Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ73

Rspo4, R-spondin-4, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo4Q8BJ73 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rspo4Q8BJ73 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rspo4Q8BJ73 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rspo4Q8BJ73 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rspo4Q8BJ73 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rspo4Q8BJ73 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rspo4Q8BJ73 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rspo4Q8BJ73 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rspo4Q8BJ73 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rspo4Q8BJ73 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rspo4Q8BJ73 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rspo4Q8BJ73 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rspo4Q8BJ73 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rspo4Q8BJ73 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rspo4Q8BJ73 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rspo4Q8BJ73 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rspo4Q8BJ73 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rspo4Q8BJ73 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rspo4Q8BJ73 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rspo4Q8BJ73 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rspo4Q8BJ73 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rspo4Q8BJ73 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rspo4Q8BJ73 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Rspo4Q8BJ73 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rspo4Q8BJ73 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rspo4Q8BJ73 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rspo4Q8BJ73 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rspo4Q8BJ73 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rspo4Q8BJ73 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rspo4Q8BJ73 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rspo4Q8BJ73 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rspo4Q8BJ73 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rspo4Q8BJ73 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rspo4Q8BJ73 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rspo4Q8BJ73 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rspo4Q8BJ73 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rspo4Q8BJ73 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rspo4Q8BJ73 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rspo4Q8BJ73 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rspo4Q8BJ73 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rspo4Q8BJ73 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rspo4Q8BJ73 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rspo4Q8BJ73 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Rspo4Q8BJ73 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rspo4Q8BJ73 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rspo4Q8BJ73 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rspo4Q8BJ73 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rspo4Q8BJ73 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rspo4Q8BJ73 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rspo4Q8BJ73 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rspo4Q8BJ73 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rspo4Q8BJ73 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rspo4Q8BJ73 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rspo4Q8BJ73 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rspo4Q8BJ73 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rspo4Q8BJ73 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rspo4Q8BJ73 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rspo4Q8BJ73 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rspo4Q8BJ73 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rspo4Q8BJ73 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rspo4Q8BJ73 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rspo4Q8BJ73 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rspo4Q8BJ73 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rspo4Q8BJ73 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rspo4Q8BJ73 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rspo4Q8BJ73 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rspo4Q8BJ73 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rspo4Q8BJ73 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rspo4Q8BJ73 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rspo4Q8BJ73 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rspo4Q8BJ73 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rspo4Q8BJ73 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rspo4Q8BJ73 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rspo4Q8BJ73 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rspo4Q8BJ73 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rspo4Q8BJ73 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rspo4Q8BJ73 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rspo4Q8BJ73 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rspo4Q8BJ73 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rspo4Q8BJ73 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rspo4Q8BJ73 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rspo4Q8BJ73 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rspo4Q8BJ73 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rspo4Q8BJ73 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rspo4Q8BJ73 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rspo4Q8BJ73 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rspo4Q8BJ73 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rspo4Q8BJ73 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rspo4Q8BJ73 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rspo4Q8BJ73 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rspo4Q8BJ73 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rspo4Q8BJ73 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rspo4Q8BJ73 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rspo4Q8BJ73 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rspo4Q8BJ73 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rspo4Q8BJ73 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Rspo4Q8BJ73 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rspo4Q8BJ73 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rspo4Q8BJ73 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rspo4Q8BJ73 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms