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trip10Q8CJ53 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trip10Q8CJ53 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trip10Q8CJ53 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trip10Q8CJ53 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trip10Q8CJ53 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trip10Q8CJ53 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trip10Q8CJ53 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trip10Q8CJ53 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trip10Q8CJ53 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trip10Q8CJ53 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trip10Q8CJ53 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Trip10Q8CJ53 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trip10Q8CJ53 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trip10Q8CJ53 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trip10Q8CJ53 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trip10Q8CJ53 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trip10Q8CJ53 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trip10Q8CJ53 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trip10Q8CJ53 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trip10Q8CJ53 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trip10Q8CJ53 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trip10Q8CJ53 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trip10Q8CJ53 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trip10Q8CJ53 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trip10Q8CJ53 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trip10Q8CJ53 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trip10Q8CJ53 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Trip10Q8CJ53 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trip10Q8CJ53 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trip10Q8CJ53 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trip10Q8CJ53 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trip10Q8CJ53 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trip10Q8CJ53 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trip10Q8CJ53 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trip10Q8CJ53 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trip10Q8CJ53 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trip10Q8CJ53 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trip10Q8CJ53 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trip10Q8CJ53 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trip10Q8CJ53 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trip10Q8CJ53 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trip10Q8CJ53 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trip10Q8CJ53 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trip10Q8CJ53 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trip10Q8CJ53 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trip10Q8CJ53 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trip10Q8CJ53 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trip10Q8CJ53 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trip10Q8CJ53 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trip10Q8CJ53 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trip10Q8CJ53 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trip10Q8CJ53 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trip10Q8CJ53 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trip10Q8CJ53 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Trip10Q8CJ53 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trip10Q8CJ53 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trip10Q8CJ53 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trip10Q8CJ53 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trip10Q8CJ53 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trip10Q8CJ53 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trip10Q8CJ53 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trip10Q8CJ53 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trip10Q8CJ53 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Trip10Q8CJ53 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trip10Q8CJ53 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trip10Q8CJ53 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trip10Q8CJ53 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trip10Q8CJ53 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trip10Q8CJ53 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trip10Q8CJ53 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trip10Q8CJ53 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trip10Q8CJ53 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trip10Q8CJ53 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trip10Q8CJ53 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Trip10Q8CJ53 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trip10Q8CJ53 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trip10Q8CJ53 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms